演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

RNPEPAPB

arginyl aminopeptidase

RNPEP 編碼 arginyl aminopeptidase,屬於 peptidase M1 家族,可從多種胜肽的 N 端移除特定胺基酸。

Homo sapiens1q32.1UniProt Q9H4A4
OFFICIAL SYMBOL
RNPEP
CHROMOSOME
1
UNIPROT
Q9H4A4
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

RNPEP 是蛋白質編碼基因,其產物為 arginyl aminopeptidase,歸屬於 peptidase M1 家族。這種蛋白質具有胺基胜肽酶活性,能處理胜肽底物;來源亦指出其每個次單元可結合一個鋅離子。現有資料將其描述為一種選擇性作用於胜肽 N 端的酵素,並列出數種相關底物。其具體底物條件與反應例子另於功能段說明。

Official symbol
RNPEP
Gene name
arginyl aminopeptidase
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10078
UniProt
Q9H4A4
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
APB

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 11q32.1
chr1 · 248,956,422 bp · GRCh38chr1p36.33 · 1–2300000 · gnegchr1p36.32 · 2300001–5300000 · gpos25chr1p36.31 · 5300001–7100000 · gnegchr1p36.23 · 7100001–9100000 · gpos25chr1p36.22 · 9100001–12500000 · gnegchr1p36.21 · 12500001–15900000 · gpos50chr1p36.13 · 15900001–20100000 · gnegchr1p36.12 · 20100001–23600000 · gpos25chr1p36.11 · 23600001–27600000 · gnegchr1p35.3 · 27600001–29900000 · gpos25chr1p35.2 · 29900001–32300000 · gnegchr1p35.1 · 32300001–34300000 · gpos25chr1p34.3 · 34300001–39600000 · gnegchr1p34.2 · 39600001–43700000 · gpos25chr1p34.1 · 43700001–46300000 · gnegchr1p33 · 46300001–50200000 · gpos75chr1p32.3 · 50200001–55600000 · gnegchr1p32.2 · 55600001–58500000 · gpos50chr1p32.1 · 58500001–60800000 · gnegchr1p31.3 · 60800001–68500000 · gpos50chr1p31.2 · 68500001–69300000 · gnegchr1p31.1 · 69300001–84400000 · gpos100chr1p22.3 · 84400001–87900000 · gnegchr1p22.2 · 87900001–91500000 · gpos75chr1p22.1 · 91500001–94300000 · gnegchr1p21.3 · 94300001–99300000 · gpos75chr1p21.2 · 99300001–101800000 · gnegchr1p21.1 · 101800001–106700000 · gpos100chr1p13.3 · 106700001–111200000 · gnegchr1p13.2 · 111200001–115500000 · gpos50chr1p13.1 · 115500001–117200000 · gnegchr1p12 · 117200001–120400000 · gpos50chr1p11.2 · 120400001–121700000 · gnegchr1p11.1 · 121700001–123400000 · acenchr1q11 · 123400001–125100000 · acenchr1q12 · 125100001–143200000 · gvarchr1q21.1 · 143200001–147500000 · gnegchr1q21.2 · 147500001–150600000 · gpos50chr1q21.3 · 150600001–155100000 · gnegchr1q22 · 155100001–156600000 · gpos50chr1q23.1 · 156600001–159100000 · gnegchr1q23.2 · 159100001–160500000 · gpos50chr1q23.3 · 160500001–165500000 · gnegchr1q24.1 · 165500001–167200000 · gpos50chr1q24.2 · 167200001–170900000 · gnegchr1q24.3 · 170900001–173000000 · gpos75chr1q25.1 · 173000001–176100000 · gnegchr1q25.2 · 176100001–180300000 · gpos50chr1q25.3 · 180300001–185800000 · gnegchr1q31.1 · 185800001–190800000 · gpos100chr1q31.2 · 190800001–193800000 · gnegchr1q31.3 · 193800001–198700000 · gpos100chr1q32.1 · 198700001–207100000 · gnegchr1q32.2 · 207100001–211300000 · gpos25chr1q32.3 · 211300001–214400000 · gnegchr1q41 · 214400001–223900000 · gpos100chr1q42.11 · 223900001–224400000 · gnegchr1q42.12 · 224400001–226800000 · gpos25chr1q42.13 · 226800001–230500000 · gnegchr1q42.2 · 230500001–234600000 · gpos50chr1q42.3 · 234600001–236400000 · gnegchr1q43 · 236400001–243500000 · gpos75chr1q44 · 243500001–248956422 · gnegRNPEPpq1 bp248,956,422 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr1:201,982,372–202,006,175
Gene span
23,804 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000295640 ★201,982,648–202,006,14311
ENST00000367286201,982,603–202,006,14710
ENST00000857426201,982,603–202,006,1479
ENST00000857427201,982,603–202,006,1479
ENST00000857428201,982,603–202,006,1479
ENST00000857429201,982,603–202,006,14710
ENST00000857430201,982,603–202,006,14710
ENST00000857431201,982,603–202,006,14710
ENST00000934090201,982,603–202,006,1476
ENST00000967255201,982,603–202,006,14711
ENST00001113581201,982,603–202,000,7316
ENST00001113582201,982,603–201,998,2155

顯示 12/17 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

arginyl aminopeptidase 可從寡胜肽的 N 端移除精胺酸(Arg)或離胺酸(Lys)。此作用受底物序列條件限制:當 P1' 位置不是脯胺酸(Pro)時,酵素可釋出 N 端的 Arg 或 Lys;若底物是 Arg 或 Lys 的芳香醯胺,也可作為作用對象。資料列舉的胜肽底物包括 Arg(0)-Leu-enkephalin、Arg(0)-Met-enkephalin,以及 Arg(-1)-Lys(0)-somatostatin-14,顯示其可作用於不同胜肽中的 N 端鹼性胺基酸殘基。

除了胜肽底物,arginyl aminopeptidase 也被描述為可將 leukotriene A4(LTA-4)水解為 leukotriene B4(LTB-4)。這項反應註明為 By similarity,屬於相似性推論,並非此處提供的直接實驗證據,因此不宜視為已由這些資料確立的實驗結果。

每個蛋白質次單元可結合一個鋅離子;現有資料未進一步說明鋅離子在催化中的具體作用。整體而言,來源支持其參與 N 端 Arg/Lys 的移除,且底物能否被處理與局部序列條件有關;目前提供的內容未描述更廣泛的生理作用或下游效應。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 201982648 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>RNPEP ENST00000295640 GRCh38 chr1:201981648-201982748 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CAGAAAAGCAGGTTTCTAAGGTTTCTGGAGTTAAACAAAAAACCCTGACATTGAACTTACATGGAATATT
AAAGTCATTATCTACCATAAGCATTATTTCATGAAATAAAATAATTTCAACTCTACAAAACTAGGAAGCA
CAGAACGGAATACTATTTCCCTTAATGAAAAACTCCCTACATTGTTCTTTTTAAAAATCTCATTTCCTAG
CTGAACGGTAAAAACATCATCATTGATTAGCTCCTATTCATAGAAGGCCCATTGCAACCCACTGGTACAG
AAGAGAAACAAAGTATTCAGCGGAGAATACCCTAGCTCAATAAGCGGTACAATACAGTAAGGGAAATAGA
AGTGACATGCGATGGACAGCCAGGCCTTAAATTGCGCGGTGCTGATTCCTGTCCCTTAACCCAACAATAG
AAAGATAGGCGTGCCTGGAGTTGCTGGGGGACGAGGCTCGATCCAGTGTGAATTCCGTGAAGTTGTGCAG
GGTTTCACTGTTTGCTGAGTGTGTTAGACAGGTTACCTGGTAGAGTTCTCACATTACTTCGTGAGATACA
CAGATATTATGACTCTATTATACTGGTGCAGAAAAAGGCTCGGGAAGATTCATGTTTCTTGTGCGACTTG
CCCAAGGTGACACACAGTTCTAACAACTGGCCTATCGCAGGGTGTGAGATCTGGAACTCAGACCTTCCCA
GCCAGGGCTCAGTCCACGCCACTGCCTAGATGAGGCAGCAGGAAGGGTCAGCAGAGAAGGGTGCCCCACC
GGGACGACTGGAACACCTCAGTAGGATATGGGTGGGCAAACGTGGGCCACACGATCCCACCGGCCTCTTT
TGTCCTAAGTCCCGAGGCACGGGTGCAGCTAGAAGAGTGGGCGGTAAAGCGCAGGGAGGGGATGCGGTCG
GGAGCAGATTTCGGGGGCGGGGCCCGCGCGGCGGGGGCGGGCCCGCGGCGCTCGGGGCGGGGCTCCCCTC
GGGTTCGCGGCCCGGCCGGTGAGCAACGGCTCTGCGGCCATGGCGAGCGGCGAGCATTCCCCCGGCAGCG
GCGCGGCCCGGCGGCCGCTGCACTCCGCGCAGGCTGTGGACGTGGCCTCGG
RNPEP 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
RNPEP_1 ↗1:201,982,648正股201,982,599–201,982,658

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR1_94Z6KZ · promoter · 201982158–201982662 · regulatory

ENSR1_53QHPJZ · CTCF_binding_site · 201982884–201982905 · regulatory

ENSR1_53QHPKS · CTCF_binding_site · 201983065–201983086 · regulatory

ENSR1_53QHPLN · CTCF_binding_site · 201983251–201983272 · regulatory

ENSR1_53QHPM3 · CTCF_binding_site · 201983327–201983348 · regulatory

ENSR1_94Z6MC · enhancer · 201987045–201987308 · regulatory

· motif · 201982316–201982328 · motif

· motif · 201982389–201982401 · motif

· motif · 201982519–201982532 · motif

· motif · 201982565–201982578 · motif

· motif · 201982585–201982598 · motif

· motif · 201982754–201982763 · motif

· motif · 201982754–201982765 · motif

· motif · 201982754–201982765 · motif

· motif · 201982782–201982791 · motif

· motif · 201982886–201982902 · motif

· motif · 201983067–201983083 · motif

· motif · 201983073–201983082 · motif

· motif · 201983153–201983162 · motif

· motif · 201983253–201983269 · motif

· motif · 201983329–201983345 · motif

· motif · 201983362–201983373 · motif

· motif · 201983362–201983373 · motif

· motif · 201984075–201984090 · motif

· motif · 201984638–201984652 · motif

· motif · 201984638–201984652 · motif

· motif · 201984645–201984656 · motif

· motif · 201987014–201987026 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:650 aa

arginyl aminopeptidase 屬於 peptidase M1 家族。

07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9H4A4…

AlphaFold · Q9H4A4

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。細胞外定位以細胞周圍、與細胞膜保持距離的圓點表示。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Secreted

arginyl aminopeptidase 被記載為分泌型蛋白質;所提供資料未說明其分泌條件或定位變化。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
APBRNPEP
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

目前未取得此類註解。
10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能arginyl aminopeptidase 可選擇性移除多種胜肽 N 端的精胺酸或離胺酸,列出的底物包括 Arg(0)-Leu-enkephalin、Arg(0)-Met-enkephalin 與 Arg(-1)-Lys(0)-somatostatin-14。此外,資料以相似性推論指出,該酵素可能將 leukotriene A4(LTA-4)水解為 leukotriene B4(LTB-4)。推論支持
證據與來源

Exopeptidase which selectively removes arginine and/or lysine residues from the N-terminus of several peptide substrates including Arg(0)-Leu-enkephalin, Arg(0)-Met-enkephalin and Arg(-1)-Lys(0)-somatostatin-14. Can hydrolyze leukotriene A4 (LTA-4) into leukotriene B4 (LTB-4) (By similarity)

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性arginyl aminopeptidase 可由寡胜肽 N 端釋出精胺酸與離胺酸,但條件是 P1' 位置不是脯胺酸(Pro)。除了寡胜肽外,精胺酸與離胺酸的芳香醯胺也可作為其作用底物。資料庫紀錄
證據與來源

Release of N-terminal Arg and Lys from oligopeptides when P1' is not Pro. Also acts on arylamides of Arg and Lys.

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性每個蛋白質次單元可結合一個鋅離子;此項描述未進一步指出鋅離子的結合位置或其在酵素作用中的具體功能。資料庫紀錄
證據與來源

Binds 1 zinc ion per subunit.

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位Secreted推論支持
證據與來源

Secreted

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000295640 · 2,399 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GAGCAACGGCTCTGCGGCCATGGCGAGCGGCGAGCATTCC40
41CCCGGCAGCGGCGCGGCCCGGCGGCCGCTGCACTCCGCGC80
81AGGCTGTGGACGTGGCCTCGGCCTCCAACTTCCGGGCCTT120
121TGAGCTGCTGCACTTGCACCTGGACCTGCGGGCTGAGTTC160
161GGGCCTCCAGGGCCCGGCGCAGGGAGCCGGGGGCTGAGCG200
201GCACCGCGGTCCTGGACCTGCGCTGCCTGGAGCCCGAGGG240
241CGCCGCCGAGCTGCGGCTGGACTCGCACCCGTGCCTGGAG280
281GTGACGGCGGCGGCGCTGCGGCGGGAGCGGCCCGGCTCGG320
321AGGAGCCGCCTGCGGAGCCCGTGAGCTTCTACACGCAGCC360
361CTTCTCGCACTATGGCCAGGCCCTGTGCGTGTCCTTCCCG400
401CAGCCCTGCCGCGCCGCCGAGCGCCTCCAGGTGCTGCTCA440
441CCTACCGCGTCGGGGAGGGACCCGGGGTTTGCTGGTTGGC480
481TCCCGAGCAGACAGCAGGAAAGAAGAAGCCCTTCGTGTAC520
521ACCCAGGGCCAGGCTGTCCTAAACCGGGCCTTCTTCCCTT560
561GCTTCGACACGCCTGCTGTTAAATACAAGTATTCAGCTCT600
601TATTGAGGTCCCAGATGGCTTCACAGCTGTGATGAGTGCT640
641AGCACCTGGGAGAAGAGAGGTCCAAATAAGTTCTTCTTCC680
681AGATGTGTCAGCCCATCCCCTCCTATCTGATAGCTTTGGC720
721CATCGGAGATCTGGTTTCGGCTGAAGTTGGACCCAGGAGC760
761CGGGTGTGGGCTGAGCCCTGCCTGATTGATGCTGCCAAGG800
801AGGAGTACAACGGGGTGATAGAAGAATTTTTGGCAACAGG840
841AGAGAAGCTTTTTGGACCTTATGTTTGGGGAAGGTATGAC880
881TTGCTCTTCATGCCACCGTCCTTTCCATTTGGAGGAATGG920
921AGAACCCTTGTCTGACCTTTGTCACCCCCTGCCTGCTAGC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。