基因總覽
MRPS12 是人類蛋白質編碼基因，正式名稱為 mitochondrial ribosomal protein S12。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 19q13.2。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000308018 ★ | 38,930,944–38,933,168 | 3 |
| ENST00000933523 | 38,930,917–38,933,183 | 3 |
| ENST00001101471 | 38,930,917–38,937,406 | 3 |
| ENST00001101472 | 38,930,917–38,937,406 | 3 |
| ENST00001141283 | 38,930,917–38,937,406 | 3 |
| ENST00000899577 | 38,930,930–38,937,406 | 3 |
| ENST00000402029 | 38,930,951–38,937,406 | 3 |
| ENST00000933522 | 38,930,951–38,933,183 | 3 |
| ENST00000933524 | 38,930,951–38,937,406 | 3 |
| ENST00000968236 | 38,930,951–38,937,406 | 3 |
| ENST00000407800 | 38,930,954–38,937,406 | 2 |
顯示 11/11 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>MRPS12 ENST00000308018 GRCh38 chr19:38929944-38931044 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AGTTGCACCTTAAGTATCAGTTTAATAGAACCATTCATTAATGGATTCATTCATTCATTCATTAACTCTA TTTAACTGCCTGCTATGTGTGGCGGAGGTGCACAACTCTCCCTACCTCTCTCTCTAAACGCAAGAGCTCC ACCACACCCCAGCCCTGACCCCGTCCGATTCACACTTGGCTCCCCATTTTCCTTTGTGGTCTTAGGGAAA GGCTGGCATGAGGTTGCAGCACGGAGGGCAATGTCACATAGCAAGTTCCTAAAGGACAGGAGGTACCCAG CGAGCAGTATGAAACAAGCGCATAATGGGTGTCCAGGACACAGTAGGCATTCTTGGCACATAGTAGGGCC TCAGCACTCACTGGACAACTGGCACATAAGTGGGTGCCATGCACAAGACGTTGGCTAACTTGGGAAATAA CTAAAATTCCTACTACAGGTTCGCCCCCTGCCGGAGGGCATCTTGCAAACCCAATTCTTCCGTAAAGCAA ACGTCTGCGCCCCCCGGCCGGCGCAGGCGCACTCACGATCGCGGGCAGGTCCGCCGAGCGCAGCTCCCCC TTGCGGAGCTCCAGGGCGTGTGCGGCCTCTTCTGGGCATGCGCAGAACCGCTCTATGTCCAGCTGAGGGA GTGCGCTGTAGCCCTCGCGCGCATACTCGTACAGGAGGTTCCGGTTTCGTTTCTCTGTAGTGAAACTTCT CCTTGGACTATCGTTGGAGATGCAGCCTCCCCGGGGCCGGAACCCCCGACGAGTCAGCAAAGGCCACAAG CGCCGCGCCATGGACGCAGCCATCTTGGACCGGGAACAAGGCGGCACTTCGTCCCGCCCACTCCGCGTTT AGACCAATTGCAAGGCAGCGAACCTGACCGTGACGAGCCAATCAGATCCTGAGGAAAGTTGACCGCGATA GAGTCCTTCGTCGCCCAATCGTCGTCTGTGTCCCGCCTCTTCAGTGACGCGAGGCAGAACCAGCCAATCC CTGCACGGATAGCGCCCGGAAGAGGCTAGAAGCTGGATTCAGCGTGTCCGCGACCTCACCTTTAGGTCCT GTGAGGTCGGTGGAATCCTGGGGTCCTCCAAATCTACCAGGCCATCTCCCC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| MRPS12_1 ↗ | 19:38,930,944 | 正股 | 38,930,895–38,930,954 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR19_5C684Z · CTCF_binding_site · 38929232–38929253 · regulatory
ENSR19_9KG7G · enhancer · 38929794–38930122 · regulatory
ENSR19_9KG7K · promoter · 38930123–38930623 · regulatory
ENSR19_5C68B9 · CTCF_binding_site · 38930381–38930402 · regulatory
ENSR19_5C68BR · CTCF_binding_site · 38930493–38930514 · regulatory
ENSR19_9KG7P · promoter · 38930748–38931009 · regulatory
ENSR19_B9PLF · enhancer · 38931010–38931820 · regulatory
ENSR19_5C68P2 · CTCF_binding_site · 38932696–38932717 · regulatory
ENSR19_5C68Q8 · CTCF_binding_site · 38932962–38932983 · regulatory
· motif · 38929234–38929250 · motif
· motif · 38930137–38930145 · motif
· motif · 38930383–38930399 · motif
· motif · 38930453–38930464 · motif
· motif · 38930453–38930464 · motif
· motif · 38930495–38930511 · motif
· motif · 38930536–38930547 · motif
· motif · 38930536–38930547 · motif
· motif · 38930609–38930629 · motif
· motif · 38930764–38930774 · motif
· motif · 38931152–38931160 · motif
· motif · 38932698–38932714 · motif
· motif · 38932964–38932980 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：138 aa
MRPS12 蛋白長 138 個胺基酸，屬於 universal ribosomal protein uS12 家族。其第 1–29 位胺基酸被註記為粒線體轉運胜肽；第 36–56 位則為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- SPINK7P58062 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
MRPS12 是粒線體小型核糖體次單元（mt-SSU）的組成成分。成熟哺乳類 55S 粒線體核糖體由 28S 小型次單元與 39S 大型次單元構成；小型次單元含有 12S 粒線體核糖體 RNA（12S mt-rRNA）及 30 種不同蛋白質。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 交互作用 | MRPS12 是粒線體小型核糖體次單元（mt-SSU）的組成成分。成熟哺乳類 55S 粒線體核糖體由 28S 小型與 39S 大型次單元構成；28S 次單元含有 12S 粒線體核糖體 RNA（12S mt-rRNA）及 30 種不同蛋白質。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the mitochondrial small ribosomal subunit (mt-SSU). Mature mammalian 55S mitochondrial ribosomes consist of a small (28S) and a large (39S) subunit. The 28S small subunit contains a 12S ribosomal RNA (12S mt-rRNA) and 30 different proteins. The 39S large subunit contains a 16S rRNA (16S mt-rRNA), a copy of mitochondrial valine transfer RNA (mt-tRNA(Val)), which plays an integral structural role, and 52 different proteins PMID 25838379 ↗ |
| 細胞定位 | MRPS12 的定位為粒線體。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
AGAGGCTAGAAGCTGGATTCAGCGTGTCCGCGACCTCACC40TTTAGGTCCTGTGAGGGACGGCCCAGGTGGCAGGATGTCC80TGGTCTGGCCTTCTCCATGGCCTCAACACGTCCCTAACTT120GTGGCCCAGCTCTGGTTCCCCGGCTCTGGGCTACCTGCTC160CATGGCTACCCTGAACCAGATGCACCGCCTGGGGCCCCCC200AAGCGGCCGCCTCGGAAGCTGGGCCCCACGGAAGGCCGGC240CGCAGCTGAAGGGTGTGGTCCTGTGCACGTTTACCCGCAA280GCCGAAGAAGCCCAACTCAGCCAATCGCAAGTGCTGTCGA320GTGCGGCTCAGCACTGGCCGCGAGGCCGTCTGCTTCATCC360CTGGGGAGGGCCACACCCTGCAGGAGCACCAGATTGTCCT400TGTGGAGGGCGGCCGCACCCAGGACCTGCCAGGCGTCAAG440CTCACCGTTGTGCGTGGCAAGTACGACTGTGGCCACGTGC480AGAAGAAGTGACGGCTGGGGGCACAGTGGGCTGGGCGCCC520CTGCAGAACATGAACCTTCCGCTCCTGGCTGCCACAGGGT560CCTCCGATGCTGGCCTTTGCGCCTCTAGAGGCAGCCACTC600ATGGATTCAAGTCCTGGCTCCGCCTCTTCCATCAGGACCA640CTATTAAGCCATAGGAGTCCTGGGGGTGCAAAGGGTGCCC680CTCTGTCAACACCCTTGGCTCCTGTGTTTAGAGGGGTGGC720CTGAAGGACCTTTTCTGCTGGGACAAGACACTGTACTGCC760CTCTGCTGGGAAGGGGTTTTAATAAACAGACCCTGGCGCT800TGTGATGTAAATCCCCTTGTGGAGTATTTGCCCTCTGTGT840GGCTGTGGCAGTGGACATCTCTGAGCTTCAGTTTCCTCCA880GAAAATAGCTCCATTGGTGGTATCTCCTTTGTTTGGTTTG920GTGAAGATTAAATTCGATGCTCTATGTGCATAACACGCA959cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。