演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

BID

BH3 interacting domain death agonist

BID(BH3 interacting domain death agonist)是促凋亡蛋白,可在切割後轉位至粒線體並促進 caspase 活化。

Homo sapiens22q11.21UniProt P55957
OFFICIAL SYMBOL
BID
CHROMOSOME
22
UNIPROT
P55957
PDB / ALPHAFOLD
2BID
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

BID(BH3 interacting domain death agonist)是由蛋白質編碼基因 BID 產生的蛋白質,含有 BH3 motif。來源資料將它描述為參與細胞凋亡的因子,並指出其活性與切割及粒線體轉位有關。

Official symbol
BID
Gene name
BH3 interacting domain death agonist
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:1050
UniProt
P55957
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HGNC 未提供其他基因異名。

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 2222q11.21
chr22 · 50,818,468 bp · GRCh38chr22p13 · 1–4300000 · gvarchr22p12 · 4300001–9400000 · stalkchr22p11.2 · 9400001–13700000 · gvarchr22p11.1 · 13700001–15000000 · acenchr22q11.1 · 15000001–17400000 · acenchr22q11.21 · 17400001–21700000 · gnegchr22q11.22 · 21700001–23100000 · gpos25chr22q11.23 · 23100001–25500000 · gnegchr22q12.1 · 25500001–29200000 · gpos50chr22q12.2 · 29200001–31800000 · gnegchr22q12.3 · 31800001–37200000 · gpos50chr22q13.1 · 37200001–40600000 · gnegchr22q13.2 · 40600001–43800000 · gpos50chr22q13.31 · 43800001–48100000 · gnegchr22q13.32 · 48100001–49100000 · gpos50chr22q13.33 · 49100001–50818468 · gnegBIDpq1 bp50,818,468 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr22:17,734,138–17,774,770
Gene span
40,633 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000622694 ★17,734,138–17,774,4696
ENST0000031736117,734,138–17,774,0166
ENST0000061494917,734,138–17,774,4955
ENST0000039976517,734,138–17,774,4894
ENST0000039976717,734,138–17,774,4955
ENST0000055195217,734,138–17,774,6656
ENST0000089084417,734,138–17,774,5396
ENST0000089084517,734,138–17,774,4956
ENST0000089084617,734,138–17,774,4916
ENST0000089084717,734,138–17,773,9837
ENST0000089084817,734,138–17,773,9836
ENST0000089084917,734,138–17,774,7466

顯示 12/25 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

BID 可促進 caspase 活化與細胞凋亡;相關資料亦以 ICE-like proteases 描述其促進的蛋白酶活性。另有一筆資料指出 BID 可抵消 BCL2 的保護作用,但此項註記標示為 By similarity,屬相似性推論,不應視為同等程度的直接證據。來源亦有「不誘導細胞凋亡」的記錄,因此其功能敘述並非所有條目都一致,不能據此概括為在所有情境下均會促進凋亡。

切割後,BID 會轉位至粒線體,並破壞粒線體外膜,促使 cytochrome c 釋出;這些事件與 caspase 活化及凋亡相連。現有資料未提供促成切割的條件或完整分子步驟,因此不宜進一步推定其上游調控機制。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 17774469 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>BID ENST00000622694 GRCh38 chr22:17774369-17775469 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AAAGGAACTTGGCTTTTATTCAGAGGATGTTAAAGCGTGAGTGACATCCTCTGACCTTTTATAAAAGAGG
CAAGAGTCTAGGGAGCCCGGGTAGAAGTGAGGGCGTCTGGAGGAGCCACAGTGGGCTCAGGGAGTGAGCC
CACGCGAGGGCGCAGAGCAACTGGACGCTCCAACAGGGCTGGTGGAAGTGCCGAACGGTGTGCATCACCT
TGGAAAGCAGGCAGTTTTTAATACCATGAAGCTCGTCCAGCCCTATGATTCGCATTTCCACTCCTAGGTA
TCACACTCAAGAGAAGTGAAGACGCCCACAAAGGGCTCTGCAGCAGCACTGCCGGTGAGAGCTGCATCCG
GGGATGCATGGACTGGCCTGTCATTCCAGCACCTTGGGAGGCCGAGGTGGGAAGCATCGCTGGAGCCCAG
GAGTTCGAGACCAGCCTGAGACCTCCAGAGGTGGAGACCCCCCCCCCACCACCTCCACTAAAAACTGAAA
AAGAAATTAGTTGGGTGTGGTGTGCGCCTGTAGTCCCAGCATTATCTATATGTTAAACTGATGTTTTAAA
TCAGAGTTGATATCCAAATAATTAAAGAATAAACAACAAGCACAGGGACTGGTGAGGGGCTGGGCCAGAT
TCTCTGCAACCCACATGGCTTCACCCACTTTCCAAACCCCTGGTTCCGTGAGGACCTAGAATGACCACCC
CAGACTGTTCCAGAAACAGCCTGGGGATTCTGAATGTTTCCCAGAGAATCATTAGGAATTATCCCAGCGG
CGCTGGAGTAAGTGGCCAACTTAAAGTTGGACGACACTGTCTGAAACAGTCGCGTAAGGGGTAAGGGTGG
AAAGCCTGGTTCTCACTGCGCTGCCGGCTCCCCGCCCCGCTCCACAGCCCCGCGCCGGCGCGGGCTCCCC
GGGTCCCCGCAAGCCGCCGGGGGCGGGCCGGGGCGGGCCGGGGCGGGCCCGGGCGTGGGGGGCCGAAGGA
GGAAGCGCGCGGGGCGCCATAAGGAGGAAGCGGGTAGTCGACCGTGTCCGCGCGCCTGGGAGACGCTGCC
TCGGCCCGGACGCGCCCGCGCCCCCGCGGCTGGAGGGTGGTGAGTGCACCC
BID 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
BID_1 ↗22:17,774,469負股17,774,459–17,774,518

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR22_DTRS · enhancer · 17771509–17774005 · regulatory

ENSR22_B5J8J · promoter · 17774006–17774920 · regulatory

ENSR22_993HC · enhancer · 17775293–17775599 · regulatory

ENSR22_B5J8X · promoter · 17777019–17777600 · regulatory

ENSR22_993J3 · enhancer · 17777601–17778102 · regulatory

ENSR22_B5J95 · enhancer · 17778343–17778863 · regulatory

ENSR22_B5J9B · enhancer · 17779467–17780012 · regulatory

· motif · 17770293–17770305 · motif

· motif · 17770414–17770425 · motif

· motif · 17770416–17770427 · motif

· motif · 17770671–17770684 · motif

· motif · 17771542–17771553 · motif

· motif · 17771542–17771553 · motif

· motif · 17771542–17771555 · motif

· motif · 17771577–17771597 · motif

· motif · 17771688–17771701 · motif

· motif · 17771724–17771737 · motif

· motif · 17771730–17771743 · motif

· motif · 17771840–17771849 · motif

· motif · 17771846–17771859 · motif

· motif · 17771960–17771972 · motif

· motif · 17772029–17772042 · motif

· motif · 17772029–17772042 · motif

· motif · 17773100–17773115 · motif

· motif · 17773101–17773112 · motif

· motif · 17773108–17773115 · motif

· motif · 17773319–17773332 · motif

· motif · 17773319–17773332 · motif

· motif · 17773418–17773426 · motif

· motif · 17773667–17773674 · motif

· motif · 17773766–17773779 · motif

· motif · 17773766–17773779 · motif

· motif · 17773774–17773781 · motif

· motif · 17773868–17773885 · motif

· motif · 17773947–17773960 · motif

· motif · 17774232–17774239 · motif

· motif · 17774324–17774336 · motif

· motif · 17774326–17774333 · motif

· motif · 17774390–17774403 · motif

· motif · 17774441–17774457 · motif

· motif · 17774458–17774471 · motif

· motif · 17774541–17774556 · motif

· motif · 17774581–17774597 · motif

· motif · 17774971–17774991 · motif

· motif · 17776871–17776882 · motif

· motif · 17776918–17776933 · motif

· motif · 17776923–17776935 · motif

· motif · 17776926–17776933 · motif

· motif · 17776979–17776994 · motif

· motif · 17777238–17777249 · motif

· motif · 17777238–17777249 · motif

· motif · 17777238–17777251 · motif

· motif · 17777270–17777279 · motif

· motif · 17777447–17777462 · motif

· motif · 17777455–17777462 · motif

· motif · 17777524–17777536 · motif

· motif · 17777579–17777592 · motif

· motif · 17777658–17777671 · motif

· motif · 17779365–17779372 · motif

· motif · 17779452–17779463 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:195 aa

1 aa195 aa基序
依 P55957 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

BID 蛋白長 195 個胺基酸,序列註解標示一段 BH3 motif,位置為第 86 至 100 個胺基酸。

基序BH386–100 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 2BID…

PDB · 2BID

NMR · - · A=1-195

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm;Mitochondrion membrane;Mitochondrion outer membrane

未切割的 BID 主要位於細胞質;切割後可轉位至粒線體膜。 不同異構型的定位有所差異:Isoform 1 與 Isoform 3 位於細胞質,而 Isoform 2 有相當比例位於粒線體,且可能持續遭切割。 p15 形式在切割後轉位至粒線體;p13 形式則與粒線體膜相關。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 12 個夥伴 · 最多顯示 50 個
BIDBIDAHCYL1BAK1BAXBCL2BCL2L1BCL2L2CAV1DDIT4LMCL1RELBcl2a1OPG035
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 12 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

BID 可與促凋亡蛋白 BAX 或抗凋亡蛋白 BCL2 形成異源二聚體,此項記錄為 By similarity。另有直接互作紀錄包括 PLEKHN1 與 ITCH;與 MTCH2 的互作同樣標示為 By similarity。BID 也會與 humanin 互作並形成纖維,使 BID 發生構形變化並被纖維滯留,從而阻止 BID 活化;humanin 與 BID 的互作亦被報告可抑制 BID 誘導的凋亡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

13 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 13 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能BID 可誘導 caspase 活化並促進細胞凋亡;另有相似性推論指出,它能抵消 BCL2 的保護作用。含實驗來源
證據與來源

Induces caspases and apoptosis. Counters the protective effect of BCL2 (By similarity)

PMID 14583606 ↗

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功能BID 可促進 caspase 活化與細胞凋亡。切割後,BID 轉位至粒線體並破壞粒線體外膜,導致 cytochrome c 釋出。含實驗來源
證據與來源

Induces caspase activation and apoptosis. Translocates to mitochondria following cleavage and disrupts the outer mitochondrial membrane leading to the release of cytochrome c

PMID 10480954 ↗ · PMID 15661737 ↗ · PMID 32029622 ↗ · PMID 9727491 ↗

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功能BID 可誘導 ICE-like proteases,並促進細胞凋亡。含實驗來源
證據與來源

Induces ICE-like proteases and apoptosis

PMID 14583606 ↗

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功能此筆註記指出 BID 不會誘導細胞凋亡。含實驗來源
證據與來源

Does not induce apoptosis

PMID 14583606 ↗

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交互作用BID 可與促凋亡蛋白 BAX 或抗凋亡蛋白 BCL2 形成異源二聚體;此項為相似性推論。另有 BID 與 PLEKHN1 互作的記錄。含實驗來源
證據與來源

Forms heterodimers either with the pro-apoptotic protein BAX or the anti-apoptotic protein BCL2 (By similarity). Interacts with PLEKHN1

PMID 29531808 ↗

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交互作用BID 與 humanin 互作並形成纖維;此過程使 BID 發生構形變化並被滯留於纖維中,因而阻止 BID 活化。含實驗來源
證據與來源

Interacts with humanin; forms fibers with humanin which results in BID conformational changes and sequestering of BID into the fibers, preventing BID activation

PMID 15661737 ↗ · PMID 33106313 ↗

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交互作用BID 與 ITCH 及 humanin 互作;humanin 的互作可阻止 BID 誘導的細胞凋亡。BID 與 MTCH2 的互作則為相似性推論。含實驗來源
證據與來源

Interacts with ITCH. Interacts with humanin; the interaction prevents BID-induced apoptosis. Interacts with MTCH2 (By similarity)

PMID 15661737 ↗ · PMID 20392206 ↗

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細胞定位BID 可位於細胞質、粒線體膜及粒線體外膜;未切割時主要分布於細胞質。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm; Mitochondrion membrane; Mitochondrion outer membrane; When uncleaved, it is predominantly cytoplasmic

PMID 14583606 ↗ · PMID 29531808 ↗

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細胞定位BH3-interacting domain death agonist p15 位於粒線體膜,並在切割後轉位至粒線體。含實驗來源
證據與來源

BH3-interacting domain death agonist p15; Mitochondrion membrane; Translocates to mitochondria following cleavage

PMID 9727491 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位BH3-interacting domain death agonist p13 與粒線體膜相關。推論支持
證據與來源

BH3-interacting domain death agonist p13; Mitochondrion membrane; Associated with the mitochondrial membrane

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位BID 的 Isoform 1 位於細胞質。含實驗來源
證據與來源

Isoform 1; Cytoplasm

PMID 14583606 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位BID 的 Isoform 3 位於細胞質。含實驗來源
證據與來源

Isoform 3; Cytoplasm

PMID 14583606 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位BID 的 Isoform 2 有相當比例定位於粒線體,且可能持續遭切割。含實驗來源
證據與來源

Isoform 2; Mitochondrion membrane; A significant proportion of isoform 2 localizes to mitochondria, it may be cleaved constitutively

PMID 14583606 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 13 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000622694 · 2,177 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AAGGAGGAAGCGGGTAGTCGACCGTGTCCGCGCGCCTGGG40
41AGACGCTGCCTCGGCCCGGACGCGCCCGCGCCCCCGCGGC80
81TGGAGGGTGGTCGCCACTGGGACACTGTGAACCAGGAGTG120
121AGTCGGAGCTGCCGCGCTGCCCAGGCCATGGACTGTGAGG160
161TCAACAACGGTTCCAGCCTCAGGGATGAGTGCATCACAAA200
201CCTACTGGTGTTTGGCTTCCTCCAAAGCTGTTCTGACAAC240
241AGCTTCCGCAGAGAGCTGGACGCACTGGGCCACGAGCTGC280
281CAGTGCTGGCTCCCCAGTGGGAGGGCTACGATGAGCTGCA320
321GACTGATGGCAACCGCAGCAGCCACTCCCGCTTGGGAAGA360
361ATAGAGGCAGATTCTGAAAGTCAAGAAGACATCATCCGGA400
401ATATTGCCAGGCACCTCGCCCAGGTCGGGGACAGCATGGA440
441CCGTAGCATCCCTCCGGGCCTGGTGAACGGCCTGGCCCTG480
481CAGCTCAGGAACACCAGCCGGTCGGAGGAGGACCGGAACA520
521GGGACCTGGCCACTGCCCTGGAGCAGCTGCTGCAGGCCTA560
561CCCTAGAGACATGGAGAAGGAGAAGACCATGCTGGTGCTG600
601GCCCTGCTGCTGGCCAAGAAGGTGGCCAGTCACACGCCGT640
641CCTTGCTCCGTGATGTCTTTCACACAACAGTGAATTTTAT680
681TAACCAGAACCTACGCACCTACGTGAGGAGCTTAGCCAGA720
721AATGGGATGGACTGAACGGACAGTTCCAGAAGTGTGACTG760
761GCTAAAGCTCGATGTGGTCACAGCTGTATAGCTGCTTCCA800
801GTGTAGACGGAGCCCTGGCATGTCAACAGCGTTCCTAGAG840
841AAGACAGGCTGGAAGATAGCTGTGACTTCTATTTTAAAGA880
881CAATGTTAAACTTATAACCCACTTTAAAATATCTACATTA920
921ATATACTTGAATGAAAATGTCCATTTACACGTATTTGAAT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。