演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

RGS5

regulator of G protein signaling 5

RGS5 是蛋白質編碼基因,其產物可抑制訊號傳遞;相關作用與 G protein alpha subunits 的 GTPase 活性增加有關。

Homo sapiens1q23.3UniProt O15539
OFFICIAL SYMBOL
RGS5
CHROMOSOME
1
UNIPROT
O15539
PDB / ALPHAFOLD
2CRP
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

RGS5(regulator of G protein signaling 5)是蛋白質編碼基因。其產物屬於調節 G protein signaling 的蛋白質,序列含有 RGS domain。來源指出其與 G protein alpha subunits 的調節作用有關,但這項作用的描述標示為依相似性推論。蛋白質的序列特徵與各異構型的細胞定位資訊,分別見下方內容。

Official symbol
RGS5
Gene name
regulator of G protein signaling 5
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10001
UniProt
O15539
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HGNC 未提供其他基因異名。

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 11q23.3
chr1 · 248,956,422 bp · GRCh38chr1p36.33 · 1–2300000 · gnegchr1p36.32 · 2300001–5300000 · gpos25chr1p36.31 · 5300001–7100000 · gnegchr1p36.23 · 7100001–9100000 · gpos25chr1p36.22 · 9100001–12500000 · gnegchr1p36.21 · 12500001–15900000 · gpos50chr1p36.13 · 15900001–20100000 · gnegchr1p36.12 · 20100001–23600000 · gpos25chr1p36.11 · 23600001–27600000 · gnegchr1p35.3 · 27600001–29900000 · gpos25chr1p35.2 · 29900001–32300000 · gnegchr1p35.1 · 32300001–34300000 · gpos25chr1p34.3 · 34300001–39600000 · gnegchr1p34.2 · 39600001–43700000 · gpos25chr1p34.1 · 43700001–46300000 · gnegchr1p33 · 46300001–50200000 · gpos75chr1p32.3 · 50200001–55600000 · gnegchr1p32.2 · 55600001–58500000 · gpos50chr1p32.1 · 58500001–60800000 · gnegchr1p31.3 · 60800001–68500000 · gpos50chr1p31.2 · 68500001–69300000 · gnegchr1p31.1 · 69300001–84400000 · gpos100chr1p22.3 · 84400001–87900000 · gnegchr1p22.2 · 87900001–91500000 · gpos75chr1p22.1 · 91500001–94300000 · gnegchr1p21.3 · 94300001–99300000 · gpos75chr1p21.2 · 99300001–101800000 · gnegchr1p21.1 · 101800001–106700000 · gpos100chr1p13.3 · 106700001–111200000 · gnegchr1p13.2 · 111200001–115500000 · gpos50chr1p13.1 · 115500001–117200000 · gnegchr1p12 · 117200001–120400000 · gpos50chr1p11.2 · 120400001–121700000 · gnegchr1p11.1 · 121700001–123400000 · acenchr1q11 · 123400001–125100000 · acenchr1q12 · 125100001–143200000 · gvarchr1q21.1 · 143200001–147500000 · gnegchr1q21.2 · 147500001–150600000 · gpos50chr1q21.3 · 150600001–155100000 · gnegchr1q22 · 155100001–156600000 · gpos50chr1q23.1 · 156600001–159100000 · gnegchr1q23.2 · 159100001–160500000 · gpos50chr1q23.3 · 160500001–165500000 · gnegchr1q24.1 · 165500001–167200000 · gpos50chr1q24.2 · 167200001–170900000 · gnegchr1q24.3 · 170900001–173000000 · gpos75chr1q25.1 · 173000001–176100000 · gnegchr1q25.2 · 176100001–180300000 · gpos50chr1q25.3 · 180300001–185800000 · gnegchr1q31.1 · 185800001–190800000 · gpos100chr1q31.2 · 190800001–193800000 · gnegchr1q31.3 · 193800001–198700000 · gpos100chr1q32.1 · 198700001–207100000 · gnegchr1q32.2 · 207100001–211300000 · gpos25chr1q32.3 · 211300001–214400000 · gnegchr1q41 · 214400001–223900000 · gpos100chr1q42.11 · 223900001–224400000 · gnegchr1q42.12 · 224400001–226800000 · gpos25chr1q42.13 · 226800001–230500000 · gnegchr1q42.2 · 230500001–234600000 · gpos50chr1q42.3 · 234600001–236400000 · gnegchr1q43 · 236400001–243500000 · gpos75chr1q44 · 243500001–248956422 · gnegRGS5pq1 bp248,956,422 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr1:163,111,121–163,321,791
Gene span
210,671 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000313961 ★163,142,299–163,202,9165
ENST00000367903163,142,299–163,217,6366
ENST00000530507163,142,299–163,202,9035
ENST00000618415163,142,299–163,321,7916
ENST00000950224163,146,260–163,202,9125
ENST00000527988163,147,342–163,202,8353
ENST00001112192163,148,417–163,202,9145
ENST00000531476163,152,608–163,202,8983
ENST00001131304163,200,255–163,202,9122

顯示 9/9 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

RGS5 的功能描述指出,它可抑制訊號傳遞,作用方式是提高 G protein alpha subunits 的 GTPase 活性。這會促使相關次單元由活化狀態轉為不活化的 GDP 結合形式,因而降低訊號傳遞。此處描述的是其對 G protein alpha subunits 活性的調節及其後續狀態變化;來源未提供更廣泛的生物過程或作用情境。

在結合對象方面,資料指出 RGS5 可結合 G(i)-alpha 與 G(o)-alpha,但不結合 G(s)-alpha。這表示來源描述的結合具有選擇性,不能將其概括為對所有 G protein alpha subunits 均有相同結合能力。上述功能與結合特性均標示為依相似性推論,因此應保留這項證據限制,不視為此處直接驗證的結論。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 163202916 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>RGS5 ENST00000313961 GRCh38 chr1:163202816-163203916 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AGGCATTTATTTACAGATTAACTTATCAGCACCTTGGGCCCCGACAAGATAAGACACAATTCAGGTAAAT
TTTGGTAAATATTCCTTGAGTGATAGGAAGCAGGAAAAGTTTGAAGGAGAAGGAAAGACAAGCCTAGGCA
AGGATGGCTATGGTGGGGAGGTACAAAGAATTACAAAGCATTAGTCATCCAAGCAAAGTATAATCAGAAG
ACCACTGACAGAATTAACAGAGTTCAGAGATAATATCATTATACTCAATCCCTACTAAGATTTTGGTGTT
TGGTCTCCTAGATCACTTTTTTAGTACCTTCACAGACATATGGATTCATAAAGAATATATAGTAATTATT
CATATTTGTTTTGATTTATATAAACAGTAATCTTGTCTCTCAGCTCCAGAAAACCTTGCCTGGTGCTTCC
TGAAGGCTCACAACATCCCAGCCCGGCCTCCATCACTTACTTATAATGTGTTTTGGGGTCTTGAGGGCAG
GGAGCTTTCTCTTTCTTCTCTGAATTCCTAGCATCCAGCTGAGTGCCTGGCACTTGGTAAGTATTCACAT
ACACATTCCTTGAATTCCCTAGATTTCAGTTTCCTTCACTGTGAAACAAAGTGGGCTAAACGATCTCCAG
GAGCCCTTACAGTCCTAAGAATCTATGACTTTGACCGATCTGAAGTGGTCCAAGACACTTTGCTTCACAG
GAAGCTCACATCTTCCTTGTGATTGGCCTGAGATTAGGAGTTCAAACAACCAATGACCTGTGCACAGTTT
AGGGCCTAACCCTGCCCTGGCCGGTTAGCAAGAGAGTGTTGTGATAAGAGCAGATGAAAGCCTTATGCCA
CAGTAGTGCCTGTAGCAGAGAAAGGATTCCCTCCTCCACCTCAGGGCCCACTGCTGCTGCTCTCCAGCCT
GCAGTTTCCTCTAAGGCTCTGGATTGGCTGGAAGAGCAACAGAGGGCTGGGAAAGAGCTTCTATATATAC
CTCAGGAGGAAAGGCATCCCAGACAGTTTTGAAGTTTTCAAAGACTGGCTCTGCTGTTAAGAAGTTGTAC
TTAAAGCGGAGGAGCTAAGCCACCTGCCAAAATGTGCAAAGGACTTGCAGC
RGS5 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
RGS5_1 ↗1:163,202,912負股163,202,902–163,202,961
RGS5_2 ↗1:163,321,735負股163,321,725–163,321,784

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR1_B37DHK · promoter · 163202825–163203406 · regulatory

· motif · 163203346–163203355 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:181 aa

1 aa181 aa結構域
依 O15539 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

RGS5 蛋白質長 181 個胺基酸。其第 64 至 180 位胺基酸區段註記為 RGS domain;此結構域註解來自 PROSITE-ProRule。

結構域RGS64–180 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 2CRP…

PDB · 2CRP

NMR · - · A=44-180

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm;Membrane

RGS5 的異構型 1 定位於細胞質與膜;異構型 2 則定位於細胞質。 資料因此顯示兩種異構型在膜定位的註記上有所不同。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

未繪示構造:Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
RGS5RGS5MEOX2
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能RGS5 的功能描述為抑制訊號傳遞,方式是提升 G protein alpha subunits 的 GTPase 活性,使其轉為不活化的 GDP 結合形式。資料指出它結合 G(i)-alpha 與 G(o)-alpha,但不結合 G(s)-alpha;這些功能與結合敘述均為依相似性推論。推論支持
證據與來源

Inhibits signal transduction by increasing the GTPase activity of G protein alpha subunits thereby driving them into their inactive GDP-bound form. Binds to G(i)-alpha and G(o)-alpha, but not to G(s)-alpha (By similarity)

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位RGS5 的異構型 1 定位於細胞質與膜。此筆定位資訊針對異構型 1,並未描述其他異構型的定位,也未提供定位變化的條件或動態。含實驗來源
證據與來源

Isoform 1; Cytoplasm; Membrane

PMID 15670159 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位RGS5 的異構型 2 定位於細胞質。此筆定位資訊僅描述異構型 2 位於細胞質,未列出其他位置,也未提供定位變化的條件或動態。含實驗來源
證據與來源

Isoform 2; Cytoplasm

PMID 15670159 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000313961 · 5,670 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGACAGTTTTGAAGTTTTCAAAGACTGGCTCTGCTGTTAA40
41GAAGTTGTACTTAAAGCGGAGGAGCTAAGCCACCTGCCAA80
81AATGTGCAAAGGACTTGCAGCTTTGCCCCACTCATGCCTG120
121GAAAGGGCCAAGGAGATTAAGATCAAGTTGGGAATTCTCC160
161TCCAGAAGCCAGACTCAGTTGGTGACCTTGTCATTCCGTA200
201CAATGAGAAGCCAGAGAAACCAGCCAAGACCCAGAAAACC240
241TCGCTGGACGAGGCCCTGCAGTGGCGTGATTCCCTGGACA280
281AACTCCTGCAGAACAACTATGGACTTGCCAGTTTCAAAAG320
321TTTCCTGAAGTCTGAATTCAGTGAGGAAAACCTTGAGTTC360
361TGGATTGCCTGTGAGGATTACAAGAAGATCAAGTCCCCTG400
401CCAAGATGGCTGAGAAGGCAAAGCAAATTTATGAAGAATT440
441CATTCAAACGGAGGCTCCTAAAGAGGTGAATATTGACCAC480
481TTCACTAAGGACATCACAATGAAGAACCTGGTGGAACCTT520
521CCCTGAGCAGCTTTGACATGGCCCAGAAAAGAATCCATGC560
561CCTGATGGAAAAGGATTCTCTGCCTCGCTTTGTGCGCTCT600
601GAGTTTTATCAGGAGTTAATCAAGTAGTAATTTAGCCAGG640
641CTATGAAATCATCCTGTGAGTTATTTCCTCCATAATAACC680
681CTGCATTTCCCATTAATCTACATATCTTCCCACAGCAGCT720
721TTGCTCAGTGATACCCACATGGGAAAAATCCCAGGGGATG760
761TTGCTTACTCTTTTTGCCCACACTGCTTTGGATACTTATC800
801TACTGTCCGAAGGCCTTCTTTCCCCACTCAATTCTTCCTG840
841CCCTGTTATTAATTAAGATATCTTCAGCTTGTAGTCAGAC880
881ACAATCAGAATCACAGAAAAATCCTGCCTAAGGCAAAGAA920
921ATATAAGACAAGACTATGATATCAATGAATGTGGGTTAAG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。