基因總覽
RNU6-1 是人類的非編碼 RNA 基因，正式名稱為 RNA, U6 small nuclear 1。依名稱與來源所列的預測功能，它屬於 U6 small nuclear RNA，與 U6 snRNP 及由多種小核核糖核蛋白構成的剪接體複合體相關。現有資料未提供此 RNA 的序列、結構或其他分子特徵，因此不宜據此補述其結構細節。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000383898 ★ | 67,839,939–67,840,045 | 1 |
顯示 1/1 個RNA轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
RNU6-1 的功能資料以預測性描述為主。來源預測其 RNA 可能具有結合 U4 snRNA 的能力；這項結合功能尚不能視為已確認的實驗結果。
來源也預測 RNU6-1 可能參與 quadruple SL/U4/U5/U6 snRNP 的形成，以及剪接體 tri-snRNP 複合體的組裝。這些描述指出它可能與含 U4、U5、U6 等成分的核糖核蛋白複合體形成過程相關，但並未提供具體組裝步驟或作用機制。
此外，RNU6-1 被預測為 U4/U6 x U5 tri-snRNP complex 與 U6 snRNP 的組成部分。上述複合體關聯與功能均為預測，來源未列出其實驗條件、直接證據或對剪接結果的測量，因此不應進一步推定其作用效果。
Promoter 與基因調控
>RNU6-1 ENST00000383898 GRCh38 chr15:67839945-67841045 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GGAAAGCGGAGGCTGCACTTGTGGTCTCAAATCTTTTCCAAACTCCACTGCGTAAAAAAAAAAAAAAAAA AAAAAAAAAAAAGTCTTTGAAACCAGACTCGCATCCAAATCCCAACTACTTTAACCAGTGGCAGGATCAC TGGAGCAGATGGTTTAACCTCCCAGAGCCTGTTTGCTAAACTGCAAAATGGGGGAAATGATACCATTTAG GTTAAGCGCCTGGCTCTTTCTAAATGTTGGCTCAAACGGTGGTGACCCTTCCCAGACTTCCACCACTACT GGAAGTTTGCGTCCCAAAGCAGACACCCTCATCGCCTTGGCTCCGAATGCAGAGAGCTAGTTCCGAGAAG CCGAGGGGAAGCTGAAGGCGCGCCCTGGCCAACCCTCCCCACGATCCCCCGCCGCAACCCCTGTCGGCCC CTTCCAGCCCACAGTGGGTGGCCCCAGGCCTCGCTAGGGTCACGTCTCTCGGGTCCCCGCGCAGGGAAGG GTCCAACCAGCGACTCGCAACCTTTTCGGGGTCCCGAGTCCAACACCCGTGGGAATCCCATGGGCACCAT GGCCCCTCGCTCCAAAAATGCTTTCGCGTCGCGCAGACACTGCTCGGTAGTTTCGGGGATCAGCGTTTGA GTAAGAGCCCGCGTCTGAACCCTCCGCGCCGCCCCGGCCCCAGTGGAAAGACGCGCAGGCAAAACGCACC ACGTGACGGAGCGTGACCGCGCGCCGAGCGCGCGCCAAGGTCGGGCAGGAAGAGGGCCTATTTCCCATGA TTCCTTCATATTTGCATATACGATACAAGGCTGTTAGAGAGATAATTAGAATTAATTTGACTGTAAACAC AAAGATATTAGTACAAAATACGTGACGTAGAAAGTAATAATTTCTTGGGTAGTTTGCAGTTTTAAAATTA TGTTTTAAAATGGACTATCATATGCTTACCGTAACTTGAAAGTATTTCGATTTCTTGGCTTTATATATCT TGTGGAAAGGACGAAACACCGTGCTCGCTTCGGCAGCACATATACTAAAATTGGAACGATACAGAGAAGA TTAGCATGGCCCCTGCGCAAGGATGACACGCAAATTCGTGAAGCGTTCCAT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄；不代表此基因沒有 promoter。
EPDnewNC human v001 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR15_5KXRR6 · CTCF_binding_site · 67836557–67836578 · regulatory
ENSR15_5KXRTW · CTCF_binding_site · 67837143–67837164 · regulatory
ENSR15_9ZX28 · enhancer · 67838462–67838868 · regulatory
ENSR15_BHGHN · promoter · 67838869–67839583 · regulatory
ENSR15_D5CTP · enhancer · 67839584–67841727 · regulatory
ENSR15_5KXSH2 · CTCF_binding_site · 67840625–67840646 · regulatory
ENSR15_C8PQN · enhancer · 67843204–67844328 · regulatory
· motif · 67835248–67835264 · motif
· motif · 67836559–67836575 · motif
· motif · 67836850–67836872 · motif
· motif · 67836850–67836872 · motif
· motif · 67836990–67837005 · motif
· motif · 67837145–67837161 · motif
· motif · 67839182–67839197 · motif
· motif · 67839182–67839197 · motif
· motif · 67839977–67839988 · motif
· motif · 67840256–67840269 · motif
· motif · 67840312–67840328 · motif
· motif · 67840312–67840328 · motif
· motif · 67840328–67840344 · motif
· motif · 67840339–67840348 · motif
· motif · 67840339–67840348 · motif
· motif · 67840489–67840502 · motif
· motif · 67840489–67840502 · motif
· motif · 67840500–67840513 · motif
· motif · 67840500–67840513 · motif
· motif · 67840627–67840643 · motif
· motif · 67841114–67841136 · motif
· motif · 67841114–67841136 · motif
RNA 轉錄本與序列
RNU6-1 依 HGNC／Ensembl 分類為 Non-coding RNA。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000383898 ★ | snRNA | 107 nt | 1 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總，單位為 nt；不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
RNA 細胞內定位
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | RNU6-1 的相關功能均為預測：可能具有結合 U4 snRNA 的能力，可能參與 quadruple SL/U4/U5/U6 snRNP 的形成及剪接體 tri-snRNP 複合體組裝，並被預測為 U4/U6 x U5 tri-snRNP complex 與 U6 snRNP 的一部分。 | 推論支持 | 證據與來源Predicted to enable U4 snRNA binding activity. Predicted to be involved in formation of quadruple SL/U4/U5/U6 snRNP and spliceosomal tri-snRNP complex assembly. Predicted to be part of U4/U6 x U5 tri-snRNP complex and U6 snRNP. · CC BY 4.0 |
DNA 與 RNA 序列
GTGCTCGCTTCGGCAGCACATATACTAAAATTGGAACGAT40ACAGAGAAGATTAGCATGGCCCCTGCGCAAGGATGACACG80CAAATTCGTGAAGCGTTCCATATTTTT107cDNA 使用 DNA 字母 T；RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。