基因總覽
BCL6B 的正式名稱為 BCL6B transcription repressor，屬於蛋白質編碼基因。其產物可與 BCL6 相關聯，並具有轉錄抑制作用。現有資料指出，這項作用可能集中於特定狹窄階段，或與早期 B 細胞發育中的部分事件有關；目前資訊未進一步界定其作用階段或相關事件。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000293805 ★ | 7,023,050–7,029,644 | 9 |
| ENST00000896964 | 7,023,050–7,029,644 | 9 |
| ENST00000896967 | 7,023,096–7,029,644 | 9 |
| ENST00000576705 | 7,023,102–7,024,304 | 3 |
| ENST00000573503 | 7,023,477–7,024,237 | 2 |
| ENST00000537931 | 7,026,501–7,030,290 | 4 |
顯示 6/6 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
BCL6B transcription repressor 與 BCL6 相關聯時，可作為序列特異性轉錄抑制因子。這表示其抑制作用具有序列選擇性，但現有資料未說明受抑制的具體基因或 DNA 序列，也未提供其如何執行抑制的細節。
此蛋白質的作用可能限於某個狹窄的發育階段，也可能與早期 B 細胞發育中的部分事件相關。來源以可能性描述這些關聯，未確定作用發生的具體時期，亦未指出涉及哪些發育事件。因此，現有資訊支持其具有轉錄抑制角色，並提示其可能參與早期 B 細胞發育，但不足以界定更細緻的生物學機制或影響。
Promoter 與基因調控
>BCL6B ENST00000293805 GRCh38 chr17:7022050-7023150 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AGGTTTCAGCCGCCCAGACCAAATGGATCCTGCGCCCGGGTCTGAGCGCACCCCAGGCCGGGTGGAGACG AGGGGCGAGGCGAGGCCAGTGCTCGGCCGCCCCCTCGTGGAAGGAGCCGCACATTGCCGAGCCTTGCCTA CTTGCCGCGCTGGACCCCGGCGTCCCGCCAGCCTCCAAGCGTAGCCGACGGGCGGGTGCCCGAGGCCCTC GTGAGCTGGGATTGGGGGAAAGCAAGCGGGCTTTGGGCGGGAGTCCATCTCTCTGGATCCCTACAAGGAC CCAGAAGAGAGTCGGGAGCGAGAGAGGCCGGACGCCTAGGTCTCCCGAGCGTCTCTCGCCCCTCCACCCC CACCTCGGGGCTTTCCCCACCTCCTCGAGGGGAAGCAGCTGGCGGAGCCGTCCGGTCGCAGGACAATGGA AGGAAACCAACTAGAAATCATATCCGCCCTCTCCGTACCCCGCCCGGCCAGAGCCCCCCTTTTTGTAGGC CCGGGTAGAGTAGCCTGTCATTCACACCACACCCTCCCCGTCTGAGACCCTACGGGAGCCCACTGTCGTC TGCCCAAACCTGCTGTCTCGTTGGGCTCCCCCTTTTCTCCCTTAACACAGTACAAGAGAGGGAGAGGGGG TTGCCGTATGCACTTTGTCCTGCAGCAAAGGTTGGCTCCTGGCAAACCCTCCCAAAAGCCAACACACCAA TTTTCACTGGCCCAGGCCTTCCGACGACTCAGACTCCCGTATTGCCAACCTCGATATCCCTAACCTCCTC CCCAATTCCAATATCCCCGTCCTCGTGTCCACTTGCAGTGACCCAAGACCCCCTACGTTACGACCACCCC TTGTTTCTGAGGTCCCGCCCTCGAGACGGAGACCCCGCCCTGGACTCGCCATCTGGAGAGCGAGGGAGGA AGGAAGGATACAGACCCAGGCGTTCACCCCACCTCCACCCCCGCCCCCGACATCCCGGCCAGATAAAGGA GCCGAGGCCAAGAGGGGAGAGAGACCCCGCCCCCCTTAAGAAGAGAAGCCGCGGCCCCTGCAGGACGGGG GTAAGAACAAGAGACTGAGGGAGCCAGACTCCTGGGTCCCCCAAGAGGGTA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| BCL6B_1 ↗ | 17:7,023,051 | 正股 | 7,023,002–7,023,061 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR17_B3DLC · enhancer · 7017829–7018365 · regulatory
ENSR17_7F5TJ · enhancer · 7018677–7018776 · regulatory
ENSR17_B3DLM · promoter · 7019634–7020442 · regulatory
ENSR17_B3DLT · enhancer · 7021302–7022058 · regulatory
ENSR17_B3DLZ · promoter · 7022059–7023060 · regulatory
ENSR17_53ML3Z · CTCF_binding_site · 7022143–7022164 · regulatory
ENSR17_53MLFN · CTCF_binding_site · 7024241–7024262 · regulatory
· motif · 7021660–7021672 · motif
· motif · 7021910–7021922 · motif
· motif · 7022013–7022028 · motif
· motif · 7022145–7022161 · motif
· motif · 7022270–7022281 · motif
· motif · 7022292–7022303 · motif
· motif · 7022392–7022402 · motif
· motif · 7022565–7022575 · motif
· motif · 7022686–7022701 · motif
· motif · 7022686–7022701 · motif
· motif · 7022687–7022701 · motif
· motif · 7022688–7022701 · motif
· motif · 7023763–7023774 · motif
· motif · 7023763–7023774 · motif
· motif · 7023782–7023795 · motif
· motif · 7023782–7023795 · motif
· motif · 7024026–7024037 · motif
· motif · 7024243–7024259 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：479 aa
BCL6B transcription repressor 長 479 個胺基酸。其 BTB domain 位於第 38–105 個胺基酸；C 端區域含五個 C2H2-type zinc finger，分別位於第 328–350、356–378、384–406、412–434 與 440–463 個胺基酸。另有兩段標註為無序區，位於第 143–190 與 210–259 個胺基酸。
蛋白質三維結構
細胞內定位
BCL6B transcription repressor 的定位記錄為細胞核。 現有資料未提供其定位變化的條件、動態或異構型差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- SULT4A1Q9BR01 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
BCL6B transcription repressor 透過 BTB domain 與 BCL6 結合。資料描述的是兩者的關聯，未進一步列出複合體組成或其他功能性互作。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | BCL6B 與 BCL6 相關聯時，可作為具有序列特異性的轉錄抑制因子。其作用可能限於某個狹窄階段，或與早期 B 細胞發育中的部分事件有關；來源未確定具體階段或事件。 | 含實驗來源 | 證據與來源Acts as a sequence-specific transcriptional repressor in association with BCL6. May function in a narrow stage or be related to some events in the early B-cell development PMID 11855826 ↗ |
| 交互作用 | BCL6B 透過 BTB domain 與 BCL6 結合；來源未提供其他複合體組成或互作資訊。 | 推論支持 | |
| 細胞定位 | BCL6B 的細胞定位記錄為細胞核。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
GAGACCCCGCCCCCCTTAAGAAGAGAAGCCGCGGCCCCTG40CAGGACGGGGGCCTGTGTCGCTATGGGTTCCCCCGCCGCC80CCGGAGGGAGCGCTGGGCTACGTCCGCGAGTTCACTCGCC120ACTCCTCCGACGTGCTGGGCAACCTCAACGAGCTGCGCCT160GCGCGGGATCCTCACTGACGTCACGCTGCTGGTTGGCGGG200CAACCCCTCAGAGCACACAAGGCAGTTCTCATCGCCTGCA240GTGGCTTCTTCTATTCAATTTTCCGGGGCCGTGCGGGAGT280CGGGGTGGACGTGCTCTCTCTGCCCGGGGGTCCCGAAGCG320AGAGGCTTCGCCCCTCTATTGGACTTCATGTACACTTCGC360GCCTGCGCCTCTCTCCAGCCACTGCACCAGCAGTCCTAGC400GGCCGCCACCTATTTGCAGATGGAGCACGTGGTCCAGGCA440TGCCACCGCTTCATCCAGGCCAGCTATGAACCTCTGGGCA480TCTCCCTGCGCCCCCTGGAAGCAGAACCCCCAACACCCCC520AACGGCCCCTCCACCAGGTAGTCCCAGGCGCTCCGAAGGA560CACCCAGACCCACCTACTGAATCTCGAAGCTGCAGTCAAG600GCCCCCCCAGTCCAGCCAGCCCTGACCCCAAGGCCTGCAA640CTGGAAAAAGTACAAGTACATCGTGCTAAACTCTCAGGCC680TCCCAAGCAGGGAGCCTGGTCGGGGAGAGAAGTTCTGGTC720AACCTTGCCCCCAAGCCAGGCTCCCCAGTGGAGACGAGGC760CTCCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGTGAAGAA800GGACCCATTCCTGGTCCCCAGAGCAGGCTCTCTCCAACTG840CTGCCACTGTGCAGTTCAAATGTGGGGCTCCAGCCAGTAC880CCCCTACCTCCTCACATCCCAGGCTCAAGACACCTCTGGA920TCACCCTCTGAACGGGCTCGTCCACTACCGGGAAGTGAAT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。