基因總覽
BCR（BCR activator of RhoGEF and GTPase）是蛋白質編碼基因，產物為 1271 個胺基酸的蛋白質。其結構包含胺基端 kinase 區域，以及中央 DH、PH、C2 與羧基端 Rho-GAP domains；另有多段被註記為無序的區域。這種多區段架構與其調節小型 GTP 結合蛋白的角色相呼應：蛋白質不同區域可參與相反方向的調控，並具有胺基端 kinase 活性。以下功能說明著重於這些作用如何影響特定 GTPase 與細胞過程。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000305877 ★ | 23,180,509–23,318,037 | 23 |
| ENST00000359540 | 23,180,365–23,315,950 | 22 |
| ENST00000928586 | 23,180,365–23,318,037 | 23 |
| ENST00000928587 | 23,180,365–23,315,974 | 23 |
| ENST00000928588 | 23,180,365–23,315,955 | 23 |
| ENST00000958107 | 23,180,365–23,315,947 | 23 |
| ENST00000958108 | 23,180,365–23,315,955 | 21 |
| ENST00000958109 | 23,180,365–23,315,956 | 23 |
| ENST00001049287 | 23,180,365–23,315,953 | 22 |
| ENST00001113226 | 23,180,365–23,315,074 | 22 |
| ENST00001113227 | 23,180,365–23,255,048 | 2 |
| ENST00001127897 | 23,180,365–23,318,032 | 23 |
顯示 12/17 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
BCR 對小型 GTP 結合蛋白具有方向相反的調節作用。中央 DH domain 作為 guanine nucleotide exchange factor（GEF），促進 CDC42、RHOA 與 RAC1 由 GDP 結合型轉換為 GTP 結合型；相對地，羧基端 GAP domain 促進 RAC1、RAC2 與 CDC42 水解 GTP。對 RAC1 與 CDC42 而言，BCR 可加快其內在 GTP 水解速率，使活化的 GTP 結合型下降。因此，BCR 對不同 GTPase 的影響取決於其作用區域與所調節的分子，不能簡化為單一方向的活化或抑制。
BCR 的胺基端具有 intrinsic kinase activity。相關反應包括以 ATP 作為反應物，使蛋白質上的 serine 或 threonine 殘基磷酸化，並產生 ADP 與 H⁺。來源未進一步說明這項 kinase 活性與 GEF 或 GAP 調控之間的關係，因此不宜將它們描述為同一條機制。
在神經系統中，BCR 被描述為 RAC1 活性的負向調節者；此項功能標示為 By similarity，屬相似性推論。在巨噬細胞中，BCR 透過調節 RAC1 活性，參與 CSF1 引導的移動與吞噬作用。這些例子顯示，BCR 對 RAC1 的調節與不同細胞功能相關，但來源沒有提供可將這些作用一概而論的證據。
在角質形成細胞中，BCR 主要以 RHOA GEF 的角色參與 focal adhesion 形成與角質形成細胞分化。這些細胞過程與其促進 RHOA 由 GDP 結合型轉為 GTP 結合型的作用相連；但現有資料未進一步界定各過程中的完整分子步驟。整體而言，來源支持 BCR 兼具 GEF、GAP 與 kinase 活性，並在不同細胞情境中參與特定功能。
Promoter 與基因調控
>BCR ENST00000305877 GRCh38 chr22:23179509-23180609 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GCCGCCCCCTTAGAGGGAGGCTAATCAGGGAAGTTCTGAGTCAGGTCGTCCTGGAAAAACTACATTGACC TCTGGAGCTCAAGAGAGGCCAGGGGACAAACACATGGCTCAGCACACAGGAAGGCAGGTGTGGGTATTGA GTGACCTGAGGGAGAAATCCCTATTTATCATCCATCATGTGGTCCTGCTGTGACAAACCCGTGTGGCAGC CACCCACAGCAGATCCACAACGTGAGAGGCCCGCTGAAACAAGGGTGCTGGCATTGGTTACTCAGCCTGG CCCTCCCTGCCTTGCGGGGTGACCTGCCTGGTCCTGGCCTCTCTGTGAGTTGGGCCCTGCTGGGTGGTCC CTAGTGTGCCCAGCCCTGAGGCTGGTGAGAGGCCAGGCTGTGAGGTGTGAGGAACTTACCTGCGTCTCCA TGGAAGGTGCCCTCCGCATCGTTGGGCCAGATCTGCCTGGTCTTGCAGATGCCCACGATGGTGGCCTCTG ACACGACGACTGGGCAGTGCCGGTGACGCTTATGGCACTGCGGCGTGGTAGGGGCAGAGGGGGGAGGTTG CTTCTGTCGGAGGACTGCTGCGAGTTCTGCCAGAGAGAGCAGCTCTTGTCCCGGAACATGAGGTAGGTGG TGGGGCTTGGGGACACGCGGCTGGACTGGCCGGAGAAGTCCTCCTGGCCGGAGGGGAGCCAAGTGTTCCT GTTCCAGGACTGCAGAACTGGCCCAGACCTCTGTATTGGAAAGGTCTTTATGGACCAGGGAGTCCGGTGT CTTTTTTACGGGGGACCCCTGGGCTGCGAGTTGCACAGTCCAATTCGCTGTTGTTAGGGCCTCAGTTTCC CAAAAGGCACAGGGACGGGGGGAGGGTGGCGGCTCGATGGGGGAGCCGCCTCCAGGGGGCCCCCCCGCCC TGTGCCCACGGCGCGGCCCCTTTAAGAGGCCCGCCTGGCTCCGTCATCCGCGCCGCGGCCACCTCCCCCC GGCCCTCCCCTTCCTGCGGCGCAGAGTGCGGGCCGGGCGGGAGTGCGGCGAGAGCCGGCTGGCTGAGCTT AGCGTCCGAGGAGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCACGGCGGCGGCGGGGCTG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| BCR_2 ↗ | 22:23,179,606 | 正股 | 23,179,557–23,179,616 |
| BCR_1 ↗ | 22:23,180,827 | 正股 | 23,180,778–23,180,837 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR22_8NDQB · enhancer · 23176368–23176550 · regulatory
ENSR22_9C7DF · enhancer · 23177188–23177669 · regulatory
ENSR22_9C7DQ · enhancer · 23178367–23178874 · regulatory
ENSR22_57G7DF · CTCF_binding_site · 23178612–23178633 · regulatory
ENSR22_B6L7L · promoter · 23179875–23180519 · regulatory
· motif · 23176748–23176763 · motif
· motif · 23178614–23178630 · motif
· motif · 23179330–23179341 · motif
· motif · 23179423–23179436 · motif
· motif · 23179423–23179436 · motif
· motif · 23179570–23179582 · motif
· motif · 23179573–23179580 · motif
· motif · 23179573–23179588 · motif
· motif · 23180616–23180627 · motif
· motif · 23180812–23180825 · motif
· motif · 23180979–23180992 · motif
· motif · 23181117–23181128 · motif
· motif · 23181186–23181195 · motif
· motif · 23181526–23181538 · motif
· motif · 23182360–23182376 · motif
· motif · 23182360–23182376 · motif
· motif · 23182363–23182380 · motif
· motif · 23182705–23182720 · motif
· motif · 23182705–23182720 · motif
· motif · 23183386–23183397 · motif
· motif · 23183549–23183559 · motif
· motif · 23183628–23183636 · motif
· motif · 23183716–23183727 · motif
· motif · 23183716–23183727 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：1271 aa
BCR 蛋白質長 1271 個胺基酸。註解列出 DH（498–691）、PH（708–866）、C2（893–1020）與 Rho-GAP（1054–1248）domains；胺基端 1–426 為 kinase 區域。另有數段區域被註記為無序：67–173、185–247、286–392 與 416–476；197–385 區域則註記可結合 ABL SH2-domain。
蛋白質三維結構
細胞內定位
BCR 的定位資料列出突觸後密度、樹突棘、軸突與突觸。 這些位置資訊具有相似性推論證據；來源未提供定位改變的條件或不同異構型之間的差異。
未繪示構造：Postsynaptic density；Cell projection, dendritic spine；Cell projection, axon；Synapse。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 25 個夥伴
- APBA1Q02410 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- APBA2Q99767 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- DLG1Q12959 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DLG2Q15700 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- DLG3Q92796 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- DLG4P78352 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- FRMPD2Q68DX3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GRB2P62993 · UniProt INTERACTION · 11 experiments
- GRID2IPA4D2P6 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- GRIP1Q9Y3R0 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- GRIP2Q9C0E4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LNX2Q8N448 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- MAGI1Q96QZ7 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- MAGI2Q86UL8 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- MPDZO75970 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- NHERF4Q86UT5 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- PATJQ8NI35 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- PDZK1Q5T2W1 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- SCRIBQ14160 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SH2D5Q6ZV89-1 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- TNKS2Q9H2K2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- WHRNQ9P202 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- Sh2d5A2AM67 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- Sh2d5Q8JZW5 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- PTPN1P18031 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
BCR 形成 homotetramer。另有資料記載它與 PDZK1、FES/FPS、ABL1、PIK3R1、GRB2、HCK、SH2D5 及 DLG4 互作；與 CCPG1 的互作則標示為可能。來源未進一步區分這些互作是否直接結合或屬於同一複合體。
疾病與遺傳關聯
BCR 與慢性骨髓性白血病（CML）的疾病致病過程有關。資料指出，涉及 BCR 的染色體易位 t(9;22)(q34;q11) 與 ABL1 形成 BCR-ABL；此易位也見於急性骨髓性白血病（AML）及急性淋巴性白血病（ALL）。這些資訊描述疾病關聯與染色體異常，並未表示一般 BCR 本身即可造成上述疾病。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 7 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | BCR 對小型 GTP 結合蛋白具有相反調節作用：羧基端 GAP domain 促進 RAC1、RAC2 與 CDC42 的 GTP 水解，降低 RAC1 或 CDC42 的活化型；中央 DH domain 則促進 CDC42、RHOA 與 RAC1 由 GDP 結合型轉為 GTP 結合型。胺基端具 kinase 活性；BCR 亦參與神經元 RAC1 負向調節、巨噬細胞功能及角質形成細胞過程，神經元作用為相似性推論。 | 含實驗來源 | 證據與來源Protein with a unique structure having two opposing regulatory activities toward small GTP-binding proteins. The C-terminus is a GTPase-activating protein (GAP) domain which stimulates GTP hydrolysis by RAC1, RAC2 and CDC42. Accelerates the intrinsic rate of GTP hydrolysis of RAC1 or CDC42, leading to down-regulation of the active GTP-bound form. The central Dbl homology (DH) domain functions as guanine nucleotide exchange factor (GEF) that modulates the GTPases CDC42, RHOA and RAC1. Promotes the conversion of CDC42, RHOA and RAC1 from the GDP-bound to the GTP-bound form. The amino terminus contains an intrinsic kinase activity. Functions as an important negative regulator of neuronal RAC1 activity (By similarity). Regulates macrophage functions such as CSF1-directed motility and phagocytosis through the modulation of RAC1 activity. Plays a major role as a RHOA GEF in keratinocytes being involved in focal adhesion formation and keratinocyte differentiation PMID 1657398 ↗ · PMID 17116687 ↗ · PMID 1903516 ↗ · PMID 23940119 ↗ · PMID 7479768 ↗ |
| 分子活性 | L-seryl-[protein] + ATP = O-phospho-L-seryl-[protein] + ADP + H(+) | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | L-threonyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-threonyl-[protein] + ADP + H(+) | 含實驗來源 | |
| 交互作用 | BCR 形成 homotetramer。資料記載其與 PDZK1、FES/FPS、ABL1、PIK3R1、GRB2、HCK、SH2D5 及 DLG4 互作；與 CCPG1 的互作僅標示為可能，且屬相似性推論。來源沒有進一步界定這些互作的具體結合方式或是否同屬一個複合體。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homotetramer. Interacts with PDZK1. May interact with CCPG1 (By similarity). Interacts with FES/FPS, ABL1, PIK3R1 and GRB2. Interacts with HCK. Interacts with SH2D5. Interacts with DLG4 PMID 15302586 ↗ · PMID 15494376 ↗ · PMID 1712671 ↗ · PMID 20962234 ↗ · PMID 25331951 ↗ · PMID 9407116 ↗ |
| 細胞定位 | BCR 的定位註記包括突觸後密度、樹突棘、軸突與突觸。這些定位資訊來自相似性推論；該筆資料沒有指出特定定位條件、定位變化或異構型差異。 | 推論支持 | 證據與來源Postsynaptic density; Cell projection, dendritic spine; Cell projection, axon; Synapse |
| 疾病關聯 | BCR 被列為參與慢性骨髓性白血病（CML）致病過程的基因。該疾病描述為源自多能幹細胞的克隆性骨髓增生性疾患，具有 Philadelphia chromosome，並涉及髓系、紅系、巨核細胞及 B 淋巴細胞，有時也涉及 T 淋巴細胞，但不涉及骨髓纖維母細胞。 | 含實驗來源 | 證據與來源Leukemia, chronic myeloid CML A clonal myeloproliferative disorder of a pluripotent stem cell with a specific cytogenetic abnormality, the Philadelphia chromosome (Ph), involving myeloid, erythroid, megakaryocytic, B-lymphoid, and sometimes T-lymphoid cells, but not marrow fibroblasts. The gene represented in this entry is involved in disease pathogenesis MIM: 608232 PMID 2407300 ↗ · PMID 3107980 ↗ · PMID 3540951 ↗ |
| 疾病關聯 | 慢性骨髓性白血病患者中發現涉及 BCR 的染色體異常：t(9;22)(q34;q11) 與 ABL1 易位，並產生 BCR-ABL。資料也指出這項易位產物見於急性骨髓性白血病（AML）及急性淋巴性白血病（ALL），並未將一般 BCR 與疾病建立直接因果關係。 | 含實驗來源 | 證據與來源A chromosomal aberration involving BCR has been found in patients with chronic myeloid leukemia. Translocation t(9;22)(q34;q11) with ABL1. The translocation produces a BCR-ABL found also in acute myeloid leukemia (AML) and acute lymphoblastic leukemia (ALL) PMID 3107980 ↗ · PMID 7665185 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GCAGAGTGCGGGCCGGGCGGGAGTGCGGCGAGAGCCGGCT40GGCTGAGCTTAGCGTCCGAGGAGGCGGCGGCGGCGGCGGC80GGCACGGCGGCGGCGGGGCTGTGGGGCGGTGCGGAAGCGA120GAGGCGAGGAGCGCGCGGGCCGTGGCCAGAGTCTGGCGGC160GGCCTGGCGGAGCGGAGAGCAGCGCCCGCGCCTCGCCGTG200CGGAGGAGCCCCGCACACAATAGCGGCGCGCGCAGCCCGC240GCCCTTCCCCCCGGCGCGCCCCGCCCCGCGCGCCGAGCGC280CCCGCTCCGCCTCACCTGCCACCAGGGAGTGGGCGGGCAT320TGTTCGCCGCCGCCGCCGCCGCGCGGGCCATGGGGGCCGC360CCGGCGCCCGGGGCCGGGCTGGCGAGGCGCCGCGCCGCCG400CTGAGACGGGCCCCGCGCGCAGCCCGGCGGCGCAGGTAAG440GCCGGCCGCGCCATGGTGGACCCGGTGGGCTTCGCGGAGG480CGTGGAAGGCGCAGTTCCCGGACTCAGAGCCCCCGCGCAT520GGAGCTGCGCTCAGTGGGCGACATCGAGCAGGAGCTGGAG560CGCTGCAAGGCCTCCATTCGGCGCCTGGAGCAGGAGGTGA600ACCAGGAGCGCTTCCGCATGATCTACCTGCAGACGTTGCT640GGCCAAGGAAAAGAAGAGCTATGACCGGCAGCGATGGGGC680TTCCGGCGCGCGGCGCAGGCCCCCGACGGCGCCTCCGAGC720CCCGAGCGTCCGCGTCGCGCCCGCAGCCAGCGCCCGCCGA760CGGAGCCGACCCGCCGCCCGCCGAGGAGCCCGAGGCCCGG800CCCGACGGCGAGGGTTCTCCGGGTAAGGCCAGGCCCGGGA840CCGCCCGCAGGCCCGGGGCAGCCGCGTCGGGGGAACGGGA880CGACCGGGGACCCCCCGCCAGCGTGGCGGCGCTCAGGTCC920AACTTCGAGCGGATCCGCAAGGGCCATGGCCAGCCCGGGG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。