基因總覽
RNPEP 是蛋白質編碼基因,其產物為 arginyl aminopeptidase,歸屬於 peptidase M1 家族。這種蛋白質具有胺基胜肽酶活性,能處理胜肽底物;來源亦指出其每個次單元可結合一個鋅離子。現有資料將其描述為一種選擇性作用於胜肽 N 端的酵素,並列出數種相關底物。其具體底物條件與反應例子另於功能段說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000295640 ★ | 201,982,648–202,006,143 | 11 |
| ENST00000367286 | 201,982,603–202,006,147 | 10 |
| ENST00000857426 | 201,982,603–202,006,147 | 9 |
| ENST00000857427 | 201,982,603–202,006,147 | 9 |
| ENST00000857428 | 201,982,603–202,006,147 | 9 |
| ENST00000857429 | 201,982,603–202,006,147 | 10 |
| ENST00000857430 | 201,982,603–202,006,147 | 10 |
| ENST00000857431 | 201,982,603–202,006,147 | 10 |
| ENST00000934090 | 201,982,603–202,006,147 | 6 |
| ENST00000967255 | 201,982,603–202,006,147 | 11 |
| ENST00001113581 | 201,982,603–202,000,731 | 6 |
| ENST00001113582 | 201,982,603–201,998,215 | 5 |
顯示 12/17 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
arginyl aminopeptidase 可從寡胜肽的 N 端移除精胺酸(Arg)或離胺酸(Lys)。此作用受底物序列條件限制:當 P1' 位置不是脯胺酸(Pro)時,酵素可釋出 N 端的 Arg 或 Lys;若底物是 Arg 或 Lys 的芳香醯胺,也可作為作用對象。資料列舉的胜肽底物包括 Arg(0)-Leu-enkephalin、Arg(0)-Met-enkephalin,以及 Arg(-1)-Lys(0)-somatostatin-14,顯示其可作用於不同胜肽中的 N 端鹼性胺基酸殘基。
除了胜肽底物,arginyl aminopeptidase 也被描述為可將 leukotriene A4(LTA-4)水解為 leukotriene B4(LTB-4)。這項反應註明為 By similarity,屬於相似性推論,並非此處提供的直接實驗證據,因此不宜視為已由這些資料確立的實驗結果。
每個蛋白質次單元可結合一個鋅離子;現有資料未進一步說明鋅離子在催化中的具體作用。整體而言,來源支持其參與 N 端 Arg/Lys 的移除,且底物能否被處理與局部序列條件有關;目前提供的內容未描述更廣泛的生理作用或下游效應。
Promoter 與基因調控
>RNPEP ENST00000295640 GRCh38 chr1:201981648-201982748 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CAGAAAAGCAGGTTTCTAAGGTTTCTGGAGTTAAACAAAAAACCCTGACATTGAACTTACATGGAATATT AAAGTCATTATCTACCATAAGCATTATTTCATGAAATAAAATAATTTCAACTCTACAAAACTAGGAAGCA CAGAACGGAATACTATTTCCCTTAATGAAAAACTCCCTACATTGTTCTTTTTAAAAATCTCATTTCCTAG CTGAACGGTAAAAACATCATCATTGATTAGCTCCTATTCATAGAAGGCCCATTGCAACCCACTGGTACAG AAGAGAAACAAAGTATTCAGCGGAGAATACCCTAGCTCAATAAGCGGTACAATACAGTAAGGGAAATAGA AGTGACATGCGATGGACAGCCAGGCCTTAAATTGCGCGGTGCTGATTCCTGTCCCTTAACCCAACAATAG AAAGATAGGCGTGCCTGGAGTTGCTGGGGGACGAGGCTCGATCCAGTGTGAATTCCGTGAAGTTGTGCAG GGTTTCACTGTTTGCTGAGTGTGTTAGACAGGTTACCTGGTAGAGTTCTCACATTACTTCGTGAGATACA CAGATATTATGACTCTATTATACTGGTGCAGAAAAAGGCTCGGGAAGATTCATGTTTCTTGTGCGACTTG CCCAAGGTGACACACAGTTCTAACAACTGGCCTATCGCAGGGTGTGAGATCTGGAACTCAGACCTTCCCA GCCAGGGCTCAGTCCACGCCACTGCCTAGATGAGGCAGCAGGAAGGGTCAGCAGAGAAGGGTGCCCCACC GGGACGACTGGAACACCTCAGTAGGATATGGGTGGGCAAACGTGGGCCACACGATCCCACCGGCCTCTTT TGTCCTAAGTCCCGAGGCACGGGTGCAGCTAGAAGAGTGGGCGGTAAAGCGCAGGGAGGGGATGCGGTCG GGAGCAGATTTCGGGGGCGGGGCCCGCGCGGCGGGGGCGGGCCCGCGGCGCTCGGGGCGGGGCTCCCCTC GGGTTCGCGGCCCGGCCGGTGAGCAACGGCTCTGCGGCCATGGCGAGCGGCGAGCATTCCCCCGGCAGCG GCGCGGCCCGGCGGCCGCTGCACTCCGCGCAGGCTGTGGACGTGGCCTCGG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| RNPEP_1 ↗ | 1:201,982,648 | 正股 | 201,982,599–201,982,658 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR1_94Z6KZ · promoter · 201982158–201982662 · regulatory
ENSR1_53QHPJZ · CTCF_binding_site · 201982884–201982905 · regulatory
ENSR1_53QHPKS · CTCF_binding_site · 201983065–201983086 · regulatory
ENSR1_53QHPLN · CTCF_binding_site · 201983251–201983272 · regulatory
ENSR1_53QHPM3 · CTCF_binding_site · 201983327–201983348 · regulatory
ENSR1_94Z6MC · enhancer · 201987045–201987308 · regulatory
· motif · 201982316–201982328 · motif
· motif · 201982389–201982401 · motif
· motif · 201982519–201982532 · motif
· motif · 201982565–201982578 · motif
· motif · 201982585–201982598 · motif
· motif · 201982754–201982763 · motif
· motif · 201982754–201982765 · motif
· motif · 201982754–201982765 · motif
· motif · 201982782–201982791 · motif
· motif · 201982886–201982902 · motif
· motif · 201983067–201983083 · motif
· motif · 201983073–201983082 · motif
· motif · 201983153–201983162 · motif
· motif · 201983253–201983269 · motif
· motif · 201983329–201983345 · motif
· motif · 201983362–201983373 · motif
· motif · 201983362–201983373 · motif
· motif · 201984075–201984090 · motif
· motif · 201984638–201984652 · motif
· motif · 201984638–201984652 · motif
· motif · 201984645–201984656 · motif
· motif · 201987014–201987026 · motif
蛋白質結構域與序列
蛋白質三維結構
細胞內定位
arginyl aminopeptidase 被記載為分泌型蛋白質;所提供資料未說明其分泌條件或定位變化。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | arginyl aminopeptidase 可選擇性移除多種胜肽 N 端的精胺酸或離胺酸,列出的底物包括 Arg(0)-Leu-enkephalin、Arg(0)-Met-enkephalin 與 Arg(-1)-Lys(0)-somatostatin-14。此外,資料以相似性推論指出,該酵素可能將 leukotriene A4(LTA-4)水解為 leukotriene B4(LTB-4)。 | 推論支持 | 證據與來源Exopeptidase which selectively removes arginine and/or lysine residues from the N-terminus of several peptide substrates including Arg(0)-Leu-enkephalin, Arg(0)-Met-enkephalin and Arg(-1)-Lys(0)-somatostatin-14. Can hydrolyze leukotriene A4 (LTA-4) into leukotriene B4 (LTB-4) (By similarity) |
| 分子活性 | arginyl aminopeptidase 可由寡胜肽 N 端釋出精胺酸與離胺酸,但條件是 P1' 位置不是脯胺酸(Pro)。除了寡胜肽外,精胺酸與離胺酸的芳香醯胺也可作為其作用底物。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Release of N-terminal Arg and Lys from oligopeptides when P1' is not Pro. Also acts on arylamides of Arg and Lys. |
| 分子活性 | 每個蛋白質次單元可結合一個鋅離子;此項描述未進一步指出鋅離子的結合位置或其在酵素作用中的具體功能。 | 資料庫紀錄 | |
| 細胞定位 | Secreted | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
GAGCAACGGCTCTGCGGCCATGGCGAGCGGCGAGCATTCC40CCCGGCAGCGGCGCGGCCCGGCGGCCGCTGCACTCCGCGC80AGGCTGTGGACGTGGCCTCGGCCTCCAACTTCCGGGCCTT120TGAGCTGCTGCACTTGCACCTGGACCTGCGGGCTGAGTTC160GGGCCTCCAGGGCCCGGCGCAGGGAGCCGGGGGCTGAGCG200GCACCGCGGTCCTGGACCTGCGCTGCCTGGAGCCCGAGGG240CGCCGCCGAGCTGCGGCTGGACTCGCACCCGTGCCTGGAG280GTGACGGCGGCGGCGCTGCGGCGGGAGCGGCCCGGCTCGG320AGGAGCCGCCTGCGGAGCCCGTGAGCTTCTACACGCAGCC360CTTCTCGCACTATGGCCAGGCCCTGTGCGTGTCCTTCCCG400CAGCCCTGCCGCGCCGCCGAGCGCCTCCAGGTGCTGCTCA440CCTACCGCGTCGGGGAGGGACCCGGGGTTTGCTGGTTGGC480TCCCGAGCAGACAGCAGGAAAGAAGAAGCCCTTCGTGTAC520ACCCAGGGCCAGGCTGTCCTAAACCGGGCCTTCTTCCCTT560GCTTCGACACGCCTGCTGTTAAATACAAGTATTCAGCTCT600TATTGAGGTCCCAGATGGCTTCACAGCTGTGATGAGTGCT640AGCACCTGGGAGAAGAGAGGTCCAAATAAGTTCTTCTTCC680AGATGTGTCAGCCCATCCCCTCCTATCTGATAGCTTTGGC720CATCGGAGATCTGGTTTCGGCTGAAGTTGGACCCAGGAGC760CGGGTGTGGGCTGAGCCCTGCCTGATTGATGCTGCCAAGG800AGGAGTACAACGGGGTGATAGAAGAATTTTTGGCAACAGG840AGAGAAGCTTTTTGGACCTTATGTTTGGGGAAGGTATGAC880TTGCTCTTCATGCCACCGTCCTTTCCATTTGGAGGAATGG920AGAACCCTTGTCTGACCTTTGTCACCCCCTGCCTGCTAGC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。