基因總覽
MRPL23 是人類蛋白質編碼基因，正式名稱為 mitochondrial ribosomal protein L23。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 11p15.5。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000397298 ★ | 1,947,332–1,956,600 | 5 |
| ENST00000381519 | 1,947,278–1,956,609 | 6 |
| ENST00000397297 | 1,947,278–1,984,522 | 6 |
| ENST00000381514 | 1,947,278–1,962,838 | 5 |
| ENST00000397294 | 1,947,278–1,972,793 | 5 |
| ENST00000869797 | 1,947,278–1,962,862 | 6 |
| ENST00000869798 | 1,947,278–1,956,597 | 5 |
| ENST00000924182 | 1,947,278–1,986,375 | 6 |
| ENST00000924183 | 1,947,278–1,956,601 | 5 |
| ENST00000924184 | 1,947,278–1,956,600 | 5 |
| ENST00000954473 | 1,947,278–1,978,443 | 6 |
| ENST00001004563 | 1,947,278–1,956,597 | 6 |
顯示 12/14 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>MRPL23 ENST00000397298 GRCh38 chr11:1946332-1947432 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GGCAGTTAAAGAGATAGATGGAGAAGTGGCCTGAATCCAGCCACCAGGCAGAGGAAACCAGGGGAGGAGG GAGAGGCCTGGGGACAGGGGAGGGAGGCTGCTGCCCTCTACTCCCGAAGGGTCCCAGCAGCCCTCCTGGC CAGCACTACCCAAGGAAAGGAGTGAGGACTGGGCCTTGGACGGGGGTCCCTGTAGAGAGGGCCTTGCCAG AGGCTGGAGGGGGCTGGCCAGAAGGGTGGAGAGGGGGTGAGCAAACGGCAAGGCCTGAAGAGGCCAGTGG CCCTCTTGGAGGAGGCGTGGTGGGAGCACCGAGGATGGACAGCGTGGCTGGTGTGGCCAGCGTGGGGGCT GCCAACCGGGCTGGCCAGAAGGGCGAGGTGAGGGGCCCTGGGGTTCCGGGCTCCCGGGTAAAAACAGCCA GATGGAGAGAGGGGCTTCAGACCCCAGGCCCGGGGACCCGCCCTCCCCAGCACTACAGCCCCGGTTCTCC ACTTCCAGCTCCCAGCAGCTGCAAGCGCAGCGGTGCGGGGCCAGGCTGTGGCCTGGAGCTGCCAAAGGGC AGGGGCACGGGTGTGGGGGGCGTGCAGGCCGGGGTCCCGGGAGGCAGGGCAGACAGGCCCGAAAGAGTGC GACGGCGGCGGGAGGTCTCTGGGGCTGGGAGGGGTGCGGGCGTGGGCGGGGCGCGAGCAGCAGGGGCGCG GGCCCGGGCTTCAGGCTGTGGGGCCGGGAGTGCGGGGCGGGACTGCTGCGGCCCCGCGTCCTGTGGAGTC TGCGGCGCGGGGAGTGGGGGTCGGGGCGGGGAGGAACGTGGGGTGCGGGACAGGAGGGGGGCAGGGAGGG AGAAGAAGGCGGCGCGGGGCGGGGCGGGCGCAGGGCTGGGGACGGCACGGGCGCGCGGCACGGGCGCTGG CGCGTGCGGGGGGGGCGGCGCGGCCTCCGGAAGCGAGGGGGCGCTGTGCCAGGCGGCGGCCGTGCGGGGC GGGCGCGCTGCTCCTTCCGCCTCGCGGACCCCGGAAGCGCGCGTGGCCGCCATGGCGCGGAATGTGGTGT GAGTAGGGGTCGTCACCCCCCCGTCGCGGGGCGCCCCTTAGTGTCACAAGC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| MRPL23_1 ↗ | 11:1,947,332 | 正股 | 1,947,283–1,947,342 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR11_83JM2 · enhancer · 1942215–1942439 · regulatory
ENSR11_BDF8 · enhancer · 1943492–1944331 · regulatory
ENSR11_BDFN · promoter · 1946788–1947354 · regulatory
ENSR11_5GCW6 · CTCF_binding_site · 1947268–1947289 · regulatory
ENSR11_D4LG · enhancer · 1947355–1949411 · regulatory
ENSR11_9QW8 · enhancer · 1949942–1950210 · regulatory
· motif · 1946998–1947011 · motif
· motif · 1947244–1947257 · motif
· motif · 1947267–1947276 · motif
· motif · 1947270–1947286 · motif
· motif · 1947273–1947286 · motif
· motif · 1947323–1947334 · motif
· motif · 1947339–1947350 · motif
· motif · 1947341–1947350 · motif
· motif · 1947356–1947366 · motif
· motif · 1947686–1947693 · motif
· motif · 1947975–1947988 · motif
· motif · 1947975–1947988 · motif
· motif · 1948064–1948072 · motif
· motif · 1948140–1948155 · motif
· motif · 1948270–1948282 · motif
· motif · 1948393–1948405 · motif
· motif · 1948427–1948440 · motif
· motif · 1948609–1948617 · motif
· motif · 1951484–1951497 · motif
· motif · 1951548–1951561 · motif
· motif · 1951548–1951562 · motif
· motif · 1951548–1951563 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：153 aa
MRPL23 屬於 universal ribosomal protein uL23 家族，蛋白質長度為 153 個胺基酸。序列第 108 至 153 位被註記為無序區域；此區域註解來自 MobiDB-lite。
蛋白質三維結構
細胞內定位
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 4 個夥伴
- CYSRT1A8MQ03 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP1-1Q07627 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP3-3Q9BYR6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PNMA1Q8ND90 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
MRPL23 是粒線體大型核糖體次單元（mt-LSU）的組成成分。成熟哺乳類 55S 粒線體核糖體由 28S 小次單元與 39S 大次單元構成；大型次單元含有 16S mt-rRNA、1 個 mt-tRNA(Val) 及 52 種不同蛋白質。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 交互作用 | MRPL23 是粒線體大型核糖體次單元（mt-LSU）的組成成分。成熟哺乳類 55S 粒線體核糖體由 28S 小次單元與 39S 大次單元構成；小次單元含有 12S mt-rRNA 及 30 種不同蛋白質，大次單元則含有 16S mt-rRNA、1 個具有整合性結構作用的 mt-tRNA(Val) 及 52 種不同蛋白質。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the mitochondrial large ribosomal subunit (mt-LSU). Mature mammalian 55S mitochondrial ribosomes consist of a small (28S) and a large (39S) subunit. The 28S small subunit contains a 12S ribosomal RNA (12S mt-rRNA) and 30 different proteins. The 39S large subunit contains a 16S rRNA (16S mt-rRNA), a copy of mitochondrial valine transfer RNA (mt-tRNA(Val)), which plays an integral structural role, and 52 different proteins PMID 25278503 ↗ · PMID 25838379 ↗ · PMID 28892042 ↗ · PMID 35177605 ↗ |
| 細胞定位 | MRPL23 位於粒線體。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
CTCGCGGACCCCGGAAGCGCGCGTGGCCGCCATGGCGCGG40AATGTGGTGTACCCCCTGTACCGGCTGGGTGGCCCACAAC80TTCGGGTGTTCCGAACCAACTTCTTCATTCAGCTGGTGCG120GCCCGGTGTGGCCCAGCCCGAGGACACCGTGCAGTTCCGG160ATCCCCATGGAAATGACAAGGGTGGACCTCAGGAATTACC200TCGAGGGCATCTATAACGTGCCCGTGGCTGCTGTGCGGAC240ACGGGTGCAGCATGGCTCTAACAAGAGAAGAGATCACAGA280AACGTGAGGATCAAGAAGCCGGACTACAAGGTCGCCTACG320TGCAGCTGGCCCATGGACAGACCTTCACGTTCCCAGATCT360GTTTCCCGAGAAAGACGAGAGCCCTGAAGGCAGCGCTGCC400GACGACCTCTACAGCATGCTCGAGGAGGAGAGGCAGCAGA440GGCAGAGCAGCGACCCGCGGCGGGGCGGCGTCCCCAGCTG480GTTCGGGCTGTGACGGGGTGGCCAGCAGGGACGCGCCCCA520GGTGGGCAGCTGTGGCAGAGCAGCGACCCGCGGCGGGGCG560GCATCCCCAGCTGGTTCGGGCCGTGACGGGGCGGCCAGCA600GGGACGCGCCCCAGGTGGGCAGCTGTGGCAGAGCAGTCCC640GACACCTAAATAAAAGTCTTGCTGCAGGAGAAA673cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。