演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

RNH1RAI

ribonuclease/angiogenin inhibitor 1

RNH1 編碼 ribonuclease/angiogenin inhibitor 1,是一種抑制 RNASE1、RNASE2 與 ANG 的蛋白質;在細胞受壓時會由細胞質移往細胞核。

Homo sapiens11p15.5UniProt P13489
OFFICIAL SYMBOL
RNH1
CHROMOSOME
11
UNIPROT
P13489
PDB / ALPHAFOLD
1Z7X
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

RNH1(ribonuclease/angiogenin inhibitor 1)是蛋白質編碼基因,其產物為 Ribonuclease inhibitor,也稱 Placental ribonuclease inhibitor。這種蛋白質屬於富含 leucine-rich repeat(LRR)的重複序列蛋白,序列中包含 15 個 LRR,並在 N 端附近具有兩組 S-L-D-I-Q 五胺基酸串聯重複。其名稱反映它與核糖核酸酶及 angiogenin 的抑制關係;來源亦指出它可能參與細胞氧化還原恆定。這些基本特徵界定了 RNH1 產物的分子身分與序列組成。

Official symbol
RNH1
Gene name
ribonuclease/angiogenin inhibitor 1
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10074
UniProt
P13489
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
RAIRNH

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1111p15.5
chr11 · 135,086,622 bp · GRCh38chr11p15.5 · 1–2800000 · gnegchr11p15.4 · 2800001–11700000 · gpos50chr11p15.3 · 11700001–13800000 · gnegchr11p15.2 · 13800001–16900000 · gpos50chr11p15.1 · 16900001–22000000 · gnegchr11p14.3 · 22000001–26200000 · gpos100chr11p14.2 · 26200001–27200000 · gnegchr11p14.1 · 27200001–31000000 · gpos75chr11p13 · 31000001–36400000 · gnegchr11p12 · 36400001–43400000 · gpos100chr11p11.2 · 43400001–48800000 · gnegchr11p11.12 · 48800001–51000000 · gpos75chr11p11.11 · 51000001–53400000 · acenchr11q11 · 53400001–55800000 · acenchr11q12.1 · 55800001–60100000 · gpos75chr11q12.2 · 60100001–61900000 · gnegchr11q12.3 · 61900001–63600000 · gpos25chr11q13.1 · 63600001–66100000 · gnegchr11q13.2 · 66100001–68700000 · gpos25chr11q13.3 · 68700001–70500000 · gnegchr11q13.4 · 70500001–75500000 · gpos50chr11q13.5 · 75500001–77400000 · gnegchr11q14.1 · 77400001–85900000 · gpos100chr11q14.2 · 85900001–88600000 · gnegchr11q14.3 · 88600001–93000000 · gpos100chr11q21 · 93000001–97400000 · gnegchr11q22.1 · 97400001–102300000 · gpos100chr11q22.2 · 102300001–103000000 · gnegchr11q22.3 · 103000001–110600000 · gpos100chr11q23.1 · 110600001–112700000 · gnegchr11q23.2 · 112700001–114600000 · gpos50chr11q23.3 · 114600001–121300000 · gnegchr11q24.1 · 121300001–124000000 · gpos50chr11q24.2 · 124000001–127900000 · gnegchr11q24.3 · 127900001–130900000 · gpos50chr11q25 · 130900001–135086622 · gnegRNH1pq1 bp135,086,622 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr11:494,510–507,395
Gene span
12,886 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000354420 ★494,515–507,24211
ENST00000903652494,510–506,87611
ENST00000903673494,510–504,77410
ENST00000903681494,510–502,42810
ENST00000903654494,511–506,87611
ENST00000903655494,511–506,87611
ENST00000972476494,511–507,30010
ENST00000972490494,511–506,79910
ENST00000534797494,512–503,5709
ENST00000903634494,512–507,30011
ENST00000903635494,512–507,30010
ENST00000903647494,512–507,30011

顯示 12/128 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

RNH1 產物是核糖核酸酶抑制因子,可抑制 RNASE1、RNASE2 與 angiogenin(ANG)。這項作用使它能調節這些核糖核酸酶的活性;來源並指出,RNH1 可能參與細胞氧化還原恆定,但對此功能的描述保留為可能性,未進一步界定其作用方式。

在沒有壓力的情況下,RNH1 位於細胞質,並被認為是抑制 ANG 細胞毒性 tRNA 核糖核酸酶活性所必需。這表示其作用不只是一般性地抑制核糖核酸酶,也涉及限制 ANG 在細胞質中的特定活性;來源將此條件限定於無壓力狀態。

細胞受到壓力時,RNH1 會移至細胞核。伴隨這項位置改變,它在細胞質中對 ANG 的抑制解除,而在細胞核中抑制 ANG 的血管新生活性。因此,RNH1 對 ANG 的調節方向與作用位置會隨壓力條件及細胞區室改變:無壓力時限制其細胞質中的細胞毒性 tRNA 核糖核酸酶活性,受壓時則抑制其細胞核中的血管新生活性。來源未進一步說明此轉位如何被觸發或調控。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 507242 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>RNH1 ENST00000354420 GRCh38 chr11:507142-508242 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AGCGAGCTGGGATCGCGCCACTGCAGTACAGCCTAAGCAGTGGAGTGAGACCCTGTCTCGAAAACAAATA
CCTAATAAAGGCAGTCAGAGGAGAGGTTTAGCAAATTGCTAAAGAACAAATCTGAGATACCGTTAGTTTC
CTTACTTGCAATCTTCATCTGCCAAAATGTCAATTCTGTGAATTGCGGACTAGTCAAAAACTTAAAGAAA
ACCCACTTTTGTGGAGGTGGGGTCGCTTTGCGTTTCCCAGGCTGGTCTGGAACTCGGCCTGCGCCCCTCA
GTGCCAGGGCTCCAGGCGACGCTCGGGTGTCGGCAGCAGAGTGGACGCAGGAGCAGCTCGGACCGCGCTC
AGAACACTCGGGACGAGGCCGCGGCTCCGCAGGCCTTGCGGGCTGGGGTCCCACGAAACAAAGGCGGCAG
CCAGTGGCCAGGACGGGCAGCGTGGTTCACGGGGCCGTGGCTCCCTCGGGGGTCGCGAGCTCGGCGCAAA
CGAGCCCCTCTACCAAGGTCGCCTAGAGTCGCGACCCCGACATGCGGAGCCGCCCCAGGGGGGTTTCTCC
CGGGTCCCTCCTGTCCCGAGGCGGCCGCTTTCTCCGGGGGCCGCGCCCCGCGCCCCAGCAAGGCCCGACC
CGCGCCTGCGATTCCGCCCCCAAGGCGCTGCCGCACCGGGCCCCGGCCTCTTCCTCCGAGGATTCTCAGG
AATTGCTGAGACTTGCGTGCCAGTGCGAGGCCCACAACACGCACACGCGCCCGCGCCCGCCAGACCCCGC
CCCCGGCACCAAGCCCCGCCTACTGGGGGAGACCACGCCCCCAAGCGAGACCTCCCTCACCGAGCCACGC
CCCACCAGGCCCCGCCGCTGCGCCAAGACTGTGCTTAGCCGAGCCCCGCCCGCCGGGCCCCGCCCCGACC
CCGAGACTACTCCCGCCAGGCCCCGCCCCCGCGCCGAGCCCCGCCCAGTAGTCCCCGCCCACGCACCTGA
CCACGCCCACGAGCCGGCTCGAACACGCCCGCGCCGCTGACTGGCGGGTGGGGTTGTCGACACGTTCAAC
CCGTTCTGCTGGCTCGAGAACGAAGTAGGCCGTCTCGCTCTGGGTCTCCAG
RNH1 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
RNH1_1 ↗11:506,768負股506,758–506,817
RNH1_2 ↗11:507,232負股507,222–507,281

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:461 aa

1 aa461 aa功能區域重複區
依 P13489 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

RNH1 產物長 461 個胺基酸,含有 15 個連續排列的 LRR 重複區,分布於胺基酸 20–447。另在胺基酸 2–11 註記有兩組 S-L-D-I-Q 五胺基酸串聯重複。

重複區LRR 120–48 aa
重複區LRR 249–76 aa
重複區LRR 377–105 aa
重複區LRR 4106–133 aa
重複區LRR 5134–162 aa
重複區LRR 6163–190 aa
重複區LRR 7191–219 aa
重複區LRR 8220–247 aa
重複區LRR 9248–276 aa
重複區LRR 10277–304 aa
重複區LRR 11305–333 aa
重複區LRR 12334–361 aa
重複區LRR 13362–390 aa
重複區LRR 14391–418 aa
重複區LRR 15419–447 aa
功能區域2 X 5 AA tandem repeats of S-L-D-I-Q2–11 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 1Z7X…

PDB · 1Z7X

X-ray · 1.95 A · W/Y=1-461

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm;Nucleus

RNH1 在無壓力時位於細胞質;受到壓力後會轉移至細胞核。 此描述涉及 RNH1 本身的位置變化,未提供不同異構型的定位差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 6 個夥伴 · 最多顯示 50 個
RAIRNH1ANGRNASE1RNASE7SDCBPWFS1RNASE1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 6 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

RNH1 可與 RNASE1、ANG 及 RNASE2 形成高親和力異源二聚體。此處描述的是複合體形成,來源未提供各互作的其他結構或細胞條件細節。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

RNH1 相關變異與感染誘發急性腦炎 12(IIAE12)的疾病易感性相關。此疾病為自體隱性,通常在嬰兒期或幼年早期發病,急性腦病可由病毒感染或發燒引發。急性發作的神經學表現包括癲癇、偏癱、意識降低、肌張力低下、姿勢異常、餵食問題及呼吸功能不全;嚴重程度不一,可能從死亡到神經學結果正常。來源描述的是易感性關聯,並未指出相關變異必然造成疾病。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能RNH1 是核糖核酸酶抑制因子,可抑制 RNASE1、RNASE2 與 ANG,並可能參與氧化還原恆定。無壓力時,它在細胞質中抑制 ANG 的細胞毒性 tRNA 核糖核酸酶活性;受到壓力時則移至細胞核,使細胞質中的 ANG 抑制解除,並在細胞核中抑制 ANG 的血管新生活性。含實驗來源
證據與來源

Ribonuclease inhibitor which inhibits RNASE1, RNASE2 and angiogenin (ANG). May play a role in redox homeostasis. Required to inhibit the cytotoxic tRNA ribonuclease activity of ANG in the cytoplasm in absence of stress. Relocates to the nucleus in response to stress, relieving inhibition of ANG in the cytoplasm, and inhibiting the angiogenic activity of ANG in the nucleus

PMID 12578357 ↗ · PMID 14515218 ↗ · PMID 17292889 ↗ · PMID 23843625 ↗ · PMID 3219362 ↗ · PMID 3243277 ↗ · PMID 32510170 ↗ · PMID 3470787 ↗ · PMID 9050852 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用RNH1 可分別與 RNASE1、ANG 及 RNASE2 形成高親和力異源二聚體。含實驗來源
證據與來源

Forms high-affinity heterodimers with RNASE1, ANG and RNASE2

PMID 15755456 ↗ · PMID 17350650 ↗ · PMID 9311977 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位RNH1 在無壓力時定位於細胞質;受到壓力時會轉移至細胞核。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm; Nucleus; Localizes in the cytoplasm in absence of stress; translocates to the nucleus in response to stress

PMID 23843625 ↗ · PMID 3219362 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯RNH1 相關變異與感染誘發急性腦炎 12(IIAE12)的易感性相關。此自體隱性疾病通常在嬰兒期或幼年早期出現,病毒感染或發燒可引發急性腦病;發作時可能有癲癇、偏癱、意識降低、肌張力低下、姿勢異常、餵食問題及呼吸功能不全,疾病嚴重程度可從死亡到神經學結果正常不等。含實驗來源
證據與來源

Encephalitis, acute, infection-induced, 12 IIAE12 An autosomal recessive disorder apparent in infancy or early childhood, and characterized by acute encephalopathy triggered by viral infections and febrile illness. Neurologic features of the acute episodes include seizures, hemiplegia, decreased consciousness, hypotonia, abnormal posturing, feeding problems, and respiratory insufficiency. Disease severity is variable, ranging from death to normal neurologic outcomes. Disease susceptibility is associated with variants affecting the gene represented in this entry MIM: 620461

PMID 36935417 ↗ · PMID 37191094 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000354420 · 1,952 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GAACACGCCCGCGCCGCTGACTGGCGGGTGGGGTTGTCGA40
41CACGTTCAACCCGTTCTGCTGGCTCGAGAACGAAGTAGGC80
81CGTCTCGCTCTGGGTCTCCAGGCCCGCGACCGTCCGCCAG120
121TCGTCCCGAGGCATGAAGAACTCTTGACTGACAGAAACGG160
161AGGGTGTGTCCAAAGTTTTGAGGACGGCCGAGCGGCGCTC200
201CAAAACCCGTCCTCACAGCCTCGCCCCGTTCGCCTCAGCT240
241ACAACAAATCATCGTCAACCTGTTCCACCTTCTCCAGTCT280
281GGTAGCAAAAAGGGGTGTCTCAGAATCTCCGGCCTGTGAA320
321ACTGTGAGGGGATTCGGCCAAGACGTCCTCTTCCCTCTGC360
361CTCCCACCCAGGCCACTCTTCACCTCCACCATGAGCCTGG400
401ACATCCAGAGCCTGGACATCCAGTGTGAGGAGCTGAGCGA440
441CGCTAGATGGGCCGAGCTCCTCCCTCTGCTCCAGCAGTGC480
481CAAGTGGTCAGGCTGGACGACTGTGGCCTCACGGAAGCAC520
521GGTGCAAGGACATCAGCTCTGCACTTCGAGTCAACCCTGC560
561ACTGGCAGAGCTCAACCTGCGCAGCAACGAGCTGGGCGAT600
601GTCGGCGTGCATTGCGTGCTCCAGGGCCTGCAGACCCCCT640
641CCTGCAAGATCCAGAAGCTGAGCCTCCAGAACTGCTGCCT680
681GACGGGGGCCGGCTGCGGGGTCCTGTCCAGCACACTACGC720
721ACCCTGCCCACCCTGCAGGAGCTGCACCTCAGCGACAACC760
761TCTTGGGGGATGCGGGCCTGCAGCTGCTCTGCGAAGGACT800
801CCTGGACCCCCAGTGCCGCCTGGAAAAGCTGCAGCTGGAG840
841TATTGCAGCCTCTCGGCTGCCAGCTGCGAGCCCCTGGCCT880
881CCGTGCTCAGGGCCAAGCCGGACTTCAAGGAGCTCACGGT920
921TAGCAACAACGACATCAATGAGGCTGGCGTCCGTGTGCTG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。