基因總覽
RN7SK 是人類非蛋白質編碼 RNA 基因，正式名稱為 RNA component of 7SK nuclear ribonucleoprotein。來源記錄的類型為 RNA, long non-coding。此基因座位於 6p12.2。目前可用來源提供名稱、分類與基因座資料，尚未提供可採用的功能敘述；功能與產物資訊依後續取得的來源註解補充。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000636484 ★ | 52,995,621–52,995,948 | 1 |
顯示 1/1 個RNA轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>RN7SK ENST00000636484 GRCh38 chr6:52994621-52995721 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GCAGGCGTTGAAGAGGGTAGCGAAGGAAAATCGCACAGCCACTGGAAGCTCTTCAAGTATTCATGCTTTT ACATACATCATCATATTTTATTATCACGGCAACTGGAAGGTGAACAGGCCGAGTACTACTACTGTCTGCA AAATGTGCGTCCACCGTCACGCATGCGGTGGCTGCGCCCCCCGGGTCCCGCGTGTCCACCACCCCTACAG GGAGATGAGCCCCCGGCCTTGTAAAACGAGCCGGGGGCCAGGGCTTGGCCATCTGAGATCGCACTCTCCC ATGCTCGTCTTCCCCGCTCAGCCCATGCAGGGGCGTAGCGGCAGCCCAGCCAGGCCCGGGGACGATCCGA GCCCACCTTCCACCAATGCATTCAGACTCCGCAGAAGGGGTTTAAAAAAAAATACGCACACTGAGCCAAG AAGGACCCCAGCTCCAGCCAAGGGGCCCACCTCTGCCCAGACTGGATGGAGCAGGAGGACAAAGGACAAG AGGAAGAAAAGACAAGAGAAGGACTGAACTGGGGGAGTGAGGGAAGAATGCGAGAGTGAGACTCAGAGAG TAAAGGGGAGGGAAAAAAAAGAAGAGAGAAAGGGCGAGGAAGGGGGCGACCGCAGGAGGGAGACAGACCT GGAGTCCACTCGGAGGCCTGGAGCCGCACAAAGCGCCAGGTCAGCGGTCCCGGCTGGGTGAGACCAGCAG GCGGCTCTAGCGCGCGGGAGCTGGGCGAGGCTCCGGGACGACCTCACCAATGGAGACTGCAGTATTTAGC ATGCCCCACCCATCTGCAAGGCATTCTGGATAGTGTCAAAACAGCCGGAAATCAAGTCCGTTTATCTCAA ACTTTAGCATTTTGGGAATAAATGATATTTGCTATGCTGGTTAAATTAGATTTTAGTTAAATTTCCTGCT GAAGCTCTAGTACGATAAGCAACTTGACCTAAGTGTAAAGTTGAGACTTCCTTCAGGTTTATATAGCTTG TGCGCCGCTTGGGTACCTCGGATGTGAGGGCGATCTGGCTGCGACATCTGTCACCCCATTGATCGCCAGG GTTGATTCGGCTGATCTGGCTGGCTAGGCGGGTGTCCCCTTCCTCCCTCAC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄；不代表此基因沒有 promoter。
EPDnewNC human v001 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR6_9R2TW · enhancer · 52990387–52990737 · regulatory
ENSR6_83K3SC · enhancer · 52993066–52993313 · regulatory
ENSR6_5GGJRJ · CTCF_binding_site · 52994196–52994217 · regulatory
ENSR6_9R2X4 · promoter · 52994393–52994893 · regulatory
ENSR6_BDHZ6 · promoter · 52995160–52995774 · regulatory
ENSR6_BDHZD · enhancer · 52996775–52997292 · regulatory
· motif · 52993183–52993192 · motif
· motif · 52994198–52994214 · motif
· motif · 52994415–52994425 · motif
· motif · 52995141–52995151 · motif
· motif · 52995271–52995288 · motif
· motif · 52995296–52995312 · motif
· motif · 52995393–52995403 · motif
· motif · 52995432–52995443 · motif
· motif · 52995434–52995443 · motif
· motif · 52995561–52995574 · motif
· motif · 52995641–52995654 · motif
· motif · 52995641–52995654 · motif
· motif · 52995649–52995660 · motif
· motif · 52995951–52995964 · motif
· motif · 52996155–52996166 · motif
· motif · 52996915–52996926 · motif
RNA 轉錄本與序列
RN7SK 依 HGNC／Ensembl 分類為 Non-coding RNA。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000636484 ★ | snRNA | 328 nt | 1 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總，單位為 nt；不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
RNA 細胞內定位
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
DNA 與 RNA 序列
GATGTGAGGGCGATCTGGCTGCGACATCTGTCACCCCATT40GATCGCCAGGGTTGATTCGGCTGATCTGGCTGGCTAGGCG80GGTGTCCCCTTCCTCCCTCACCGCTCCATGTGCGTCCCTC120CCGAAGCTGCGCGCTCGGTCGAAGAGGACGACCATCCCCG160ATAGAGGAGGACCGGTCTTCGGTCAAGGGTATACGAGTAG200CTGCGCTCCCCTGCTAGAACCTCCAAACAAGCTCTCAAGG240TCCATTTGTAGGAGAACGTAGGGTAGTCAAGCTTCCAAGA280CTCCAGACACATCCAAATGAGGCGCTGCATGTGGCAGTCT320GCCTTTCT328cDNA 使用 DNA 字母 T；RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。