基因總覽
BDKRB1 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 bradykinin receptor B1。其產物屬於 G protein-coupled receptor 1 家族中的 bradykinin receptor 亞家族,並歸入 BDKRB1 次亞家族。這是一種多次穿越細胞膜的受體蛋白,具有跨膜螺旋及位於細胞膜兩側的區段,整體結構適合在膜上作為受體。其主要角色是辨識 bradykinin;來源亦指出,它可能是慢性疼痛與發炎的相關因素,但未進一步界定其作用方式或因果關係。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000216629 ★ | 96,256,210–96,264,763 | 3 |
| ENST00000553356 | 96,255,816–96,268,967 | 5 |
| ENST00000863471 | 96,255,816–96,264,820 | 2 |
| ENST00001140654 | 96,255,816–96,264,763 | 3 |
| ENST00000863472 | 96,261,342–96,264,758 | 2 |
| ENST00000611804 | 96,263,670–96,264,754 | 1 |
顯示 6/6 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
BDKRB1 的產物 bradykinin receptor B1 是 bradykinin 的受體。現有資料指出其受體角色,但未提供配體辨識後的分子作用步驟、下游訊息傳遞方式或具體調控機制,因此不宜據此延伸描述其他作用路徑。
資料亦將 BDKRB1 列為可能與慢性疼痛及發炎有關的因素。此處使用的是可能性描述,未說明其影響方向、發生條件或所涉及的生物學過程,也不足以判定該受體會直接造成慢性疼痛或發炎。
Promoter 與基因調控
>BDKRB1 ENST00000216629 GRCh38 chr14:96255210-96256310 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CCTCTAAGGCAAATTCCAGCTTCTTCCCTGAAATGTACATCCGCTACTGAGCCTCAGAATGCTATTTGTT CCACCTACTTCCACAGTTTTAAGGTCTTCAGCAACAGGAGAAGACAGCAGGAAAACTTGAAGTGCAGTTG GCTCCCGCTGAGATGTCACTAGCAGAAAAAGGGAACACAAGCAAAAGGCAAGATTCTAAAGACAGAGGTG ACACCTTCTGCTCCAAACATTTGGAGGGTCACCTTTCCAGAAGTCAGACTCGAAGTCCTGAATTCTGGCA TGAATGAGTTCTCCTACGTGTAGGGGGTGGCCTGGAAAGATCTTAATTTGTAAGTTGACAGGTAAGGGGC CTTCAGTTGGAGAATCTTGTCACCTGATTCTCAAAGCCAAAAATATCTTACTGTCTGAAACATGAGGTCT TGAGTAGTTCAACTTGACCCATGCAGACATAATTTGAGAGACGCCAAGGAGGATTAGGAAAAAATGTATC TGGTCTTACTCAACTCTGAACATTGCATGAGTCAAACGTTTTCCTAGCTCTCTGTTTGTGTGATGGGTCC ACTCTGATGGATTCTTGGCGATGTATCTTTCATGACCAAAATTCAAAAGAGGCCATTCGAAGTGGCTCCC ACAAAAGCTGCTGCAGAGCCCCAGACATTCAGAAGCCAATAGTGAAGGGGCCAAAAGCCATCCCTCAATG TTCACTGACACTTTGCGAGCCTTGGGGCAAGTTGGCGATGTCAAAACATGTTTTTAGGGCGTGTTTGCCA ACATACAGGTCTTGGGCAGGATTGCAGACCTCTGCAGATGGTACCAAAGTAAAGGGGGAGATGGTAGCTG AATAATCTCTTATCATCCCTAAAGTGCAAAGTGAAATGAGAGTGGATTTTTCCTTCCAAATCCACTTGGA GTGAGTCCCGAAAGACTCACTTTTGCGGCAATCCCCACAATGACATCACTGGAGCGGAGGTTATATAATT TAAAGCAACCACATCTCCACAGCACTTCCCAGAAGAGAAAACTCCTCCAAAAGCAGCTCTCACTATCAGA AAACCCAACTACAGTTGTGAACGCCTTCATTTTCTGCCTGAGTAAGTAAAT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| BDKRB1_1 ↗ | 14:96,256,210 | 正股 | 96,256,161–96,256,220 |
| BDKRB1_3 ↗ | 14:96,262,564 | 正股 | 96,262,515–96,262,574 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR14_93F7HT · enhancer · 96252396–96252693 · regulatory
ENSR14_BP4QJ · enhancer · 96253076–96253687 · regulatory
ENSR14_93F7JS · promoter · 96255720–96256220 · regulatory
ENSR14_77MS7P · enhancer · 96256221–96256328 · regulatory
ENSR14_93F7K3 · enhancer · 96256490–96256820 · regulatory
ENSR14_5SM9WG · CTCF_binding_site · 96256600–96256621 · regulatory
ENSR14_BP4RL · enhancer · 96260308–96260942 · regulatory
· motif · 96256602–96256618 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:353 aa
bradykinin receptor B1 長 353 個胺基酸,屬於 G protein-coupled receptor 1 家族的 bradykinin receptor 亞家族,並歸入 BDKRB1 次亞家族。蛋白質包含七段跨膜螺旋;其間的拓樸區段交錯分布於細胞外側與細胞質側,兩端區段亦分別位於細胞外側與細胞質側。
蛋白質三維結構
細胞內定位
BDKRB1 蛋白質位於細胞膜,並具有多次穿膜的拓樸特徵。 來源未提供會改變其定位的條件、定位動態或異構型間的定位差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 4 個夥伴
- KNG1P01042 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- RAMP1O60894 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- RAMP2O60895 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- RAMP3O60896 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | BDKRB1 的產物是 bradykinin 的受體;資料另指出,它可能是慢性疼痛與發炎的相關因素,但未說明其作用方向、機制或因果關係。 | 含實驗來源 | 證據與來源This is a receptor for bradykinin. Could be a factor in chronic pain and inflammation PMID 8063797 ↗ · PMID 8660997 ↗ |
| 細胞定位 | BDKRB1 蛋白質位於細胞膜,且屬於多次穿越膜的蛋白質。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
AGCACTTCCCAGAAGAGAAAACTCCTCCAAAAGCAGCTCT40CACTATCAGAAAACCCAACTACAGTTGTGAACGCCTTCAT80TTTCTGCCTGAGGTCTCAGTCCGTCGGCCCAGACTGAAGT120GCAGTGGCACAATCATAGCTCGCTGCAGCCTCGACCTTCC160AGGCTTAAACGATTCTCCCACCTCAGCCTCTCGAGTTGCT200GGGACCACAGGTCACTGTGCATGGCATCATCCTGGCCCCC240TCTAGAGCTCCAATCCTCCAACCAGAGCCAGCTCTTCCCT280CAAAATGCTACGGCCTGTGACAATGCTCCAGAAGCCTGGG320ACCTGCTGCACAGAGTGCTGCCAACATTTATCATCTCCAT360CTGTTTCTTCGGCCTCCTAGGGAACCTTTTTGTCCTGTTG400GTCTTCCTCCTGCCCCGGCGGCAACTGAACGTGGCAGAAA440TCTACCTGGCCAACCTGGCAGCCTCTGATCTGGTGTTTGT480CTTGGGCTTGCCCTTCTGGGCAGAGAATATCTGGAACCAG520TTTAACTGGCCTTTCGGAGCCCTCCTCTGCCGTGTCATCA560ACGGGGTCATCAAGGCCAATTTGTTCATCAGCATCTTCCT600GGTGGTGGCCATCAGCCAGGACCGCTACCGCGTGCTGGTG640CACCCTATGGCCAGCCGGAGGCAGCAGCGGCGGAGGCAGG680CCCGGGTCACCTGCGTGCTCATCTGGGTTGTGGGGGGCCT720CTTGAGCATCCCCACATTCCTGCTGCGATCCATCCAAGCC760GTCCCAGATCTGAACATCACCGCCTGCATCCTGCTCCTCC800CCCATGAGGCCTGGCACTTTGCAAGGATTGTGGAGTTAAA840TATTCTGGGTTTCCTCCTACCACTGGCTGCGATCGTCTTC880TTCAACTACCACATCCTGGCCTCCCTGCGAACGCGGGAGG920AGGTCAGCAGGACAAGGTGCGGGGGCCGCAAGGATAGCAA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。