基因總覽
BCL7C 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 BAF chromatin remodeling complex subunit BCL7C。現有資料提供其基因名稱與染色體位置,但未進一步說明其 RNA 或蛋白質的基本性質、家族歸屬或主要角色。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000215115 ★ | 30,887,795–30,894,077 | 6 |
| ENST00001113557 | 30,818,695–30,894,302 | 6 |
| ENST00000380317 | 30,833,626–30,894,302 | 6 |
| ENST00001056994 | 30,850,979–30,894,302 | 6 |
| ENST00001056995 | 30,850,979–30,894,302 | 6 |
| ENST00001056996 | 30,850,979–30,894,302 | 7 |
| ENST00001056993 | 30,850,980–30,894,302 | 6 |
| ENST00000572628 | 30,851,246–30,893,942 | 6 |
| ENST00001000136 | 30,879,503–30,894,302 | 6 |
| ENST00001056997 | 30,879,503–30,894,302 | 6 |
| ENST00001000137 | 30,879,504–30,894,302 | 6 |
| ENST00000936619 | 30,887,795–30,894,302 | 6 |
顯示 12/18 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
現有註解提出,BCL7C 可能具有抗細胞凋亡作用;這項描述帶有不確定性,未提供作用機制、實驗條件或相關生物學過程的進一步細節。因此,目前只能將其視為可能的功能,不能據此確定 BCL7C 如何影響細胞凋亡。
Promoter 與基因調控
>BCL7C ENST00000215115 GRCh38 chr16:30893977-30895077 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GGCGATCACTATCTTGACTTTGGTGCACTATAAATTAGTTTTGTCTGGTTCTGAACGTAATACACCTGGA ACCATCTAGTATGTACTGTTGCATTTGGCTTCTGTCACTCAAGATTTCATCATGCGACTTGTCTATGTTG CTGTGTGTAGCCGGGCATGTCAATCCCGTTGCTGTGTCTATGTGCATGGTAGTGAGTAGGGCATCATTCA TTTTCCATTCTGTTGATGGGTTATTTCCAGTTTGGGGCTGTTATGAAAGGGCTCTGAACATTCCCATGCA CCCTCTTGATGCTCACACCTACACATTTCTGCTGGGTGTTGACAGCCTAGGAGTGGAACTGCTGGATCAC AGAGGTGGCATATGTTCGGCTTCATTAGAAAACTGCCAGTTTTCCAAAATGTCTCTACCAATTTACACTC CCCCAGAAATACAAGAGAGGTCCAGTCGCTCTACTTTCTCGCCTCCACACGGTGCGGTCTTTTTCACTTT AGCCATTCTGGTGGTGGAGACCCACTCGTATTCGCAGCGCCTGGAGCGTAATTGGCACTCAGTTAACAAG ACTGTTGAATGAATGGATGACTGAGTAAGTTGGGCGGTGTAGACCAACAGCCTGGCGAGGGCGGACACAC GCACGCACTCCACACACAGCGTTTCGCGGACACCCACCGCGGCTCACGCAGCGCAGGACACAGACCCTGT CGCGCACCCCGCGCCCACGTGGTCTGAACACACGGCCTCGGCCCTGCCTCGCGCGTCCGGTCGCAACTCC CGCTCTCCGTCCCCAACTCGCGCGTCCGTCCCCAACTCCCGCTCTCGGCGGCGGGCAGGGGGCGCTGAGC GTCCAGGCGCTCCAAGGGGGCGGGCCCGGGTCGGGGCGGGGCCGGCCGGGCTTCCAGGCCTGGGCTCTGG CCGCCCGCGCCACCGGGCCGCTCCGGGGACAGGCCGGGGCGGGGCGCGGCGGCAGGAAACGGGGCGGGGA CTTGCGGAGGCGTTGGGGACGAGAGAGGGCGCGGCCAACTCCAGGGGGGACGGCAGGCCGAGAGCGCGGC GCCCGGGCCTGGCGCGGAGCCTGAGCCCGCCGGACGGGAGGCGGCCCCGCC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| BCL7C_1 ↗ | 16:30,894,019 | 負股 | 30,894,009–30,894,068 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR16_5997C5 · CTCF_binding_site · 30894063–30894084 · regulatory
ENSR16_B85JN · promoter · 30894067–30894792 · regulatory
ENSR16_9G94M · promoter · 30895206–30895706 · regulatory
ENSR16_B85JZ · promoter · 30896124–30896648 · regulatory
ENSR16_C53R3 · enhancer · 30896649–30897707 · regulatory
· motif · 30893062–30893077 · motif
· motif · 30893106–30893123 · motif
· motif · 30893133–30893146 · motif
· motif · 30893138–30893150 · motif
· motif · 30893140–30893147 · motif
· motif · 30893873–30893883 · motif
· motif · 30894065–30894081 · motif
· motif · 30894084–30894097 · motif
· motif · 30895130–30895139 · motif
· motif · 30895747–30895756 · motif
· motif · 30896565–30896575 · motif
· motif · 30896606–30896616 · motif
· motif · 30897046–30897055 · motif
· motif · 30897120–30897130 · motif
· motif · 30897125–30897135 · motif
· motif · 30897131–30897141 · motif
· motif · 30897244–30897255 · motif
· motif · 30897378–30897393 · motif
· motif · 30897533–30897546 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:217 aa
BCL7C 屬於 BCL7 family,蛋白質長度為 217 個胺基酸。序列註解指出,第 49 至 217 位胺基酸區域為無序區;此區域的判定來自序列分析註解。
蛋白質三維結構
細胞內定位
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- SCINQ9Y6U3 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | BCL7C 可能具有抑制細胞凋亡的作用,但此功能描述保留不確定性;資料未提供具體機制、作用條件或實驗結果,因此不能進一步確定其影響方式。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
GAGAGAGGGCGCGGCCAACTCCAGGGGGGACGGCAGGCCG40AGAGCGCGGCGCCCGGGCCTGGCGCGGAGCCTGAGCCCGC80CGGACGGGAGGCGGCCCCGCCGCGGGCTCGGCCCCGGCCC120CAGCCCCGCCAGCATGGCCGGCCGGACTGTACGGGCCGAG160ACCCGGAGCCGGGCCAAGGATGACATCAAGAAGGTGATGG200CGACCATCGAGAAGGTCCGGAGATGGGAGAAGCGATGGGT240GACTGTGGGCGACACTTCCCTTCGTATCTTCAAGTGGGTG280CCAGTGGTGGATCCCCAGGAGGAGGAGCGAAGGCGGGCAG320GTGGCGGGGCAGAGAGATCCCGTGGCCGGGAACGTCGGGG360CAGGGGCGCCAGTCCCCGAGGGGGTGGCCCTCTCATCCTG400CTGGATCTTAATGATGAGAACAGCAACCAGAGTTTCCATT440CGGAAGGTTCCCTGCAAAAGGGCACAGAGCCCAGTCCTGG480GGGCACCCCCCAGCCCAGCCGCCCTGTGTCACCTGCCGGA520CCCCCAGAAGGGGTCCCTGAGGAGGCTCAGCCCCCACGGC560TGGGCCAAGAGAGAGATCCCGGGGGCATAACTGCTGGCAG600CACCGACGAACCCCCAATGCTGACCAAGGAGGAGCCTGTT640CCAGAACTGCTGGAAGCTGAGGCCCCCGAAGCTTACCCTG680TCTTTGAGCCAGTGCCACCTGTCCCTGAGGCAGCCCAGGG720TGACACAGAGGACTCGGAGGGTGCCCCCCCACTCAAGCGC760ATCTGCCCAAATGCCCCTGACCCCTGAGAAGCCGGCCTGC800CTGTCCTGTTGCCCCAGGGGCCCCTTTGGCTTTTTACAAA840TAAAGACCCTTTTGTAA857cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。