基因總覽
RNA, ribosomal 45S cluster 2(RNR2)是人類第 14 號染色體上的 45S rDNA 簇,屬非編碼 RNA 位點。人類 45S rDNA 簇分布於第 13、14、15、21 與 22 號染色體;RNR2 是其中位於第 14 號染色體的簇。每個簇由多個 45S rDNA 重複單元構成,重複單元數會因個體與染色體而異。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
帶型資料未取得,未套用其他染色體的條紋或著絲點位置。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
RNR2 所代表的 45S rDNA 簇包含多個重複單元,這些單元可轉錄生成 45S rRNA 前驅物。轉錄由 RNA polymerase I 負責;其後,前驅物經加工形成 18S、5.8S 與 28S rRNA。這條由轉錄至加工的途徑,說明該基因簇提供多種成熟核糖體 RNA 的共同前驅來源。
RefSeq 與 HGNC 合作整理人類這五個染色體定位的 45S rDNA 位點時,對每條染色體各描述一個 45S rDNA 簇,以及一組 45S 前驅與其產物 rRNA。這是資料整理上的位點描述;來源並未據此表示每個染色體上的簇只含一個 rDNA 重複單元。來源估計,人類二倍體基因組中的 45S rDNA 重複單元總數約為 60 至超過 800 個,且數量會隨個體與染色體變動。
Promoter 與基因調控
RNA 轉錄本與序列
RNR2 依 HGNC/Ensembl 分類為 Non-coding RNA。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| 尚未取得轉錄本資料。 | |||
拼接長度由已註解 exon 長度加總,單位為 nt;不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
RNA 細胞內定位
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | 人類 45S rDNA 簇位於第 13、14、15、21 與 22 號染色體,各簇含數量可變的重複單元;二倍體基因組總數估計約為 60 至超過 800 個。重複單元由 RNA polymerase I 轉錄為 45S rRNA 前驅物,經加工形成 18S、5.8S 與 28S rRNA;RNR2 對應第 14 號染色體上的簇。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源45S ribosomal DNA (rDNA) arrays, or clusters, are present on human chromosomes 13, 14, 15, 21 and 22, designated RNR1 through RNR5, respectively. Each cluster consists of multiple 45S rDNA repeat units that vary in number among individuals and chromosomes, with total diploid copy number estimates ranging from 60 to >800 repeat units in a human genome. The 45S rDNA repeat unit encodes a 45S rRNA precursor, transcribed by RNA polymerase I, which is processed to form the 18S, 5.8S and 28S rRNAs. Gene and RefSeq, in collaboration with HGNC, currently describe one 45S rDNA cluster, and one set of 45S precursor and product rRNAs, for each of the five human chromosomes to which these loci are localized. This gene represents the 45S ribosomal DNA cluster on chromosome 14. |
DNA 與 RNA 序列
cDNA 使用 DNA 字母 T;RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。