演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN GENE LOCUS

RHEBP1RHEB

RHEB pseudogene 1

RHEBP1(RHEB pseudogene 1)是位於人類第 10 號染色體的假基因;目前提供的資料未說明其產物或功能。

Homo sapiens10q11.22
OFFICIAL SYMBOL
RHEBP1
CHROMOSOME
10
LOCUS TYPE
transcribed_processed_pseudogene
TRANSCRIPTS
1
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

RHEBP1 的正式名稱為 RHEB pseudogene 1,基因類型為假基因,位於人類第 10 號染色體的 10q11.22。現有資料僅提供其名稱、分類與染色體位置,未說明是否產生 RNA 或蛋白質,也未提供家族特徵、結構資訊或生物學功能,因此不宜據此推定其產物與作用。

Official symbol
RHEBP1
Gene name
RHEB pseudogene 1
Organism
Homo sapiens
Gene type
pseudogene
HGNC ID
HGNC:10010
Locus type
pseudogene
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
RHEBRHEB1

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1010q11.22
chr10 · 133,797,422 bp · GRCh38chr10p15.3 · 1–3000000 · gnegchr10p15.2 · 3000001–3800000 · gpos25chr10p15.1 · 3800001–6600000 · gnegchr10p14 · 6600001–12200000 · gpos75chr10p13 · 12200001–17300000 · gnegchr10p12.33 · 17300001–18300000 · gpos75chr10p12.32 · 18300001–18400000 · gnegchr10p12.31 · 18400001–22300000 · gpos75chr10p12.2 · 22300001–24300000 · gnegchr10p12.1 · 24300001–29300000 · gpos50chr10p11.23 · 29300001–31100000 · gnegchr10p11.22 · 31100001–34200000 · gpos25chr10p11.21 · 34200001–38000000 · gnegchr10p11.1 · 38000001–39800000 · acenchr10q11.1 · 39800001–41600000 · acenchr10q11.21 · 41600001–45500000 · gnegchr10q11.22 · 45500001–48600000 · gpos25chr10q11.23 · 48600001–51100000 · gnegchr10q21.1 · 51100001–59400000 · gpos100chr10q21.2 · 59400001–62800000 · gnegchr10q21.3 · 62800001–68800000 · gpos100chr10q22.1 · 68800001–73100000 · gnegchr10q22.2 · 73100001–75900000 · gpos50chr10q22.3 · 75900001–80300000 · gnegchr10q23.1 · 80300001–86100000 · gpos100chr10q23.2 · 86100001–87700000 · gnegchr10q23.31 · 87700001–91100000 · gpos75chr10q23.32 · 91100001–92300000 · gnegchr10q23.33 · 92300001–95300000 · gpos50chr10q24.1 · 95300001–97500000 · gnegchr10q24.2 · 97500001–100100000 · gpos50chr10q24.31 · 100100001–101200000 · gnegchr10q24.32 · 101200001–103100000 · gpos25chr10q24.33 · 103100001–104000000 · gnegchr10q25.1 · 104000001–110100000 · gpos100chr10q25.2 · 110100001–113100000 · gnegchr10q25.3 · 113100001–117300000 · gpos75chr10q26.11 · 117300001–119900000 · gnegchr10q26.12 · 119900001–121400000 · gpos50chr10q26.13 · 121400001–125700000 · gnegchr10q26.2 · 125700001–128800000 · gpos50chr10q26.3 · 128800001–133797422 · gnegRHEBP1pq1 bp133,797,422 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr10:46,634,911–46,635,466
Gene span
556 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000448647 ★46,634,911–46,635,4661

顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

已知功能與來源註解

目前可用來源未提供可採用的功能註解。
05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 46635466 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>RHEBP1 ENST00000448647 GRCh38 chr10:46635366-46636466 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TGAACCTATAGTAACTGAGATGGTGTGGTTTTGCCCAGTTGAAGTCAGTTAAATTTTAATTTTGAGATTT
CTGTAAAAGATACAAGTTTAGTCTTTTATTATGTATATTTGAAGGTGTTACATTTTGGAAAGTGTGTGTG
TATGAATGATAGCTAAATGGCTTCTAAGTAAAATTCAGCATATCTTGTAGATGTTGATAGAATAGAAGGG
GAAGGAATGTTTTGAAATAATGAAAATAACATGGTATGCAAATGCTTTGCAAGAGATTTGGGAAATGTAG
ATATCTCTGGTTTTAAGGATGATCTAGATTCAAGTAATAGTTCAGTAATTTCATAAAACTCTTATGACAA
AATTCTGGATGGAGAATATTCTATGAATCCCCTAGAGAGTTTCAGGTTTTTGTAGAATGATGTGAAAAAT
CTTGAACTAATTAGATAATCTTTAGAAGTTACTTCACAATCTTTGTTTTTACACATACACAGGAATTTAT
GGTGCTTTATTTTTTACAGGTTAGTAGCTAAATAAAGTATATTCTAAAGTTTTTTTATTGATGTAGGGAA
ATGGCTACCAGTGGACATTTTGAGAATATTGCAGTTGTTTTTCTTCTGAAAGAGTAAACCGGGTCATGAC
GCAGCGAGTTTCAGTCGTGACTTTTCTGGGGGCATCGCGGCGTCCCCTTTTTTTGCCTTTAAAGTAAAAC
GTCGCCCCGACGCACCCCCCGCGTATTTCGGGGGGCGGAGGCGGCGGGCCACGGCGCGAAGAGGGGCGGT
GCTGACGCCGGCCGGTCACGTGGGCGTGTTGTGGGGGGGAGGGGCGCCGCCGCGCGGTCGGTTCCGGGCG
GTTGGGAGCGCACGAGCTAGCGAGCGAGAGGCAGCCGCGCCCGCCGCCGCCCCTGCTCTGTATGCCGCTC
TCTCCCGGCGCGGCCGCCGCCGATCACAGCAGCAGGAGCCGCCGCCGCCGCGGTTGATGTGGTTGGGCCG
GGGCTGAGGAGGCCGCCAAGATGCCGCAGTCAAAGTCCCGGAAGATCGCGATCCTGGGCTACCGGTCTGT
GGGGAAATCCTCATTGACGATTCAATTTGTTGAAGGCCAATTTGTGGACTC
RHEBP1 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆

封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR10_BC8TZ · enhancer · 46634757–46635603 · regulatory

ENSR10_9NHR6 · promoter · 46635604–46635998 · regulatory

ENSR10_5DZ6HQ · CTCF_binding_site · 46635636–46635657 · regulatory

ENSR10_9NHSG · enhancer · 46640169–46640459 · regulatory

· motif · 46635492–46635509 · motif

· motif · 46635574–46635587 · motif

· motif · 46635638–46635654 · motif

· motif · 46635654–46635667 · motif

· motif · 46635669–46635682 · motif

· motif · 46635673–46635682 · motif

· motif · 46635673–46635682 · motif

· motif · 46635722–46635735 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / GENE ANATOMY

基因座與轉錄註解

pseudogene

RHEBP1 依 HGNC/Ensembl 分類為 pseudogene。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。

轉錄本Biotype拼接長度Exons
ENST00000448647 ★transcribed_processed_pseudogene556 nt1

拼接長度由已註解 exon 長度加總,單位為 nt;不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與基因產物定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:尚未取得定位註解

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

0 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 0 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

DNA 與 RNA 序列

完整非編碼轉錄本 · FASTA
ENST00000448647 · 556 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ATGCCGCAGTCAAAGTCCCGGAAGATCGCGATCCTGGGCT40
41ACCGGTCTGTGGGGAAATCCTCATTGACGATTCAATTTGT80
81TGAAGGCCAATTTGTGGACTCCTACGATCCAACCATAGAA120
121AACACTTTTACAAAGTTGATCACAGTAAATGGACAAGAAT160
161ATCATCTTTAACTTGTAGACACAGCCGGGCAAGATGAATA200
201TTCTATCTTTCCTCAGACATACTCCATAGATATTAATGGC240
241TATATTCTTGTGTATTCTGTTACATCAATCAAAAGTTTTG280
281AAGTGATTAAAGTTATCCATGGCAAATTGTTGGATATGGT320
321GGGGAAAGTACAAATACCTATTATGTTGGTTGGAAATAAG360
361AAAGACCTGCATATGGAAAGGGTGATCAGTTATGAAGAAG400
401GGAAAGCTTTGGCAGAATCTTGGAATGCAGCTTTTTTGGA440
441ATCTTCTGCTAAAGAAAATCAGACTGCTGTTGATGTTTTT480
481CGAAGGATGATTTTGGAGGCAGAAAAAATGGACGGGGCAG520
521CTTCACAAGGCAAGTCTTCATGCTCGGTGATGTGAT556

cDNA 使用 DNA 字母 T;RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。