演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

RHCECD240CE

Rh blood group CcEe antigens

RHCE 編碼 Rh blood group CcEe antigens,屬於 ammonium transporter 家族的多次跨膜蛋白,並參與紅血球膜複合體的組成與穩定。

Homo sapiens1p36.11UniProt P18577
OFFICIAL SYMBOL
RHCE
CHROMOSOME
1
UNIPROT
P18577
PDB / ALPHAFOLD
7UZQ
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

RHCE 是蛋白質編碼基因,產物名稱為 Rh blood group CcEe antigens。其蛋白質屬於 ammonium transporter 家族的 Rh subfamily,是一種多次穿越細胞膜的膜蛋白。來源將 RHCE 描述為紅血球 ankyrin-1 複合體的組成成員;這個複合體與紅血球膜的穩定及形態相關。

Official symbol
RHCE
Gene name
Rh blood group CcEe antigens
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10008
UniProt
P18577
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
CD240CESLC42A4RH

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 11p36.11
chr1 · 248,956,422 bp · GRCh38chr1p36.33 · 1–2300000 · gnegchr1p36.32 · 2300001–5300000 · gpos25chr1p36.31 · 5300001–7100000 · gnegchr1p36.23 · 7100001–9100000 · gpos25chr1p36.22 · 9100001–12500000 · gnegchr1p36.21 · 12500001–15900000 · gpos50chr1p36.13 · 15900001–20100000 · gnegchr1p36.12 · 20100001–23600000 · gpos25chr1p36.11 · 23600001–27600000 · gnegchr1p35.3 · 27600001–29900000 · gpos25chr1p35.2 · 29900001–32300000 · gnegchr1p35.1 · 32300001–34300000 · gpos25chr1p34.3 · 34300001–39600000 · gnegchr1p34.2 · 39600001–43700000 · gpos25chr1p34.1 · 43700001–46300000 · gnegchr1p33 · 46300001–50200000 · gpos75chr1p32.3 · 50200001–55600000 · gnegchr1p32.2 · 55600001–58500000 · gpos50chr1p32.1 · 58500001–60800000 · gnegchr1p31.3 · 60800001–68500000 · gpos50chr1p31.2 · 68500001–69300000 · gnegchr1p31.1 · 69300001–84400000 · gpos100chr1p22.3 · 84400001–87900000 · gnegchr1p22.2 · 87900001–91500000 · gpos75chr1p22.1 · 91500001–94300000 · gnegchr1p21.3 · 94300001–99300000 · gpos75chr1p21.2 · 99300001–101800000 · gnegchr1p21.1 · 101800001–106700000 · gpos100chr1p13.3 · 106700001–111200000 · gnegchr1p13.2 · 111200001–115500000 · gpos50chr1p13.1 · 115500001–117200000 · gnegchr1p12 · 117200001–120400000 · gpos50chr1p11.2 · 120400001–121700000 · gnegchr1p11.1 · 121700001–123400000 · acenchr1q11 · 123400001–125100000 · acenchr1q12 · 125100001–143200000 · gvarchr1q21.1 · 143200001–147500000 · gnegchr1q21.2 · 147500001–150600000 · gpos50chr1q21.3 · 150600001–155100000 · gnegchr1q22 · 155100001–156600000 · gpos50chr1q23.1 · 156600001–159100000 · gnegchr1q23.2 · 159100001–160500000 · gpos50chr1q23.3 · 160500001–165500000 · gnegchr1q24.1 · 165500001–167200000 · gpos50chr1q24.2 · 167200001–170900000 · gnegchr1q24.3 · 170900001–173000000 · gpos75chr1q25.1 · 173000001–176100000 · gnegchr1q25.2 · 176100001–180300000 · gpos50chr1q25.3 · 180300001–185800000 · gnegchr1q31.1 · 185800001–190800000 · gpos100chr1q31.2 · 190800001–193800000 · gnegchr1q31.3 · 193800001–198700000 · gpos100chr1q32.1 · 198700001–207100000 · gnegchr1q32.2 · 207100001–211300000 · gpos25chr1q32.3 · 211300001–214400000 · gnegchr1q41 · 214400001–223900000 · gpos100chr1q42.11 · 223900001–224400000 · gnegchr1q42.12 · 224400001–226800000 · gpos25chr1q42.13 · 226800001–230500000 · gnegchr1q42.2 · 230500001–234600000 · gpos50chr1q42.3 · 234600001–236400000 · gnegchr1q43 · 236400001–243500000 · gpos75chr1q44 · 243500001–248956422 · gnegRHCEpq1 bp248,956,422 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr1:25,362,249–25,430,192
Gene span
67,944 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000294413 ★25,362,249–25,420,82510
ENST0000034932025,362,249–25,430,19212
ENST0000034645225,362,249–25,420,8257
ENST0000109307125,362,249–25,420,8258
ENST0000109307225,362,249–25,420,8259
ENST0000034084925,362,308–25,420,8257
ENST0000052774725,362,359–25,402,7024
ENST0000034943825,362,431–25,420,8259
ENST0000041385425,362,523–25,420,8259

顯示 9/9 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

RHCE 蛋白是紅血球 ankyrin-1 複合體的組成成員。這個多蛋白複合體與紅血球膜的穩定及形狀有關,因此 RHCE 的功能背景包括參與維持紅血球膜相關結構。現有資料並未進一步說明 RHCE 對膜穩定或細胞形態的個別貢獻程度。

RHCE 與 RHAG 組成異源三聚體時,會形成 ANK1 的主要膜附著位點。這項作用將 RHCE 與紅血球膜複合體中的膜附著關係連結起來;資料指出 RHCE 與 ANK1 的 N 端及 C 端互動,而 ANK1 則透過其 ANK 1–5 repeats 參與互動。這些描述支持 RHCE 在複合體中具有連接 ANK1 與膜相關結構的角色,但未提供其作用的更細部機制。

RHCE 所在的異源三聚體形式可能參與 ammonium 與 carbon dioxide 的運輸。此項功能以「可能」描述,屬推論性質;來源沒有提供運輸方向、條件或實驗細節,因此不能據此確定 RHCE 本身的運輸能力或其在整體運輸中的貢獻。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 25420825 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>RHCE ENST00000294413 GRCh38 chr1:25420725-25421825 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
ATGAGGAAACTCCAATTCCTTCCTTCTTTTCTTCCTCTTTCATCCCTTCCTCCCTCCCTACATCCCTCTC
TCTCTTCCTTCCTTCCTTGACACTTACCATGTACCAGACCTTCTGCCAGGCACATGGATGGGAGCACAGT
TCCGGGAAGTTGGCTGCAGGGTTAGAACTAAGTCCCAAGCCCCGTAAAGCTCATGCCAGGGGACTGGACT
GTCCAGTACTGAGGGATGGGGATGCTGAGGCTGGTGGCCTTCCTCAGATGCACTGTAGTGCCCCAGGCAG
AGTCCTGGGCTGCCCTGTGAGGAGGTGACCAGAGGTAGAGCAACTTCACCCTAAGGCTGGATCAGGATCC
CCTCCAGGTTTTTACTAGAGCCAAACCCACATCTCCTTTCTCTTCTGCCACCCCCCCTTAAAATGCTTAG
AAACACATAGATTTAAATACAAGTTCAAATGTAAGTAATTTCAACTGTGTAACTATGAGGAGTCAATTCT
ACGTGGGTCCTATCTGTATCCTCCCCAGGGCTCAGCTCCATTCTTTGCTTTCATTCATTCTCATTCAATA
CATTGTTGTTAAGAGCTCACTGGGTGCCCTCTCTGTCATGTAGTAAGGTTTTAAAAAGAAAGCCTCTTCT
GAGCTTCAGTTTCCTTATTTATAAAATAGGAGTATTGATCCGTTCCTTGCTTTTCTTACAAGGATATGCT
GAAGATGACTGAAGTACAGAGTAAAGAAGGATTATGTTTGGGTGTCAAAGGAATAGAATGCCCTCTTTCA
AACTGAGCACAGCAGGAACCTGTAACAGGAACACAGCAACTTGTTGAATGAATGACAATATTGGAAAACA
TACATTTCCTCCCCTCCCCATCATAGTCCCTCTGCTTCCGTGTTAACTCCATAGACAGGCCAGCACAGCC
AGCCTTGCAGCCTGAGATAAGGCCTTTGGCGGGTGTCTCCCCTATCGCTCCCTCAAGCCCTCAAGTAGGT
GTTGGAGAGAGGGGTGATGCCTGGTGCTGGTGGAACCCCTGCACAGAGACGGACACAGGATGAGCTCTAA
GTACCCGCGGTCTGTCCGGCGCTGCCTGCCCCTCTGCGCCCTAACACTGGA
RHCE 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
RHCE_1 ↗1:25,420,825負股25,420,815–25,420,874

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR1_9D4FK · promoter · 25420796–25421060 · regulatory

ENSR1_B738G · enhancer · 25425135–25425961 · regulatory

ENSR1_57ZGM5 · CTCF_binding_site · 25425381–25425402 · regulatory

· motif · 25420895–25420901 · motif

· motif · 25423272–25423285 · motif

· motif · 25425179–25425192 · motif

· motif · 25425383–25425399 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:417 aa

1 aa417 aa跨膜區
依 P18577 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

Rh blood group CcEe antigens 長 417 個胺基酸,屬於 ammonium transporter(TC 2.A.49)家族的 Rh subfamily。序列註解標示 11 段螺旋型跨膜區,分布於蛋白質序列中;這些區域支持其多次跨膜蛋白的特徵。

跨膜區Helical12–32 aa
跨膜區Helical44–64 aa
跨膜區Helical77–97 aa
跨膜區Helical125–145 aa
跨膜區Helical172–192 aa
跨膜區Helical203–223 aa
跨膜區Helical238–258 aa
跨膜區Helical265–285 aa
跨膜區Helical287–307 aa
跨膜區Helical331–351 aa
跨膜區Helical358–378 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 7UZQ…

PDB · 7UZQ

EM · 2.17 A · K=1-417

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Membrane

RHCE 是多次跨膜蛋白,定位於膜。 來源未提供其在不同條件下的定位變化、異構型差異或動態資訊。

未繪示構造:Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
CD240CERHCE
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

RHCE 單體與 RHAG 同源二聚體形成異源三聚體。RHCE 也是紅血球 ankyrin-1 複合體的成員;該複合體包含 ANK1、RHCE、RHAG、SLC4A1、EPB42、GYPA、GYPB 與 AQP1。RHCE 透過 N 端及 C 端與 ANK1 的 ANK 1–5 repeats 互動,並提供 ANK1 的主要膜附著位點。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

Rh-null, amorph type(RHNA)為體染色體隱性疾病,相關變異影響 RHCE 所代表的基因。患者紅血球缺乏所有 Rh 抗原,並可能有滲透脆弱性增加、壽命縮短及形態改變,後者可呈現 stomatocytosis;患者也可能有輕度至中度溶血性貧血。Rh-null 個體在輸血或懷孕時可能因產生針對多種 Rh 抗原的抗體而面臨不良反應風險。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能RHCE 是 ankyrin-1 多蛋白複合體的組成成員,該複合體與紅血球膜的穩定及形狀有關。RHCE 與 RHAG 結合時,會提供 ANK1 的主要膜附著位點。此外,RHCE 所在的異源三聚體可能參與 ammonium 與 carbon dioxide 運輸;此項描述屬推論,並非確定結論。含實驗來源
證據與來源

Component of the ankyrin-1 complex, a multiprotein complex involved in the stability and shape of the erythrocyte membrane. Mediates the primary membrane attachment site for ANK1 when associated with RHAG. May participate in the ammonium and carbon dioxide transport through the heterotrimer form (Probable)

PMID 35835865 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用RHCE 單體與 RHAG 同源二聚體形成異源三聚體。RHCE 也屬於紅血球 ankyrin-1 複合體,該複合體包含 ANK1、RHCE、RHAG、SLC4A1、EPB42、GYPA、GYPB 與 AQP1。RHCE 以 N 端及 C 端和 ANK1 的 ANK 1–5 repeats 互動,並提供 ANK1 的主要膜附著位點。含實驗來源
證據與來源

Heterotrimer; a RHCE monomer interacts with a RHAG homodimer. Component of the ankyrin-1 complex in the erythrocyte, composed of ANK1, RHCE, RHAG, SLC4A1, EPB42, GYPA, GYPB and AQP1. Interacts (via the N- and C-terminal) with ANK1 (via ANk 1-5 repeats); mediates the primary membrane attachment site for ANK1

PMID 35835865 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位RHCE 是定位於膜的多次跨膜蛋白。此項描述未提供其定位是否會隨條件改變,也未說明異構型間的定位差異。資料庫紀錄
證據與來源

Membrane / Multi-pass membrane protein

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯Rh-null, amorph type(RHNA)是體染色體隱性疾病,相關變異影響 RHCE 所代表的基因。患者紅血球缺乏所有 Rh 抗原,且可能有滲透脆弱性增加、壽命縮短及形態改變並呈現 stomatocytosis;個體可有輕度至中度溶血性貧血,也可能在輸血或懷孕時因產生多種 Rh 抗原抗體而有不良反應風險。含實驗來源
證據與來源

Rh-null, amorph type RHNA An autosomal recessive condition characterized by red blood cells that lack all Rh antigens, have increased osmotic fragility, diminished lifespan, and show changes in morphology resulting in stomatocytosis. Rh-null individuals have mild to moderate hemolytic anemia. They are at risk of having adverse reactions in response to transfusion or pregnancy, because they may produce antibodies against several of the Rh antigens. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 617970

PMID 25413218 ↗ · PMID 9657769 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000294413 · 1,571 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1CTGGTGCTGGTGGAACCCCTGCACAGAGACGGACACAGGA40
41TGAGCTCTAAGTACCCGCGGTCTGTCCGGCGCTGCCTGCC80
81CCTCTGCGCCCTAACACTGGAAGCAGCTCTCATTCTCCTC120
121TTCTATTTTTTTACCCACTATGACGCTTCCTTAGAGGATC160
161AAAAGGGGCTCGTGGCATCCTATCAAGTCGGCCAAGATCT200
201GACCGTGATGGCGGCCCTTGGCTTGGGCTTCCTCACCTCA240
241AATTTCCGGAGACACAGCTGGAGCAGTGTGGCCTTCAACC280
281TCTTCATGCTGGCGCTTGGTGTGCAGTGGGCAATCCTGCT320
321GGACGGCTTCCTGAGCCAGTTCCCTCCTGGGAAGGTGGTC360
361ATCACACTGTTCAGTATTCGGCTGGCCACCATGAGTGCTA400
401TGTCGGTGCTGATCTCAGCGGGTGCTGTCTTGGGGAAGGT440
441CAACTTGGCGCAGTTGGTGGTGATGGTGCTGGTGGAGGTG480
481ACAGCTTTAGGCACCCTGAGGATGGTCATCAGTAATATCT520
521TCAACACAGACTACCACATGAACCTGAGGCACTTCTACGT560
561GTTCGCAGCCTATTTTGGGCTGACTGTGGCCTGGTGCCTG600
601CCAAAGCCTCTACCCAAGGGAACGGAGGATAATGATCAGA640
641GAGCAACGATACCCAGTTTGTCTGCCATGCTGGGCGCCCT680
681CTTCTTGTGGATGTTCTGGCCAAGTGTCAACTCTGCTCTG720
721CTGAGAAGTCCAATCCAAAGGAAGAATGCCATGTTCAACA760
761CCTACTATGCTCTAGCAGTCAGTGTGGTGACAGCCATCTC800
801AGGGTCATCCTTGGCTCACCCCCAAAGGAAGATCAGCATG840
841ACTTATGTGCACAGTGCGGTGTTGGCAGGAGGCGTGGCTG880
881TGGGTACCTCGTGTCACCTGATCCCTTCTCCGTGGCTTGC920
921CATGGTGCTGGGTCTTGTGGCTGGGCTGATCTCCATCGGG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。