基因總覽
RNU4-1 的正式名稱為 RNA, U4 small nuclear 1，屬於非編碼 RNA。依目前資料，這個基因的 RNA 產物與 U4 snRNP 及 U4/U6 x U5 tri-snRNP 複合體相關；它並非蛋白質編碼基因，因此不以蛋白質家族或胺基酸結構描述。資料並未提供其序列、二級結構或其他結構特徵的細節。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000363925 ★ | 120,293,093–120,293,237 | 1 |
顯示 1/1 個RNA轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
RNU4-1 的功能註釋目前帶有預測性質：資料預測其 RNA 可與 U6 snRNA 結合，並參與剪接體相關複合體的形成與組裝。這些描述指出可能的分子作用及複合體關聯，但未提供直接驗證或作用細節，因此不能視為已確立的機制。
在複合體層面，RNU4-1 被預測為 U4 snRNP 的一部分，也可能是 U4/U6 x U5 tri-snRNP 複合體的組成成員。資料亦預測它參與 quadruple SL/U4/U5/U6 snRNP 的形成，以及 spliceosomal tri-snRNP complex 的組裝。換言之，現有註釋將其可能角色連結到含 U4、U6、U5 的核糖核蛋白複合體，以及相關組裝過程；來源未進一步說明各步驟的先後關係或分子細節。
由於上述內容均為預測，資料尚不足以判定 RNU4-1 如何促進複合體形成、其與 U6 snRNA 結合的條件，或這些複合體組裝對剪接活動造成的具體影響。
Promoter 與基因調控
>RNU4-1 ENST00000363925 GRCh38 chr12:120293137-120294237 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CAGATCACGTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAATCCTGTCTCTACTAAAAAT ACAAAGAGTGGTGGCATGCATCTGTAATCCCAGCTACTTGAGAGATGGAGGCAGGAGAATCGCTTGAATC CGGGAGGCAGTGGTTGCAATGAGCCGAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCAAAAAC TCCATCTCAAAAAAAAAAAAAGATAACATCTCATACAGTGAAATATTATTCAGCCATAAAATTAATGAAT TCCTGATATATACTACAACATGGATGAACCTTAAAAACATTATTCTGAATGAAATAAGACTGACCTCAAG GACAAATATTGTATGATTCCATTTATATATATATAAAGTACTCACAAAGTCATAGAGATAGAAAGTAGAA AAGAGGTTGCCACGGGGGCTGGAGGAGAAGGGAACAGGGAGTAAGGGTTTAATGGGTACAGAGTCTCAGT TTCCACCCTTGGGCATGAAAGATAAAGTTCTGGAGGTAAGTAGTGATGATGGTTACACAACAATGTGAAC ATATTCTATGCCAGTGAATTTACACTTAAGGTTAAAATGGTAAATTTTATGTATACTTTGGCATAATTTA AAAAAAAGTTTGAAAAAGAAAAAAGACAAAACAATAATCGTCTTTGGAGAAGTCTGTTACACTGAATCTG GAGCCAAGTGAACAGAACCCTGATTTTGATCCCTTTTCTCTCAAAAGCCCTTCGCAGTCTCTGAATTAAG TCTATTAGCATGTTCCTCCCATAGTGCTTTGCTTCATATCAACAAAAACCTAGCTAAGTGAAATCAGCAA CGATATGCAGAAACCACCTACGCAGGTCACAAACATCTTTCTATGATTGTATAATTTTCAAGCAAGCAAT AAGTGAAGATTTTTCCATAGGCCCTAAACTCACCTTTGCGAAATAGGAAGCTGGTTTATTGGGAGTGATG AGCAGGGGGCGTAACAAATTAGCTTTGCGCAGTGGCAGTATCGTAGCCAATGAGGTCTATCCGAGGCGCG ATTATTGCTAATTGAAAACTTTTCCCAATACCCCGCCGTGACGACTTGCAA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄；不代表此基因沒有 promoter。
EPDnewNC human v001 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR12_93QQ5C · enhancer · 120290511–120290902 · regulatory
ENSR12_93QQ5Q · promoter · 120291903–120292403 · regulatory
ENSR12_BTTKG · enhancer · 120292404–120293226 · regulatory
ENSR12_93QQ65 · promoter · 120293227–120293727 · regulatory
· motif · 120290679–120290688 · motif
· motif · 120291407–120291422 · motif
· motif · 120291534–120291547 · motif
· motif · 120291813–120291823 · motif
· motif · 120291923–120291933 · motif
· motif · 120292099–120292112 · motif
· motif · 120292099–120292112 · motif
· motif · 120292122–120292135 · motif
· motif · 120292135–120292148 · motif
· motif · 120292135–120292148 · motif
· motif · 120292245–120292259 · motif
· motif · 120292245–120292259 · motif
· motif · 120292283–120292296 · motif
· motif · 120292283–120292296 · motif
· motif · 120292377–120292392 · motif
· motif · 120292383–120292395 · motif
· motif · 120292385–120292392 · motif
· motif · 120292385–120292400 · motif
· motif · 120292950–120292959 · motif
· motif · 120292981–120292994 · motif
· motif · 120293044–120293057 · motif
· motif · 120293243–120293253 · motif
· motif · 120293687–120293696 · motif
RNA 轉錄本與序列
RNU4-1 依 HGNC／Ensembl 分類為 Non-coding RNA。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000363925 ★ | snRNA | 145 nt | 1 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總，單位為 nt；不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
RNA 細胞內定位
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | RNU4-1 預測具有與 U6 snRNA 結合的能力，也可能參與 quadruple SL/U4/U5/U6 snRNP 的形成及剪接體 tri-snRNP 複合體的組裝。它並預測為 U4 snRNP 與 U4/U6 x U5 tri-snRNP 複合體的一部分；這些描述屬預測性註釋。 | 推論支持 | 證據與來源Predicted to enable U6 snRNA binding activity. Predicted to be involved in formation of quadruple SL/U4/U5/U6 snRNP and spliceosomal tri-snRNP complex assembly. Predicted to be part of U4 snRNP and U4/U6 x U5 tri-snRNP complex. · CC BY 4.0 |
DNA 與 RNA 序列
AGCTTTGCGCAGTGGCAGTATCGTAGCCAATGAGGTCTAT40CCGAGGCGCGATTATTGCTAATTGAAAACTTTTCCCAATA80CCCCGCCGTGACGACTTGCAATATAGTCGGCACTGGCAAT120TTTTGACAGTCTCTACGGAGACTGA145cDNA 使用 DNA 字母 T；RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。