演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

BIKNBK

BCL2 interacting killer

BIK(BCL2 interacting killer)是蛋白質編碼基因,其產物可加速程序性細胞死亡;與特定凋亡抑制蛋白結合時,此促死亡作用會受到抑制。

Homo sapiens22q13.2UniProt Q13323
OFFICIAL SYMBOL
BIK
CHROMOSOME
22
UNIPROT
Q13323
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

BIK 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 BCL2 interacting killer。其產物是參與程序性細胞死亡調控的蛋白質,具有 BH3 motif,並含有跨膜區域及 leucine-zipper 區域。這些序列特徵與其作為膜相關蛋白質的性質相符;來源指出該蛋白可定位於內膜系統與粒線體膜。BIK 的功能受到凋亡調控因子影響,與若干凋亡抑制蛋白的關聯可降低其促死亡活性。

Official symbol
BIK
Gene name
BCL2 interacting killer
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:1051
UniProt
Q13323
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
NBK

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 2222q13.2
chr22 · 50,818,468 bp · GRCh38chr22p13 · 1–4300000 · gvarchr22p12 · 4300001–9400000 · stalkchr22p11.2 · 9400001–13700000 · gvarchr22p11.1 · 13700001–15000000 · acenchr22q11.1 · 15000001–17400000 · acenchr22q11.21 · 17400001–21700000 · gnegchr22q11.22 · 21700001–23100000 · gpos25chr22q11.23 · 23100001–25500000 · gnegchr22q12.1 · 25500001–29200000 · gpos50chr22q12.2 · 29200001–31800000 · gnegchr22q12.3 · 31800001–37200000 · gpos50chr22q13.1 · 37200001–40600000 · gnegchr22q13.2 · 40600001–43800000 · gpos50chr22q13.31 · 43800001–48100000 · gnegchr22q13.32 · 48100001–49100000 · gpos50chr22q13.33 · 49100001–50818468 · gnegBIKpq1 bp50,818,468 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr22:43,110,742–43,129,712
Gene span
18,971 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000216115 ★43,110,750–43,129,7125
ENST0000091066543,110,742–43,129,7127
ENST0000091066743,110,742–43,129,7126
ENST0000091066943,110,742–43,129,7125
ENST0000091805143,110,742–43,129,7124
ENST0000091805243,110,742–43,129,7126
ENST0000095670743,110,742–43,129,7125
ENST0000113244243,110,742–43,129,7125

顯示 8/8 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

BIK 可加速程序性細胞死亡,具有促進細胞死亡的作用。來源並指出,這項活性會受到特定凋亡抑制蛋白的調節,顯示 BIK 的促死亡作用並非不受其他蛋白質影響。

當 BIK 與 Bcl-X(L)、BHRF1、Bcl-2,或腺病毒同源蛋白 E1B 19k protein 相關聯時,其促死亡活性會受到抑制。來源描述的是這些關聯對 BIK 活性的抑制效果,並未進一步提供作用步驟或調節發生的細胞條件,因此不宜延伸推定其分子機制。

BIK 不與 BAX 互作。這項資訊界定了其已知互作關係的範圍;不能據此推論 BIK 對 BAX 的功能或其他未載明的細胞死亡路徑具有直接調控作用。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 43110750 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>BIK ENST00000216115 GRCh38 chr22:43109750-43110850 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CCAACAGGTAGCAAACGACAGAGCTGGGGGAGGGGAACCCCTGTCCCTGCCCCTCCCCTAATCTCTGAGG
GGATCAAGACAGAAGTAAACAAGCTTTGCCGTGCCCAGGACAATTGTTACTTTGTTATTCCAGGAGCGCT
CTGCCTTCTCCCACCCCCAATATACCCCAGGGCTGGAGTTAGGTCCTACCCATCCCCGCGTAGCAGGCTG
CCCACCCGCCCACCCCGCCTGGAAGCTTTCTGATTTCTCTGTTCGCCCCGCCAGGCGCTGTGGGGTCCGT
CTCACCAGGTCTGCACGTGAGCCCCCTGCCCCCAATCCCTCCCAGTCCCGCCCGCCTCTCGCGGACCCGG
AGCCCCGACGGGAGGGGGAAGGCAGTGGGTGTGTCATGCAGCTGGAAGGCTGCGGACGGGCGGCAGTGGA
GGGGCAGCCCCCTGGCTTCGGGTATGGATCACTGGATGCTGCTGCTAACCAAATGTGAACCTCGGTTTTC
ATATTTGTGAAATAGGCTTTAAAACACCTAAATCCCAAAGCTGCCAGCCTAAGGAGCACACGTCTTTGAA
CGCTGGCTTCACGCTGTCATTTAAGTCATTTCGTCCTCTTGGAGCCTCGGTTTCCACGTGGGTAAAATGA
TCGTGAAAAAAAGCACCGAGGAGTACTTTGAGCTCGAACGGAGGCCATCCGTGTAAAGGGCCAGATTCTG
TCAATGGATCGATCCCCCCGATATTGATGGAAACCCCTGAGTGCACGCCCGTGCTGGGCGCAGGGGAAAC
AGCGACGCACGGGACAAAACAAGCTTGCAGAACAGCAGGGGGCAGAGAGGCTGTAAACAAGCCAACGGGC
TGCACTTGTAGCGGTTCTGTTGCCAATGCCATTCAGACCCCAGTCCGGGATTCCGCGCTCGGGGTGCGAG
AGGCCGCTCCCGGGGAGGGGCGGGACCCGGGCGGGGCGGGAGGGGCGGGGCGCCCGGGCCTATTAGGTCC
CGCGCCGGCAGCCGGGCCGCAGACACGAAGCCTCCCGGGTGGCTTACAGACGCTGCCAGCATCGCCGCCG
CCAGGTGAGTGCCCCCGACCCTGCTGCCGCCCGCTGCTCCGCCCAGCTCGA
BIK 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
BIK_1 ↗22:43,110,750正股43,110,701–43,110,760

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR22_9M524 · promoter · 43110260–43110760 · regulatory

ENSR22_5D5R3W · CTCF_binding_site · 43110547–43110568 · regulatory

ENSR22_C69HK · enhancer · 43110761–43111816 · regulatory

ENSR22_5D5R9N · CTCF_binding_site · 43111796–43111817 · regulatory

ENSR22_9M534 · enhancer · 43113724–43114089 · regulatory

ENSR22_BBK2P · enhancer · 43114810–43115336 · regulatory

· motif · 43110041–43110050 · motif

· motif · 43110041–43110050 · motif

· motif · 43110549–43110565 · motif

· motif · 43111389–43111402 · motif

· motif · 43111416–43111425 · motif

· motif · 43111465–43111480 · motif

· motif · 43111483–43111492 · motif

· motif · 43111798–43111814 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:160 aa

1 aa160 aa功能區域基序跨膜區
依 Q13323 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

BIK 蛋白質長 160 個胺基酸。其 BH3 motif 位於第 57–71 位胺基酸;另有一段標註為 leucine-zipper 的區域,位於第 137–158 位。第 136–156 位則被註記為螺旋型跨膜區域。

跨膜區Helical136–156 aa
功能區域Leucine-zipper137–158 aa
基序BH357–71 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q13323…

AlphaFold · Q13323

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Endomembrane system;Mitochondrion membrane

BIK 被記載位於內膜系統與粒線體膜,兩處均標示為單次跨膜蛋白質;另有資料描述其位於核膜周圍及細胞質膜。 來源未說明不同位置間的轉換條件或定位動態。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

未繪示構造:Endomembrane system。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 50 個夥伴 · 最多顯示 50 個
NBKBIKADGRE2ADIPOQAIG1ALG8ANKRD46APODARLNBCL2BCL2A1BCL2L1BCL2L1BCL2L10BCL2L2BMP10BNIP3BRICD5BTN2A2C2CD2LCACNG1CD53CD72CLDN19CMTM5CMTM7CNIH1CNIH3CTXN3CYB561CYB5BELOVL4ERGIC3EXOC3L2FAM209AFAM241BFAM3CFATE1FCGR1AGIMAP1GPX8GRM2INSIG2KCNN4MARCHF5MS4A13NAT8NRACNRMPBX3PGAP2PGRMC1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 92 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

來源記載 BIK 與 RHBDL4(亦稱 RHBDD1)及 BCL2L10(亦稱 BCL-B)互作。資料僅列出互作關係,未說明這些蛋白是否形成特定複合體,亦未提供互作對 BIK 功能的影響。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能BIK 可加速程序性細胞死亡;與凋亡抑制蛋白 Bcl-X(L)、BHRF1、Bcl-2 或腺病毒同源蛋白 E1B 19k protein 相關聯時,BIK 的促死亡活性會受到抑制。來源也指出 BIK 不與 BAX 互作。含實驗來源
證據與來源

Accelerates programmed cell death. Association to the apoptosis repressors Bcl-X(L), BHRF1, Bcl-2 or its adenovirus homolog E1B 19k protein suppresses this death-promoting activity. Does not interact with BAX

PMID 8521816 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用BIK 與 RHBDL4(亦稱 RHBDD1)互作;來源也記載 BIK 與 BCL2L10(亦稱 BCL-B)互作,但未提供這些互作的功能效果或複合體資訊。含實驗來源
證據與來源

Interacts with RHBDL4/RHBDD1. Interacts with BCL2L10/BCL-B

PMID 18953687 ↗ · PMID 23235460 ↗ · PMID 23563182 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位BIK 被記載為單次跨膜蛋白質,定位於內膜系統及粒線體膜;另有描述指出其位於核膜周圍與細胞質膜。來源未說明這些定位是否隨條件改變。含實驗來源
證據與來源

Endomembrane system / Single-pass membrane protein; Mitochondrion membrane / Single-pass membrane protein; Around the nuclear envelope, and in cytoplasmic membranes

PMID 8816500 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000216115 · 951 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGACACGAAGCCTCCCGGGTGGCTTACAGACGCTGCCAGC40
41ATCGCCGCCGCCAGAGGAGAAATGTCTGAAGTAAGACCCC80
81TCTCCAGAGACATCTTGATGGAGACCCTCCTGTATGAGCA120
121GCTCCTGGAACCCCCGACCATGGAGGTTCTTGGCATGACT160
161GACTCTGAAGAGGACCTGGACCCTATGGAGGACTTCGATT200
201CTTTGGAATGCATGGAGGGCAGTGACGCATTGGCCCTGCG240
241GCTGGCCTGCATCGGGGACGAGATGGACGTGAGCCTCAGG280
281GCCCCGCGCCTGGCCCAGCTCTCCGAGGTGGCCATGCACA320
321GCCTGGGTCTGGCTTTCATCTACGACCAGACTGAGGACAT360
361CAGGGATGTTCTTAGAAGTTTCATGGACGGTTTCACCACA400
401CTTAAGGAGAACATAATGAGGTTCTGGAGATCCCCGAACC440
441CCGGGTCCTGGGTGTCCTGCGAACAGGTGCTGCTGGCGCT480
481GCTGCTGCTGCTGGCGCTGCTGCTGCCGCTGCTCAGCGGG520
521GGCCTGCACCTGCTGCTCAAGTGAGGCCCCGGCGGCTCAG560
561GGCGGGGCTGGCCCCACCCCCATGACCACTGCCCTGGAGG600
601TGGCGGCCTGCTGCTGTTATCTTTTTAACTGTTTTCTCAT640
641GATGCCTTTTTATATTTAAACCCCGAGATAGTGCTGGAAC680
681ACTGCTGAGGTTTTATACTCAGGTTTTTTGTTTTTTTTTT720
721ATTCCAGTTTTCGTTTTTTCTAAAAGATGAATTCCTATGG760
761CTCTGCAATTGTCACCGGTTAACTGTGGCCTGTGCCCAGG800
801AAGAGCCATTCACTCCTGCCCCTGCCCACACGGCAGGTAG840
841CAGGGGGAGTGCTGGTCACACCCCTGTGTGATATGTGATG880
881CCCTCGGCAAAGAATCTACTGGAATAGATTCCGAGGAGCA920
921GGAGTGCTCAATAAAATGTTGGTTTCCAGCA951

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。