演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ACSM3SA

acyl-CoA synthetase medium chain family member 3

ACSM3(acyl-CoA synthetase medium chain family member 3)是粒線體中的脂肪酸活化酵素,參與脂肪酸代謝的起始步驟,並可作用於中鏈脂肪酸。

Homo sapiens16p12.3UniProt Q53FZ2
OFFICIAL SYMBOL
ACSM3
CHROMOSOME
16
UNIPROT
Q53FZ2
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ACSM3 是蛋白質編碼基因,產物屬於 ATP 依賴型 AMP-binding enzyme 家族。其蛋白質名稱為 acyl-CoA synthetase medium chain family member 3,位於粒線體。此酵素家族的名稱反映其催化作用涉及 ATP 與 AMP;ACSM3 的產物則在脂肪酸代謝中負責將脂肪酸轉成 acyl-CoA。來源指出它能活化中鏈脂肪酸,並對碳數為 2 至 6 的脂肪酸中的 isobutyrate 有偏好;此偏好為依相似性推定。蛋白質序列含有粒線體轉運胜肽,顯示其具有送往粒線體的序列特徵。

Official symbol
ACSM3
Gene name
acyl-CoA synthetase medium chain family member 3
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10522
UniProt
Q53FZ2
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
SASAH

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1616p12.3
chr16 · 90,338,345 bp · GRCh38chr16p13.3 · 1–7800000 · gnegchr16p13.2 · 7800001–10400000 · gpos50chr16p13.13 · 10400001–12500000 · gnegchr16p13.12 · 12500001–14700000 · gpos50chr16p13.11 · 14700001–16700000 · gnegchr16p12.3 · 16700001–21200000 · gpos50chr16p12.2 · 21200001–24200000 · gnegchr16p12.1 · 24200001–28500000 · gpos50chr16p11.2 · 28500001–35300000 · gnegchr16p11.1 · 35300001–36800000 · acenchr16q11.1 · 36800001–38400000 · acenchr16q11.2 · 38400001–47000000 · gvarchr16q12.1 · 47000001–52600000 · gnegchr16q12.2 · 52600001–56000000 · gpos50chr16q13 · 56000001–57300000 · gnegchr16q21 · 57300001–66600000 · gpos100chr16q22.1 · 66600001–70800000 · gnegchr16q22.2 · 70800001–72800000 · gpos50chr16q22.3 · 72800001–74100000 · gnegchr16q23.1 · 74100001–79200000 · gpos75chr16q23.2 · 79200001–81600000 · gnegchr16q23.3 · 81600001–84100000 · gpos50chr16q24.1 · 84100001–87000000 · gnegchr16q24.2 · 87000001–88700000 · gpos25chr16q24.3 · 88700001–90338345 · gnegACSM3pq1 bp90,338,345 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr16:20,610,243–20,797,843
Gene span
187,601 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000289416 ★20,764,014–20,797,58114
ENST0000056823520,610,243–20,775,9205
ENST0000088787220,674,387–20,797,84318
ENST0000088787320,674,387–20,797,84317
ENST0000096644220,674,387–20,797,84318
ENST0000096644320,674,387–20,797,84318
ENST0000096644420,674,387–20,797,84312
ENST0000096644520,674,387–20,797,84321
ENST0000096644620,674,387–20,797,84320
ENST0000096644720,674,387–20,797,84318
ENST0000096644820,674,387–20,797,84319
ENST0000096644920,674,387–20,797,84317

顯示 12/55 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ACSM3 催化脂肪酸與 CoA 結合,生成 acyl-CoA;這是脂肪酸代謝的第一步。反應需要 ATP,產物除 acyl-CoA 外,還包括 AMP 與焦磷酸。藉由這項活化反應,脂肪酸轉成 acyl-CoA 形式,進入後續脂肪酸代謝流程。

其底物包括中鏈脂肪酸。來源列出的反應涵蓋 propanoate、butanoate、2-methylpropanoate、2-methylbutanoate 及 octanoate,分別生成對應的 acyl-CoA,並伴隨 AMP 與焦磷酸生成。這些反應的證據並不完全相同:部分反應有直接研究支持,另一些則依相似性註解,因此不宜將所有列出的底物都視為同等程度的實驗確認。

依相似性推定,ACSM3 也能活化碳數為 2 至 6 的脂肪酸,且在這些脂肪酸中偏好 isobutyrate。這項偏好描述的是底物範圍內的相對選擇性,來源未提供其作用效率或比較數值。整體來說,ACSM3 透過將脂肪酸轉為 acyl-CoA,執行脂肪酸代謝起始所需的活化步驟。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 20764014 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ACSM3 ENST00000289416 GRCh38 chr16:20763014-20764114 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GAAAATCCCAAGGAATCAACAACAAAAGACTCCTAGAACTCAAAAGTGACCAACAAATTCCTCTTTAAGT
AAAGTTGGGTCTCTCACATGTAATTGAAAGAGTCCTTTATTTATTCACATATCCATCAACTATTTATTGA
ATGCCTAAAATTTGCCAGTAGCTATTCCAGGCAATAGATACACCATCAAACAAAAAGAGTTCTTACCCTC
AAGGGTGATAGTAAGAGATGTAAAAAGTTAAAAAATGGTAAAAGAGAAAAAATGAAGAGTGCTACTTTAG
AAAATGAGGTAAGGGAAGAGTTATTTAATAAGACACCTCAGAAAATGAGGAATTTGGCCAGGGGGATATC
TGAGGAAAGAGTTCCAGTCAGTGGAAACTGTGAATTCAGAAAGCCTGAGGCTGAAACAGGCAAGTGTGTT
TGAGAAAAAGCAAGGAGGCCGGTGGCTGTGCAGAGTGAGGCAGAGGAAGGAGAATGGGCTGTGGATCAGA
GGACCCTGTGCCAGATCATACAACTCCTTGCAGTTCATGTAAGGACTCGGATTTTACCTGGAGTGGAAAA
AGAAGCACTGAAAGATTTGAGCAGGGGAGTAACCTGATAGCGTTTATGTTTAGTCCTGCCACTTCGACAG
ATAAACGCACCAATGGGCTTGATGAGATTTAGGCCAACCCATAACCGCCCCTCAACTTCTTTCCTTTCAA
TTTCAAAACTCCTCTATGGCTTCCTCCATCTGTTCTTCCTTCTGAGAAGTGCTCTCTCTGCCCCTTTACA
GAACTAACCACTTCGGCAACTCCTTGGACACTTTCCTTCTTGTTAATAATTTGCTTTCTCCGCCCCTCAA
AAGCTTGCTGTTTCTGTAAATCATTACCTGTAAGAGGAACCGCTGGGAGTCCTGTAAACTTTAGCCCAGA
GCTTGGCTCCTCCTCCAGAATGTCTCCACCAATCAAGGAAAGTGTTTTGGGCCAGTCTTGCTCCTCCGGA
TTGTCAGACTGCTCCTCCCTCTTCTTTAGACTGCCACGAGGAAAAAGCAGATGTGAGAACTCAAGGTTCA
GGGCTGCTCTTCTAAGAAACAAGTCTGCCATAATCTCCATCTGTGTTGGAA
ACSM3 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ACSM3_1 ↗16:20,674,500正股20,674,451–20,674,510
ACSM3_3 ↗16:20,763,706正股20,763,657–20,763,716
ACSM3_2 ↗16:20,764,014正股20,763,965–20,764,024

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR16_B6592 · promoter · 20763524–20764050 · regulatory

ENSR16_9B8J6 · enhancer · 20764051–20764346 · regulatory

· motif · 20763908–20763921 · motif

· motif · 20764035–20764048 · motif

· motif · 20765910–20765919 · motif

· motif · 20765910–20765919 · motif

· motif · 20767762–20767775 · motif

· motif · 20767762–20767776 · motif

· motif · 20767762–20767777 · motif

· motif · 20767822–20767837 · motif

· motif · 20767823–20767837 · motif

· motif · 20767824–20767837 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:586 aa

1 aa586 aa轉運胜肽
依 Q53FZ2 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ACSM3 蛋白質長 586 個胺基酸,屬於 ATP-dependent AMP-binding enzyme 家族。其序列第 1 至第 27 位為粒線體轉運胜肽,這項序列註解指向蛋白質送往粒線體的特徵。

轉運胜肽Mitochondrion1–27 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q53FZ2…

AlphaFold · Q53FZ2

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Mitochondrion;Mitochondrion matrix

ACSM3 定位於粒線體,並記錄於粒線體基質。 來源未提供定位隨條件改變或異構型差異的資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
SAACSM3KLK6
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

8 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 8 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ACSM3 催化脂肪酸與 CoA 結合生成 acyl-CoA,這是脂肪酸代謝的第一步。它能活化中鏈脂肪酸;依相似性推定,在碳數為 2 至 6 的脂肪酸中偏好 isobutyrate。含實驗來源
證據與來源

Catalyzes the activation of fatty acids by CoA to produce an acyl-CoA, the first step in fatty acid metabolism. Capable of activating medium-chain fatty acids with a preference for isobutyrate among fatty acids with 2-6 carbon atoms (By similarity)

PMID 11772874 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性a medium-chain fatty acid + ATP + CoA = a medium-chain fatty acyl-CoA + AMP + diphosphate含實驗來源
證據與來源

a medium-chain fatty acid + ATP + CoA = a medium-chain fatty acyl-CoA + AMP + diphosphate

PMID 11772874 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性propanoate + ATP + CoA = propanoyl-CoA + AMP + diphosphate推論支持
證據與來源

propanoate + ATP + CoA = propanoyl-CoA + AMP + diphosphate

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性butanoate + ATP + CoA = butanoyl-CoA + AMP + diphosphate推論支持
證據與來源

butanoate + ATP + CoA = butanoyl-CoA + AMP + diphosphate

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性2-methylpropanoate + ATP + CoA = 2-methylpropanoyl-CoA + AMP + diphosphate推論支持
證據與來源

2-methylpropanoate + ATP + CoA = 2-methylpropanoyl-CoA + AMP + diphosphate

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性2-methylbutanoate + ATP + CoA = 2-methylbutanoyl-CoA + AMP + diphosphate推論支持
證據與來源

2-methylbutanoate + ATP + CoA = 2-methylbutanoyl-CoA + AMP + diphosphate

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性octanoate + ATP + CoA = octanoyl-CoA + AMP + diphosphate含實驗來源
證據與來源

octanoate + ATP + CoA = octanoyl-CoA + AMP + diphosphate

PMID 11772874 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ACSM3 位於粒線體,並定位於粒線體基質。含實驗來源
證據與來源

Mitochondrion; Mitochondrion matrix

PMID 11772874 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 8 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000289416 · 2,533 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1CTTCTTTAGACTGCCACGAGGAAAAAGCAGATGTGAGAAC40
41TCAAGGTTCAGGGCTGCTCTTCTAAGAAACAAGTCTGCCA80
81TAATCTCCATCTGTGTTGGAATCTGTTAACTAATGAACTG120
121GTCTCTGTGCAAATCCTGAGTGCTAAAGCTTCCAACAAGA160
161CTGATGCTAGCTCGTGTCACCAGGAAGATGCTACGTCATG200
201CCAAGTGTTTTCAGCGCCTAGCAATTTTTGGTTCTGTGAG240
241GGCACTGCATAAAGATAATAGAACAGCAACCCCTCAGAAT280
281TTCTCCAACTATGAATCCATGAAACAGGACTTCAAACTGG320
321GGATTCCAGAGTATTTCAACTTTGCTAAAGATGTCCTGGA360
361CCAATGGACTGATAAGGAAAAGGCTGGAAAGAAACCTTCA400
401AATCCAGCCTTCTGGTGGATCAACAGAAATGGAGAAGAGA440
441TGCGATGGAGTTTTGAGGAACTGGGATCTCTGTCCAGAAA480
481ATTTGCCAATATACTTTCAGAAGCCTGTTCCCTACAAAGA520
521GGAGATCGGGTAATTCTGATTCTGCCCAGGGTCCCAGAGT560
561GGTGGCTTGCAAATGTGGCCTGTCTGCGAACAGGGACAGT600
601TTTAATTCCAGGAACCACTCAGCTGACCCAGAAAGACATT640
641CTCTACAGACTACAATCTTCAAAAGCAAACTGCATTATCA680
681CCAATGATGTTTTAGCCCCAGCAGTAGACGCTGTTGCATC720
721CAAATGTGAAAATCTGCACTCCAAGCTGATTGTATCAGAG760
761AACTCCAGAGAGGGGTGGGGGAACCTCAAGGAGTTGATGA800
801AACATGCCAGTGACAGCCACACCTGTGTGAAGACAAAACA840
841CAATGAGATCATGGCCATATTCTTTACCAGTGGAACAAGT880
881GGATATCCGAAAATGACTGCACACACCCACAGCAGTTTTG920
921GTTTAGGATTATCTGTAAATGGAAGGTTCTGGCTAGATTT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。