基因總覽
BIN2（bridging integrator 2）是由蛋白質編碼基因 BIN2 產生的蛋白質。其蛋白質長度為 565 個胺基酸，含有 BAR domain，另有一段被註記為無序區域的序列。現有資料指出，BIN2 與細胞膜及 podosome 蛋白質有關，並參與細胞移動、膜形態調節和 podosome 形成；其具體作用方式見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000615107 ★ | 51,281,038–51,324,174 | 13 |
| ENST00000604560 | 51,281,038–51,324,115 | 11 |
| ENST00000452142 | 51,281,038–51,324,154 | 12 |
| ENST00000544402 | 51,281,038–51,324,668 | 13 |
| ENST00000871152 | 51,281,038–51,324,369 | 13 |
| ENST00000871153 | 51,281,038–51,324,176 | 13 |
| ENST00000871154 | 51,281,038–51,324,174 | 12 |
| ENST00000871155 | 51,281,038–51,324,146 | 11 |
| ENST00000871156 | 51,281,038–51,324,137 | 12 |
| ENST00000871157 | 51,281,038–51,324,116 | 12 |
| ENST00000871158 | 51,281,038–51,324,103 | 12 |
| ENST00000988784 | 51,281,038–51,324,142 | 12 |
顯示 12/15 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
BIN2 參與促進細胞移動與遷移。來源指出，這項作用可能與 BIN2 和細胞膜及 podosome 蛋白質的互動有關；這些 podosome 蛋白質可介導與細胞骨架的連結。此處的作用關聯帶有「可能」的限定，資料並未進一步說明各分子步驟或其因果順序。
BIN2 也調節細胞膜曲率，並介導膜小管形成。這些膜形態相關作用與其細胞移動功能並列於來源中，但來源沒有詳述膜曲率如何改變、膜小管如何形成，或兩者與細胞遷移之間的具體關係。因此，較適合將其理解為 BIN2 所參與的膜動態功能，而不延伸推定未記載的機制。
在細胞結構方面，BIN2 參與 podosome 形成。來源亦提及 podosome 蛋白質可促成與細胞骨架的互動，支持其在細胞膜、podosome 與細胞骨架相關過程中的角色；不過，現有資料未指出 BIN2 在 podosome 組裝中的具體步驟或必要性。
此外，BIN2 會抑制吞噬作用。這項功能與其促進細胞移動、調節膜曲率及參與 podosome 形成的描述一同列出，但來源未說明吞噬作用受抑制的條件，也未提供該作用與其他功能之間的直接機制。整體而言，資料支持 BIN2 參與細胞移動、膜形態變化、podosome 形成及吞噬調節，但部分作用關係仍屬可能性描述。
Promoter 與基因調控
>BIN2 ENST00000615107 GRCh38 chr12:51324074-51325174 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter ATTTGCACAATCTGTGTCTGTGTTCACATTCTGCCTCCATCCAGTACACTGTACTCCAACTAGAAAAACT TGCTCCTCATGCTCAGCACGGGCGTCCATACTATCCTCCTCAGCCTTTTTTCAATGTGATCATTCTCTTG CCTAAGAACCAGCCCCCTACCCTGTTTCTATCTCCAGCTTAGTTGTTCCTCATTTATTTATTTATTTATT TATTTATTTATTTATTTATTTGAGACGAACTGTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAATGCAGTGGCGCGATT TCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAACAATTCTCCTGCGTCATCCTCTCGAGTAGCTGGGA CTGCAGGCGTGCGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGCGACGCGGTTTCACCGTATTGG TCAGGCTGATCTCCTAACCTCAGGCGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGCGTG AGCCACCGCGCCCGGCCTGTTTCTCTCTTTCAAGCCCGGCTCGGGTGTCCTGCCTGCTTTCTGCACTCTA TCCCTACCAGTTCCAGGCTTAGAGCCTACCTGGAGCAAGAAACGCAGTGTACATGGCGGCTTCGCATGCA TACTCAGAGAACCTAAACGTGTTTTCGATATGGTAGGTCCTCTCGCTGAGTGGAACCCACATCATTTTCT ACCCTGCGGTGGCAGTTGCTTTGCAGTGCTCAGCGTGATGGGAACTGGCTTTCCGGAGCGAGTGAGTGTG GGCCCACCACTGAGGACCTGGTTCAGTGAGGCCGAGGTTTCGGGCAGGGGTTGGAGCTCGGAAGCTGGCC TCGAGCGAGCGCTGCCTGAGGGTAGGCCCCGGGCCCGCCCCTCCGAGCCGGCCTGCTCCAGCTGACAGTG GTGGGCTGAGGGGCGGGCCTCAGGGCTGGCCAGGGGCGGCCTGAGGTGGCTCAGGGCTGGGGCCGGATGC GAGGCATGCCGGGAGCCCGCACTTCCTCCTCGGGGGCCTCAGAAAACCACAGGGCGCGGGGCCAGGGCGG CGGCCCCCAGGGAGTTGGCAGGATGGCAGAGGGCAAGGCAGGCGGCGCGGC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| BIN2_1 ↗ | 12:51,324,126 | 負股 | 51,324,116–51,324,175 |
| BIN2_2 ↗ | 12:51,324,668 | 負股 | 51,324,658–51,324,717 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR12_BD6ZL · enhancer · 51318591–51319445 · regulatory
ENSR12_C74HG · enhancer · 51320348–51321450 · regulatory
ENSR12_D4JQB · enhancer · 51322013–51324104 · regulatory
ENSR12_5G3XBS · CTCF_binding_site · 51323497–51323518 · regulatory
ENSR12_5G3XBX · CTCF_binding_site · 51323521–51323542 · regulatory
ENSR12_BD72F · promoter · 51324105–51324758 · regulatory
ENSR12_BD72R · enhancer · 51326509–51327526 · regulatory
· motif · 51319322–51319334 · motif
· motif · 51320268–51320290 · motif
· motif · 51320268–51320290 · motif
· motif · 51320491–51320500 · motif
· motif · 51320491–51320500 · motif
· motif · 51320830–51320840 · motif
· motif · 51322448–51322460 · motif
· motif · 51322858–51322866 · motif
· motif · 51323499–51323515 · motif
· motif · 51323523–51323539 · motif
· motif · 51323720–51323742 · motif
· motif · 51323720–51323742 · motif
· motif · 51324050–51324059 · motif
· motif · 51324090–51324103 · motif
· motif · 51324110–51324123 · motif
· motif · 51324110–51324123 · motif
· motif · 51324136–51324151 · motif
· motif · 51324143–51324151 · motif
· motif · 51324164–51324175 · motif
· motif · 51324164–51324175 · motif
· motif · 51324194–51324203 · motif
· motif · 51326698–51326720 · motif
· motif · 51326698–51326720 · motif
· motif · 51326850–51326863 · motif
· motif · 51326862–51326875 · motif
· motif · 51326947–51326955 · motif
· motif · 51326997–51327008 · motif
· motif · 51327000–51327015 · motif
· motif · 51327005–51327017 · motif
· motif · 51327064–51327075 · motif
· motif · 51327202–51327211 · motif
BIN2 的表現會在單核細胞分化期間上調。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：565 aa
BIN2 蛋白質長 565 個胺基酸。其第 28 至 244 位胺基酸區段註記為 BAR domain；第 267 至 565 位則註記為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
BIN2 可與富含 phosphoinositides 的膜結合，並曾在遷移細胞前緣富含 actin 的細胞皮質，以及 podosomes 的環狀富 actin 結構中被偵測到。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
未繪示構造：Cell projection, podosome membrane；Cell projection, phagocytic cup。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- APPBP2Q92624 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BIN1O00499 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
BIN2 可形成同源二聚體，並與 BIN1、SH3GL1、SH3GL2 及 SH3GL3 互作；它也可透過 ARHGEF6 與 ARHGEF7 的 SH3 domain 互作。另有資料指出 BIN2 與 ARHGEF6、GIT2 一同出現在複合體中。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | BIN2 促進細胞移動與遷移，這可能是透過與細胞膜及 podosome 蛋白質互動而發生；這些蛋白質可介導與細胞骨架的連結。BIN2 也調節膜曲率、介導膜小管形成、參與 podosome 形成，並抑制吞噬作用。 | 含實驗來源 | 證據與來源Promotes cell motility and migration, probably via its interaction with the cell membrane and with podosome proteins that mediate interaction with the cytoskeleton. Modulates membrane curvature and mediates membrane tubulation. Plays a role in podosome formation. Inhibits phagocytosis PMID 23285027 ↗ |
| 交互作用 | BIN2 可形成同源二聚體，並與 BIN1、SH3GL1、SH3GL2 和 SH3GL3 互作；也可透過 SH3 domain 與 ARHGEF6、ARHGEF7 互作。此外，BIN2 曾被辨識為含 ARHGEF6 與 GIT2 的複合體成員。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homodimer. Interacts with BIN1. Interacts with ARHGEF6 (via SH3 domain), ARHGEF7 (via SH3 domain), SH3GL1, SH3GL2 and SH3GL3. Identified in a complex with ARHGEF6 and GIT2 PMID 10903846 ↗ · PMID 23285027 ↗ |
| 細胞定位 | BIN2 位於細胞質、細胞皮質、吞噬杯，以及 podosome 膜的細胞質側，並可作為周邊膜蛋白與富含 phosphoinositides 的膜結合。遷移細胞前緣的富 actin 細胞皮質及 podosome 的環狀富 actin 結構中也可偵測到 BIN2。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cytoplasm; Cell projection, podosome membrane / Peripheral membrane protein / Cytoplasmic side; Cytoplasm, cell cortex; Cell projection, phagocytic cup; Associates with membranes enriched in phosphoinositides. Detected in the actin-rich cell cortex at the leading edge of migrating cells. Detected at podosomes, at an actin-rich ring-like structure PMID 23285027 ↗ |
| 調控 | BIN2 的表現會在單核細胞分化期間上調。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
ACTTCCTCCTCGGGGGCCTCAGAAAACCACAGGGCGCGGG40GCCAGGGCGGCGGCCCCCAGGGAGTTGGCAGGATGGCAGA80GGGCAAGGCAGGCGGCGCGGCCGGCCTCTTCGCCAAGCAG120GTGCAGAAGAAGTTTAGCAGGGCCCAGGAGAAGGTGCTGC160AGAAATTGGGGAAAGCTGTAGAAACCAAAGATGAACGATT200TGAACAAAGCGCTAGCAACTTCTACCAACAACAGGCAGAA240GGCCACAAGCTGTACAAGGACCTGAAGAACTTCCTTAGTG280CAGTCAAAGTGATGCATGAAAGTTCAAAAAGAGTGTCAGA320AACCCTGCAGGAGATCTACAGCAGCGAGTGGGACGGTCAT360GAGGAGCTGAAGGCCATCGTATGGAATAATGATCTCCTTT400GGGAAGACTACGAGGAGAAACTGGCTGACCAGGCTGTAAG440GACCATGGAAATCTATGTTGCCCAGTTCAGTGAAATTAAG480GAGAGAATTGCCAAGCGGGGTCGGAAACTCGTGGACTATG520ACAGTGCCCGACACCACCTGGAGGCAGTGCAGAATGCCAA560GAAGAAAGATGAGGCCAAGACTGCCAAGGCAGAGGAAGAG600TTCAACAAAGCCCAGACTGTGTTTGAAGATCTGAACCAAG640AACTACTAGAGGAGCTGCCTATTCTTTATAATAGTCGTAT680TGGCTGCTATGTGACCATCTTCCAAAACATTTCCAACTTG720AGGGATGTCTTCTACAGGGAAATGAGCAAGCTGAACCACA760ATCTCTACGAGGTGATGAGCAAACTGGAGAAGCAACATTC800CAATAAAGTCTTTGTGGTGAAGGGACTGTCAAGCAGCAGC840AGGCGCTCTTTAGTCATTTCTCCCCCAGTTCGAACAGCTA880CAGTCTCCAGTCCTCTTACCTCACCTACTAGTCCCTCTAC920ACTTTCCTTGAAGAGTGAGAGTGAATCTGTCTCAGCAACT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。