基因總覽
BCRP5 是人類假基因（pseudogene），正式名稱為 BCR pseudogene 5。登錄類型為 pseudogene。此基因座位於 22q11.21。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000514371 ★ | 20,697,962–20,698,934 | 2 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
已知功能與來源註解
Promoter 與基因調控
>BCRP5 ENST00000514371 GRCh38 chr22:20698834-20699934 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GACTAAAAGGTACATTTTTAAAAAAGAGGTGACTTAAGATTTCATAGAAACCAACTTTTTGTAAAACTAT GATAAGCCAAATACTTGGACCAGCCCTCACACTGAGAAGTACCAAAAATGCTGACAAAATAAAAGGATGT TTTCTTAAAGGCATCCAGGGGCTGACAAGACAGTGAGGAGCCGCCAGGCACCATCTGGGGAAACCAGAAA CCAGAGAGGCGAGCCAAGCCGCTCTTGCCCTGAAAACATCTGCCCCCATCCAGCCACCCCGGGCTTCCGA TGAGAACTCTAAGGCTGGTCCCCACCCCACAGAGCACCCCACAGAATTTGGGACTTATGGCCCAAATTCA CACCAGTGAGAAGATTCCAAAACCTCACAGTTGATGGATTTAGTTTAAATTGGCTTTAGGCTGACAGCGC CCTGAGGTACCTGGCAGAAGGAAGCGTAAACCTAGTTTGGAGGAAGCATCTTTACCCTAGGTCTGAAAAA TTCCCACAAAGTCATTTTTCCAGGACAATGAGTAATGCAGTCAAAAGTAACCACACATTCACGGAAACAA TGCCCCATGAGCAAGGACAGAAAAGGCCAGCAGCAGGACCAGATCCAGAGACTCAACATCTCAAAGACCT GAGGCAGACCATGAGGCTCCTCCACTTACCTGTACTCACGGAGGGAACCGATGAGCTTGAAAGTATATGT GACGAACAGCAAACGAGAAAAAAAAATGACCTTGCAGAAAAACAGGTGTAGACATTCTAGAAATAAACAG CATTCAGCCCAATGGGTTTAACAGGAATAGGAGAATAAAAAGAGAATACCTACACTGAAGATACGTCAGA ATAAATTATGCTGAATAAAGAAGAGTGAGAGGCCGGGCGCATTGGCTCATAGCCAGGGTCGAGGTCACTC TCTCCCTGAGGACTCTAGCACGGCACAGCCCCTCTGCCTCTCTCCTGGTGGTGGCGTTGAAACAGCACCT TCTGCTTTGGTCCTCTACAGGGTGGCAGAGAAGGAGGCAGTCAATAAGATGTCCCTGCACAACCTTGCCA CTGTCTTTGGCCCCATGCTGCTCCGGCCCTCCGAGAAGGAGAGCAAGCTCC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄；不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR22_8LFKL · promoter · 20695504–20695643 · regulatory
ENSR22_737T6C · enhancer · 20695644–20695756 · regulatory
ENSR22_C43G7 · enhancer · 20697015–20698044 · regulatory
ENSR22_56TFZR · CTCF_binding_site · 20697715–20697736 · regulatory
ENSR22_8LFP9 · enhancer · 20701803–20701999 · regulatory
ENSR22_64FPTC · promoter · 20702000–20702035 · regulatory
ENSR22_B64X5 · enhancer · 20702036–20702617 · regulatory
ENSR22_9B7TD · promoter · 20702618–20702931 · regulatory
ENSR22_56TGSK · CTCF_binding_site · 20702630–20702651 · regulatory
ENSR22_C43GM · enhancer · 20702932–20704228 · regulatory
· motif · 20697450–20697465 · motif
· motif · 20697457–20697465 · motif
· motif · 20697717–20697733 · motif
· motif · 20702632–20702648 · motif
· motif · 20703171–20703184 · motif
· motif · 20703218–20703231 · motif
· motif · 20703297–20703310 · motif
· motif · 20703349–20703362 · motif
· motif · 20703594–20703607 · motif
基因座與轉錄註解
BCRP5 依 HGNC／Ensembl 分類為 pseudogene。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000514371 ★ | transcribed_unprocessed_pseudogene | 253 nt | 2 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總，單位為 nt；不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
DNA 與 RNA 序列
GGTGGCAGAGAAGGAGGCAGTCAATAAGATGTCCCTGCAC40AACCTTGCCACTGTCTTTGGCCCCATGCTGCTCCGGCCCT80CCGAGAAGGAGAGCAAGCTCCCTGCCAACCCCGGCCAGCC120CATCACCATGACTGACAGCTGGTCCTTGGAGGTCATGTCC160CAGGTCGAGGTGCTGCTGTACTTCTTGCGGCTGGAGGCCG200TCCCTGCCCCGGACAGCAAGGGACAGAGCATCCTGTTCTC240CACCGATGTCTAA253cDNA 使用 DNA 字母 T；RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。