基因總覽
RNU5E-1 的正式名稱為 RNA, U5E small nuclear 1，屬於非編碼 RNA。其名稱標示它是 U5E small nuclear RNA；現有資料未提供其序列、長度或更詳細的結構特徵。資料將其與 U5 snRNP 及 U4/U6 × U5 tri-snRNP 複合體的組成和組裝相關聯，但這些關聯屬於預測，不能據此視為已確認的分子作用。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000362477 ★ | 11,908,152–11,908,272 | 1 |
顯示 1/1 個RNA轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
現有資料預測，RNU5E-1 可能參與 quadruple SL/U4/U5/U6 snRNP 的形成，以及剪接體 tri-snRNP 複合體的組裝。這些描述指出它可能與多種剪接相關核糖核蛋白複合體的形成過程有關，但資料未提供其具體分子作用方式或實驗驗證細節，因此不能將預測解讀為已證實的功能。
資料亦預測 RNU5E-1 可能是 U4/U6 × U5 tri-snRNP 複合體與 U5 snRNP 的一部分。這表示它可能與這些複合體的組成相關；不過，來源未說明其在複合體中的具體位置、作用機制或對剪接結果的影響。上述功能與複合體關係均應保留為預測。
Promoter 與基因調控
>RNU5E-1 ENST00000362477 GRCh38 chr1:11907152-11908252 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CCGCGCCCGGCCAGGAAACCTCCTCTCTGCCCTCGGTTTCTGTGAGGCTCCCAGTCCAGGTTTTCCTCCT GCCTCCCTCAATTTCTCTAATCTCTTTCATAGGCTCCTGCACTGTCCCCTCCTTTTATGCCACCATCCCC CAGGGACCTTCCTTGGCCTTTTCTCTCCTCATTTCACAGCCTTTCCCAGGCCTTCCCCTGCTCAGCCAGT AATCTGTCTCCCAAACTCCTCACTCTCCATATTTCAGGCACAACAGTTGCCAACAGAGGTTCTCAATGTG GCCTCCATCAGAATCACACGGAGGATGAGTTCAGACTCAGGGGGCTGGGCCCAATCCCCAGGCCTGCAGT AGGTCTGGAGTGGCTAGAAGTGTAAGAATTTTTTTTTGGAGACACGCTCTCGTTATGTTGCCCAGGCTGG TCTTGAACCCCTAGTTCAGGCGATCAGCCTGCCTCAGCCACCCAAAGTGCTGGGATTACAAGGGTGAGCC ACGGAGTCCAGCCAAGATAATTTTTTTTTTACTTTTTTTTTTAAGTTCAAAAAAATTCTTTACTTATTAG GCTAATTGTGCAATTAAAAAAAAAAAAAAATTGCAAAAACCGCAATTACTTTTGCACCGATCTAATAGCT CGCCCACTGTAAGTAAAGCAGGTAAAGTCAGCCTTTTTCTTCTGGGACCAGACTCTGCTCTGCCCCGCGG TGGTGGCCTCAGGCGCAGCGCTAAAACGCATGAACCATTTAAGGTATTTCCTGAAACTGGAGCGTGATTG GTGAGACTTTATTTGCATACCCACAATGCATTGCGCACTAAATAATGTTCGTCTTTAAAATTATTTCCCC TTTTTCCTTCAACATATCTTTCTCGGAACCGAGATTGCTGTCCCAGAATTGTCTGAAGAAAAAGGCTGAA GTCAATAGCTCTTTTGGGCCGAAGGAAAGTTACCATTACCCGTTTAGGAGTAGCCGTTACCTGAGAACTG TAGTGTCGACGACTGATGTTATACTCTGGTTTCTCTTCAAATCGTATAAATCTTTCGCCTTTTACTAAAG ATTTCCGTGGAGAGAAACGAGTGTGAGTCTGAAACCAATTTTTTGAGGCCT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄；不代表此基因沒有 promoter。
EPDnewNC human v001 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR1_B4CRQ · promoter · 11907450–11908162 · regulatory
ENSR1_DKXQ · enhancer · 11908163–11910411 · regulatory
ENSR1_96PMD · enhancer · 11910570–11910911 · regulatory
· motif · 11904664–11904676 · motif
· motif · 11904719–11904731 · motif
· motif · 11905774–11905785 · motif
· motif · 11905774–11905785 · motif
· motif · 11905774–11905787 · motif
· motif · 11907739–11907756 · motif
· motif · 11907748–11907756 · motif
· motif · 11907929–11907942 · motif
· motif · 11908881–11908894 · motif
· motif · 11908881–11908894 · motif
· motif · 11909004–11909015 · motif
· motif · 11909177–11909184 · motif
· motif · 11909262–11909274 · motif
· motif · 11909264–11909271 · motif
· motif · 11909264–11909279 · motif
· motif · 11909644–11909655 · motif
· motif · 11909994–11910005 · motif
· motif · 11910139–11910152 · motif
· motif · 11911652–11911664 · motif
· motif · 11911656–11911669 · motif
· motif · 11911659–11911671 · motif
· motif · 11911860–11911875 · motif
· motif · 11911875–11911887 · motif
· motif · 11911877–11911884 · motif
RNA 轉錄本與序列
RNU5E-1 依 HGNC／Ensembl 分類為 Non-coding RNA。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000362477 ★ | snRNA | 121 nt | 1 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總，單位為 nt；不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
RNA 細胞內定位
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | 資料預測 RNU5E-1 可能參與 quadruple SL/U4/U5/U6 snRNP 的形成及剪接體 tri-snRNP 複合體組裝，也可能是 U4/U6 × U5 tri-snRNP 複合體與 U5 snRNP 的一部分；這些均屬預測。 | 推論支持 | 證據與來源Predicted to be involved in formation of quadruple SL/U4/U5/U6 snRNP and spliceosomal tri-snRNP complex assembly. Predicted to be part of U4/U6 x U5 tri-snRNP complex and U5 snRNP. · CC BY 4.0 |
DNA 與 RNA 序列
ATACTCTGGTTTCTCTTCAAATCGTATAAATCTTTCGCCT40TTTACTAAAGATTTCCGTGGAGAGAAACGAGTGTGAGTCT80GAAACCAATTTTTTGAGGCCTTGCGTTTCTTAGCAGGGCT120T121cDNA 使用 DNA 字母 T；RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。